| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4332016 = | NA (NA) | 14 (0.110) | 8/160 | NT | NA | noncoding (3/32 nt) | REP326 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP326 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
| ? | NC_000913 | 4332047 = | NA (NA) | intergenic (+43/‑69) | proP/pmrR | proline/glycine betaine transporter/putative membrane‑bound BasS regulator | |||||
Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
CCGATTTGCAGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTA > NC_000913/4331946‑4332146 | cactctcctccgttaacctggaggagagtatgcgcgtcagagattaagtgaaccttaagagttcaatTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAAt > 2:2065870‑M1/68‑100 (MQ=255) tttGCAGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAAt < 1:694841/99‑1 (MQ=255) ttGCAGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGTGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTg < 1:236254/100‑1 (MQ=255) ttGCAGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTg < 2:3302394/100‑1 (MQ=255) tctcctccgttaacctgtaggagagtatgcgcgttagagattaagtgaaccttaagagttcaatTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTg > 1:2681601‑M1/65‑99 (MQ=255) tGCAGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGa > 2:2833281/1‑100 (MQ=255) gtaGGCGAAACGGACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGaa > 1:2570510/3‑100 (MQ=255) gCAGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTGATCAGGCCAATTGaa > 1:3877452/1‑100 (MQ=255) tcctccgttaacctggaggagagtatgctcgtcagagattaagttaaccttaagagttaaatTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAAc > 1:155598‑M1/63‑100 (MQ=255) cAGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAAc < 1:1332845/100‑1 (MQ=255) cAGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAAc > 2:3865199/1‑100 (MQ=255) aGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAAc < 2:3494948/99‑1 (MQ=255) aGGCGAAACGTACCAGCCTGGTGCAGCAAGATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAAc < 2:2692808/99‑1 (MQ=255) gCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGTGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAAc < 2:1217166/97‑1 (MQ=255) gCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAActct > 2:750430/1‑100 (MQ=255) gCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAActct < 2:1908323/100‑1 (MQ=255) atctaaCGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAActct < 1:3792947/96‑1 (MQ=255) gAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTa < 2:2850435/100‑1 (MQ=255) aaaCGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTaa < 1:2210815/100‑1 (MQ=255) aaCGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAActctagat > 2:3792908/1‑96 (MQ=255) aaCGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAg > 1:2917303/1‑100 (MQ=255) aCGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAgg > 1:2041497/1‑100 (MQ=255) aCGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACAGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAgg < 2:2017153/100‑1 (MQ=255) tACCCGCCTGGTGCAGCAACATACGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGCCGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTc < 1:2758624/100‑1 (MQ=255) ggaggagagtatgcgcgtcagagattaagtgaaccttaagagttcaattggcctgatgtgacgctgtcttatcaggccaATTGAACTCTTAAGGTTCACt < 2:2425189‑M2/21‑1 (MQ=255) cGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACtt < 2:3371901/100‑1 (MQ=255) ggTGCAGCAACATCCGCGAATTGATTAATAAGCTGAAACGGATGGCATGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAAtc < 1:2608625/99‑1 (MQ=255) ggTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAAtct < 2:2361212/100‑1 (MQ=255) gTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAAtctc < 2:2513396/100‑1 (MQ=255) gcagcaACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg < 2:1678959/100‑1 (MQ=255) gcagcaACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg > 2:2924083/1‑100 (MQ=255) gcaacaACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTg < 1:97619/100‑1 (MQ=255) cagcaACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGa < 1:3565084/100‑1 (MQ=255) cagcaACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGa < 2:2893582/100‑1 (MQ=255) caACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGAcgc > 1:3078703/1‑100 (MQ=255) caACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGAcgc > 2:2534115/1‑100 (MQ=255) aaCATCCGCGAATTTATGAATAAGCTGAAACGTATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGAcgcg < 1:3673926/100‑1 (MQ=255) cATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCa < 1:469078/100‑1 (MQ=255) ccGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATAc < 1:2899339/100‑1 (MQ=255) ccGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATAc > 1:1019394/1‑100 (MQ=255) cgcgAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATAct > 2:966232/1‑100 (MQ=255) cgcgAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATAct < 2:1284309/100‑1 (MQ=255) cgcgAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATAc < 1:215404/99‑1 (MQ=255) cgAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATActct < 1:188238/100‑1 (MQ=255) aaTTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTctcc < 1:1514593/100‑1 (MQ=255) aaTTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTAAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATActct > 1:1942646/1‑98 (MQ=255) gatgaATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGTCGCGCATACTCTCCTCCa < 2:3155381/100‑1 (MQ=255) gatgaATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCa < 2:2951522/100‑1 (MQ=255) atgaATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAg < 2:1846938/100‑1 (MQ=255) atgaATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCACATACTCTCCTCCAg < 2:1360546/100‑1 (MQ=255) tgaATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAgg < 2:2612637/100‑1 (MQ=255) tgaATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAgg > 1:2392408/1‑100 (MQ=255) tgaATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAgg > 1:1178349/1‑100 (MQ=255) tAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTAACTCGCATACTCTCCTCCAGGTTaa > 1:596653/1‑100 (MQ=255) tAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGGCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTaa > 1:3724536/1‑100 (MQ=255) aaGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATGAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTa > 2:2090828/1‑98 (MQ=255) aaGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCACTTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAc > 1:3917119/1‑100 (MQ=255) aaGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAc < 1:2684040/100‑1 (MQ=255) aGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑g > 2:3235804/1‑100 (MQ=255) aGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCGGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATTTCTGACGCGCATACTCTCCTCTAGGTTAAC‑‑g > 2:233114/1‑100 (MQ=255) aGCTGAAACGGATGGCCTGATGAGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑g > 2:2273130/1‑100 (MQ=255) gCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTTTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑gg < 1:1395725/100‑1 (MQ=255) gCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑gg < 2:79253/100‑1 (MQ=255) cTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑gga < 1:3389369/100‑1 (MQ=255) tGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑ggag > 1:514788/1‑100 (MQ=255) tGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑ggag < 2:2666853/100‑1 (MQ=255) gttcaattggcctgataagacagcgtcacatcaggccaATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑ggagga > 2:3681657‑M2/39‑100 (MQ=255) aaCGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑Ggaggag < 1:3821924/100‑1 (MQ=255) tcaattggcctgataagacagcgtcacatcaggccaATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑GGAGgaga > 1:1452808‑M2/37‑100 (MQ=255) gATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCTAATTGATCTCTTAAGGTTTACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCC‑‑GTTAACCTGGAGGAGAGta < 1:1990798/100‑2 (MQ=25) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑GGAGGAGAGTGc < 2:897656/100‑1 (MQ=255) tggcctgataagacagcgtcacatcaggccaATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGTGCATACTATACTCAAGGATAAC‑‑GAAGGAAAGTGCa > 1:3780553‑M2/32‑100 (MQ=255) ggcctgataagacagcgtcacatcaggccaATTGAACTGTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑GGAGGAGAGTGCaa > 2:2413481‑M2/31‑100 (MQ=255) ggcctgataagacagcgtcacatcaggccaATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑GGAGGAGAGTGCaa > 1:1528215‑M2/31‑100 (MQ=255) CCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑GGAGGAGAGTGCAATg > 2:1108756‑M1/1‑100 (MQ=255) ctgataatacagcgacacatcaggccaATTGAACTCTTAAGGTTCACTTCATCTCTGACACGCATACTCTCCTCAAGGTTAAC‑‑GGAGGAGAGCCCAATGa > 2:646414‑M2/28‑100 (MQ=255) CTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑GGAGGAGAGTGCAATGa > 2:3745595‑M1/1‑100 (MQ=255) CTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑GGAGGAGAGTGCAATGa > 1:1709370‑M1/1‑100 (MQ=255) gtgACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑GGAGGAGAGTGCAATGaaaaga > 1:2430654/1‑98 (MQ=255) tgACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAAcc > 2:3557514/1‑100 (MQ=255) ggcGCTGTCTTATGAGGCCAATTGAACTCTTGAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCg > 1:2635690/3‑100 (MQ=255) cGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCgtg > 1:996054/1‑100 (MQ=255) tGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑GGAGGAGCGTGCAATGAAAAACCGTGttt > 2:3584407/1‑100 (MQ=255) gTCTTATCAGGGCAATTGACCACTCAAGGATACTTTCATCTCTAAAGAGCATACTCTCCTCCAGGTTATC‑‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGttga < 2:3273898/100‑3 (MQ=255) gTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTa > 1:3714936/1‑100 (MQ=255) gTCTTATCAGGCAAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑GGAGGAAAAAAAAAAAAAAAACCGTGTTTa < 2:222200/100‑1 (MQ=255) tCTTATCAGGCAAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAAGCTCTCACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑GGAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCGTGTTTAt < 2:2747431/100‑1 (MQ=255) cTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATg > 2:2459613/1‑100 (MQ=255) ttATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCTGGTTAAC‑‑GGAGTAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTAt < 2:3069770/98‑1 (MQ=255) tATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGaa > 1:3313612/1‑100 (MQ=255) tATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGAATAAC‑‑AGAGGAAAATGCAATGAAAAACCGTGTTTATGaa > 1:3315634/1‑100 (MQ=255) tcaggccaATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAg < 1:3582539‑M2/92‑1 (MQ=255) tcaggccaATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAg < 1:3342299‑M2/92‑1 (MQ=255) aggccaATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGtt < 2:2908574‑M2/94‑1 (MQ=255) ggccaATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTTCTCCAGGTTAAC‑‑GGAGGAGAATGCAATGAAAAACCGTGTTTATTAAAGt > 1:765677‑M2/6‑98 (MQ=255) ggccaATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGttt > 1:1073343‑M2/6‑100 (MQ=255) ggccaATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGttt > 2:2639399‑M2/6‑100 (MQ=255) ggccaATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑AGAGGAGAGAGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGttt > 1:1752879‑M2/6‑100 (MQ=255) caATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAAc < 1:3134052‑M2/98‑1 (MQ=255) aTTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTa < 1:3235835/100‑1 (MQ=255) | CCGATTTGCAGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTA > NC_000913/4331946‑4332146 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |