New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 228022 | NA (NA) | 25 (0.190) | 7/164 | NT | NA | noncoding (2264/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon |
? | NC_000913 | = 228033 | NA (NA) | noncoding (2275/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon |
Only 100 of 196 total aligned reads displayed.
GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/227917‑228022 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctcctccGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGG < NC_000913/228033‑227935 GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTC > 2:3204184/1‑100 GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTC < 2:3555491/100‑1 GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTC < 2:2028629/100‑1 GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTC > 1:2035723/1‑100 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GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCC < 1:2179648/100‑1 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCC < 1:2493593/100‑1 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAATGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCC < 2:2589566/100‑1 ACCTTGAAATACCACCGTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCT < 2:804566/100‑1 ACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGATCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCT < 1:2325298/100‑1 ACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCTGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCC < 1:1166760/99‑1 ACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCat > 2:2375003/1‑98 ACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCT < 2:3420777/100‑1 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CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCC > 2:1864738/1‑100 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCC < 1:3329719/100‑1 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCC > 2:701421/1‑100 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCC < 2:2548618/100‑1 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCC > 2:524241/1‑100 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCC < 1:2759695/100‑1 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCC < 2:2702804/100‑1 TTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCC < 2:2287373/99‑1 TTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCC < 1:922342/99‑1 TTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTAACACGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCC < 1:1090687/99‑1 CTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCGTTACTCTTTAGGA < 1:1429716/100‑1 TGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTTACTGGGGCGGTCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGAC < 2:3719424/100‑1 TGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCTGTTACTCTTTAGGAGGAGAC < 2:2494649/100‑1 TGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGAC < 1:614938/100‑1 TGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGAC < 1:1099700/100‑1 TGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGAC < 1:1557388/100‑1 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |