| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3621534 | NA (NA) | 5 (0.040) | 4/162 | NT | 100% | coding (2343/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 3621592 | 0 (0.000) | coding (2401/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
CAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCA > NC_000913/3621493‑3621691 | cagcaTGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTT < 2:1917081‑M2/100‑1 (MQ=255)cagcaTGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCATGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTT < 2:2522360‑M2/100‑1 (MQ=255) gCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatg < 1:1333467‑M2/100‑40 (MQ=255) cGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgc < 2:2377482‑M2/100‑41 (MQ=255) cGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTcgccagcacctgagcgatgtacgcatgtctggtctcatgc < 1:1464265‑M2/100‑41 (MQ=255) gAACCGCTGTATACCGGACAGCATGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTGcgccagcccctgagcgttgtacgcatgtgtggtcgcatgct < 2:535118‑M2/100‑42 (MQ=255) gTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagc < 1:763131‑M2/100‑50 (MQ=255) nagCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccg < 2:3416048‑M2/98‑92 (MQ=255) cAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccgg > 2:595168‑M2/1‑8 (MQ=255) cAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccgg < 2:2106356‑M2/100‑93 (MQ=255) cAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccgg < 2:1876031‑M2/100‑93 (MQ=255) cAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccgg < 1:3666273‑M2/100‑93 (MQ=255) cAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccgg > 1:2986798‑M2/1‑8 (MQ=255) cAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccgg < 1:2717835‑M2/100‑93 (MQ=255) cAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccg > 1:1641062‑M2/1‑8 (MQ=255) aGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgctgcaccgtctgacgctcaccgg > 2:2268816‑M2/1‑7 (MQ=255) aGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggt < 1:47376‑M2/100‑94 (MQ=255) aGCGGTTcgccagcacctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccgg > 2:1224730‑M2/1‑7 (MQ=255) gCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtc > 1:2673196‑M2/1‑6 (MQ=255) gCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtc < 1:2619747‑M2/100‑95 (MQ=255) gCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtc < 1:806599‑M2/100‑95 (MQ=255) gCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtc > 1:626682‑M2/1‑6 (MQ=255) gCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtc < 2:3746405‑M2/100‑95 (MQ=255) gCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtc > 1:1539254‑M2/1‑6 (MQ=255) ggTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcag > 1:2318589‑M2/1‑4 (MQ=255) ggTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcag < 2:2954390‑M2/100‑97 (MQ=255) ggTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcag < 1:1372765‑M2/100‑97 (MQ=255) ggTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgctgccgtctgcgtgtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcag > 2:344680‑M2/1‑4 (MQ=255) gTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgttgccagagcagtgcttccgtctgtgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcag > 2:2510434‑M2/1‑3 (MQ=255) tcgccagcccctgcgtgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccg > 1:2503535‑M2/1‑1 (MQ=255) tcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccg < 1:1915843‑M2/100‑100 (MQ=255) | CAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCA > NC_000913/3621493‑3621691 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |