New junction evidence
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*	?	NC_000913	= 16653	NA (NA)	17 (0.130)	8/164	NT	NA	noncoding (1267/1345 nt)	IS186	repeat region
	?	NC_000913	= 16691	NA (NA)					noncoding (1305/1345 nt)	IS186	repeat region

TACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTCCCCGCCGTTGCTCTT  >  NC_000913/16634‑16752                    |                                                                                                    tACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATc                     <  2:973339/100‑1 (MQ=11) tACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATc                     <  1:3377202/100‑1 (MQ=11) tACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTAAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATc                     >  1:1649632/1‑100 (MQ=11)   cAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCAc                   >  2:3007768/1‑100 (MQ=32)     aaaCGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGCTGGTTAAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTc                 >  2:2635376/1‑100 (MQ=255)     aaaCGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTc                 >  2:3264976/1‑100 (MQ=35)       aCGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTccc               >  2:3507494/1‑100 (MQ=38)       aCGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTccc               >  1:1062534/1‑100 (MQ=38)        cGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTcccc              >  1:585212/1‑100 (MQ=38)         gCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTcacc              >  2:748450/1‑99 (MQ=25)         gCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTCCccg             <  1:2587542/100‑1 (MQ=38)            aTTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTCCccgccg          >  2:2143939/1‑100 (MQ=255)             ttGAAGAACGGGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTCCCCGCCGt         <  2:3688323/100‑1 (MQ=255)             ttGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGTCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTCCCCGCCGt         <  1:1515047/100‑1 (MQ=255)             ttGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCATATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTCCCCGCCGt         <  2:2163923/100‑1 (MQ=255)              tGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTCCCCGCCGtt        >  1:1109552/1‑100 (MQ=255)               gaagaaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTACTcccataagcgc       <  2:2832286/100‑9 (MQ=11)               gaagaaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTCCCCGCCGTTg       >  1:3397833/1‑100 (MQ=255)               gaagaaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTCCCCGCCGTTg       <  2:3769077/100‑1 (MQ=255)               gaagaaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTCCCCGCCGTTg       <  1:3420422/100‑1 (MQ=255)                aagaaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTCCCCGCCGTTGc      >  2:1483768/1‑100 (MQ=255)                 agaaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTCCCCGCCGTTGct     >  2:1888043/1‑100 (MQ=255)                 agaaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTCCCCGCCGTTGct     >  2:673181/1‑100 (MQ=255)                 agaaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCACTTATGGGATCACTCCCCGCCGTTGct     >  2:1771508/1‑100 (MQ=255)                 agaaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAAGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGAGCTTATGGGATCACTCCCCGCCCTTGct     >  2:539188/1‑100 (MQ=255)                  ggaCGCGAGGCATGGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTCCCCGCCGTTGctc    >  1:2639557/3‑100 (MQ=255)                  gaaCGCGAGGCATTGTCTTAACGAGGTACCGAGGCGTCGCATTCTTAAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTCCCCGCCGTTGctc    <  1:1334702/100‑1 (MQ=255)                  gaaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTTTTCGGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTCCCCGCCGTTGctc    <  2:286081/100‑1 (MQ=255)                  gaaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTCCCCGCCGTTGctc    <  2:2606359/100‑1 (MQ=255)                   aaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTCCCCGCCGTTGctct   <  1:1344471/100‑1 (MQ=255)                   aaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTCCCCGCCGTTGctct   <  1:1318141/100‑1 (MQ=255)                   aaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTCCCCGCCGTTGctct   <  2:585205/100‑1 (MQ=255)                    aCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGTGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTCCCCGCCGTTGCTCtt  >  1:1452249/1‑100 (MQ=255)                    aCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTCCCCGCCGTTGCTCtt  >  2:1726554/1‑100 (MQ=255)                    aCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTCCCCGCCGTTGCTCtt  >  2:2988335/1‑100 (MQ=255)                    aCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTCCCCGCCGTTGCTCtt  >  2:2338371/1‑100 (MQ=255)                    |                                                                                                    TACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATCACTCCCCGCCGTTGCTCTT  >  NC_000913/16634‑16752

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.