| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 228219 = | NA (NA) | 11 (0.080) | 7/166 | NT | NA | noncoding (2461/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon |
| ? | NC_000913 | 228248 = | NA (NA) | noncoding (2490/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon | |||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
TTAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/228323‑228219‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcggtGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGGTTTAG > NC_000913/228248‑228346 TTAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGATCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGG < 1:1277157/100‑1TTAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGG < 2:1352923/100‑1TTAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGG > 2:2077319/1‑100 TAAATGGCGAACAGCCATACTCTTTGTACTTACTTCAGTCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG < 1:218082/100‑1 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG < 1:2173031/100‑1 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG < 1:3850867/100‑1 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG < 2:3492897/100‑1 AAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGC > 1:3747415/1‑100 AAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGC < 2:348591/100‑1 AAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGC < 1:182785/100‑1 AAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGC < 1:998766/100‑1 AAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGC > 2:3419268/1‑100 AAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGAGATGAGCCGACACCGCGGAGACAAACACCGCCGACGATATGAACTCTTGGGC > 1:1898468/1‑100 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG > 2:855747/1‑100 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG < 1:1728507/100‑1 ATGGCTAACTGTCATACCTTTTGTACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 1:2720195/100‑1 ATGGCTAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG < 1:1880001/99‑1 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGCCATCGAGGTGCAAAACACCGCCGTCGATATGAACCCTTAGGCGG > 2:3609095/1‑100 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACATCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 1:2375560/100‑1 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG > 2:1790365/1‑100 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 1:2552425/100‑1 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 1:1332422/100‑1 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 1:1190215/100‑1 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG > 2:1217612/1‑100 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 1:3207751/100‑1 ttgcaAACAACCATACCCTTGCGACCTACTTCATCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAAGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGGGG < 1:137204/94‑1 TGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGT < 1:2164527/100‑1 TGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGT > 2:705409/1‑100 TGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG > 2:1198575/1‑99 GCGAACAGCCATACCCTTGTGACCTACTTCAACCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 2:269491/97‑1 AGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCACCTCGATATCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTC > 1:274790/1‑100 TGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCT > 1:297016/1‑100 CCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTTAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGT > 2:2911558/1‑100 CCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGT > 2:1045755/1‑100 CAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTT > 1:407826/1‑100 CAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGT > 1:757316/1‑99 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GGCGGTGTTTTGCACTTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 2:1707929/100‑1 GGCGGTGTTTGTCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 2:2221864/100‑1 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 2:130195/100‑1 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 2:1505522/100‑1 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 2:1592327/100‑1 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 2:3022229/100‑1 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 2:272847/100‑1 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 1:302673/100‑1 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TTAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/228323‑228219‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcggtGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGGTTTAG > NC_000913/228248‑228346 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |