| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 343971 = | 85 (0.610) | 17 (0.140) | 10/158 | NT | 17.3% | intergenic (+38/‑205) | yahK/yahL | broad specificity NADPH‑dependent aldehyde reductase, Zn‑containing/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | 344009 = | 87 (0.700) | intergenic (+76/‑167) | yahK/yahL | broad specificity NADPH‑dependent aldehyde reductase, Zn‑containing/uncharacterized protein | |||||
TGTGTACTGGAGGGCGTTAATTTAACAATTTAAATTTACGTTATAGGTTTTACTGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/344078‑343971‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggagagcgaa‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACGTTAGTTATGAGCGAT > NC_000913/344009‑344105 TGTGTACTGGAGGGCGTTAATTTAACAATTTAAATTTACGTTATAGGTTTTACTGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGG < 1:750048/100‑1TGTGTACTGGAGGGCGTTAATTTAACAATTTAAATTTACGTTATAGGTTTTACTGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGG < 1:1493897/100‑1TGTGTACTGGAGGGCGTTAATTTAACAATTTAAATTTACGTTATAGGTTTTACTGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGG < 1:893308/100‑1TGTGTACTGGAGGGCGTTAATTTAACAATTTAAATTTACGTTATAGGTTTTACTGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTG > 2:3657005/1‑99TGTGTACTGGAGGGCGTTAATTTAACAATTTAAATTTACGTAATAGGTTTTACTGCTACTTGGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTG > 2:2133831/1‑99 GTGTACTGGAGGGCGTTAATTTAACAATTTAAATTTACGTTATAGGTTTTACTGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGA > 1:1769/1‑100 GTACTGGAGGGCGTTAATTTAACAATTTAAATTTACGTTATAGGTTTTACTGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGA > 2:2331134/1‑100 TACTGGAGGGCGTTAATTTAACAATTTAAATTTACGTTATAGGTTTTACTGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAG < 1:2331156/100‑1 TACTGGAGGGCGTTAATTTAACAATTTAAATATACGTTATAGGTTTTACTGCTACTTTGATATTATTTTGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGA < 2:144512/99‑1 ACTGGAGGGCGTTAATTTAACAATTTTAATTTACGTTATAGGTTTTACTGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGC < 1:687350/100‑1 ACTGGAGGGCGTTAATTTAACAATTTATATTTACGTTATAGGTTGTACTGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGC < 2:1932641/100‑1 ACTGGAGGGCGTTAATTTAACAATTTAAATTTACGTTATAGGTTTTACTGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAG > 1:828579/1‑99 CTGGAGGGCTTTAATTTAACAATTTAAATTTACGTTATAGGTTTTACTGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGC < 2:1275713/99‑1 CTGGAGGGCGTTAATTTAACAATTTAAATTTACGTTATAGGTTTTACTGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCG > 2:2466414/1‑100 TGGAGGGCGTTAATTTAACAATTTAAATTTACGTTATAGGTTTTACTGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCG > 2:2384448/1‑99 TGGAGGGCGTTAATTTAACAATTTAAATTTACGTTATAGGTTTTACTGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGC < 1:2348068/98‑1 GGAGGGCGTTAATTTAACAATTTAAATTTACGTTATAGGTTTTACTGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA > 1:497147/1‑100 TTTTACTGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTT > 1:1051807/1‑100 TGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAAGTTAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATT > 2:3886727/1‑100 GATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAA > 1:226369/1‑100 TTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTC > 2:2197592/1‑100 TTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCC > 2:3267309/1‑97 TTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCC > 1:693360/1‑100 TCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCA > 2:1087341/1‑100 TCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCA > 2:735381/1‑100 CGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAG > 2:717858/1‑100 GCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGT > 1:3855757/1‑100 GCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGT > 1:1398580/1‑100 GCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTG‑‑GAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTAC > 1:2405545/1‑100 GCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGT‑‑AGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAAAGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTA > 1:1315927/1‑99 CTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTTTTAAATTAACGCCCTCCAGTA > 1:976842/1‑100 CTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTA > 1:3474681/1‑100 CCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACA > 2:3577093/1‑100 CCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACA > 2:3831604/1‑100 GGAGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAATACACAATACTTCACACGTTAGTTAT > 1:2483/1‑100 AGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAAAGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACGTTAGTTATGA > 2:2479498/1‑100 GAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACGTTAGTTATGAG > 2:2799007/1‑100 GAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACGTTAGTTATGAG < 1:1478988/100‑1 GCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACGTTAGTTATGAGCG > 2:2306868/1‑100 GCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACGTTAGTTATGAGCG > 2:231304/1‑100 GCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACGTTAGTTATGAGCG > 1:2832077/1‑100 GCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACGTTAGTTATGAGCG > 2:421650/1‑100 GCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACGTTAGTTATGAGCG > 1:2119923/1‑100 GAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACGTTAGTTATGAGCGAT > 2:1450171/1‑100 GAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACGTTAGTTATGAGCGAT > 1:3213893/1‑100 GAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAAACTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCACTCCAATACACAATACTTCACACGATAGTTATGAGCGA > 2:1001013/1‑99 TGTGTACTGGAGGGCGTTAATTTAACAATTTAAATTTACGTTATAGGTTTTACTGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/344078‑343971‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggagagcgaa‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACGTTAGTTATGAGCGAT > NC_000913/344009‑344105 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |