| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,128,352 | T→A | 100% | H15L (CAC→CTC) | metJ ← | transcriptional repressor, S‑adenosylmethionine‑binding |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,128,352 | 0 | T | A | 97.8% | 452.4 / ‑0.2 | 151 | H15L (CAC→CTC) | metJ | transcriptional repressor, S‑adenosylmethionine‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/2); new base A (70/76); total (73/78) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
GTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGATG > NC_000913/4128255‑4128448 | gttCACCTGATGACTCGTGCGTTCATCGGTGATGATTTTTAACACTTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTCTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGc < 1:2375873/100‑1 (MQ=255) ttCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTTAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGc < 1:2463328/99‑1 (MQ=255) ttCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCt < 2:1814713/100‑1 (MQ=255) cACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCa > 1:1989353/1‑100 (MQ=255) cACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAAAAGAAATATTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCa > 1:1451429/1‑100 (MQ=255) ccTTACTACGCTTGCTTTCATCGTTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAg < 1:1732721/99‑1 (MQ=255) ccTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCCGc > 2:635715/1‑100 (MQ=255) gacgacGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTa > 1:159677/1‑100 (MQ=255) gacgacGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTa > 2:2478392/1‑100 (MQ=255) gacgacGCGTGCGTTCATCGGAGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCg > 2:612771/1‑98 (MQ=255) cgacgCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTAt > 1:3564908/1‑99 (MQ=255) cgacgCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATg > 1:2584795/1‑100 (MQ=255) gacgCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATgg < 2:1145953/100‑1 (MQ=255) acgCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTATTCTTTTTGAGTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATggg < 2:1382567/100‑1 (MQ=255) gcgtgcgtTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCt < 1:3809236/100‑1 (MQ=255) cgtgcgtTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTg > 1:2790465/1‑100 (MQ=255) cgtgcgtTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTg < 2:230496/100‑1 (MQ=255) gtgcgtTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATATTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGa > 1:503715/1‑100 (MQ=255) tgtgtTCATCGGTGAGGATTTTTAAAACCTTAAGAAGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGATAAATGTTCTTGCTGAGCTCAGCGTATGGTCTTat > 2:3401090/4‑100 (MQ=255) gcgtTCATCGGTGAGGATTTTTAACTCCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGata < 1:2193212/100‑1 (MQ=255) gcgtTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGata < 2:3845738/100‑1 (MQ=255) gcgtTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAAGGGAAGCCGTAGTCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGGTCAGCGTATGGGCTGat < 2:1887957/99‑1 (MQ=255) cgtTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGGAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGatat > 2:2171383/1‑100 (MQ=255) gtTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGatata < 2:2020539/100‑1 (MQ=255) cATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTc > 2:2420522/1‑100 (MQ=255) cATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTc < 2:1275062/100‑1 (MQ=255) aTCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGATACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTcg < 1:168759/100‑1 (MQ=255) tCGTTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTcgc < 2:2561480/100‑1 (MQ=255) tCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTcgc < 1:1430994/100‑1 (MQ=255) ggTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTcgccg > 1:1884499/1‑100 (MQ=255) ggTGAGGAGTTTTATCATCTTAAGAGGAATGGAAGTCGTAATCTTTTTGGCTTGTTCACTCGTCTTGCCGTGCTCAGCTCATGCGCTGagctcgg < 2:159156/95‑7 (MQ=255) gTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTcgccgc > 1:1320573/1‑100 (MQ=255) gTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTcgccgc > 2:763765/1‑100 (MQ=255) tGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGTCTGATATATTCGCCGCt < 2:2452867/100‑1 (MQ=255) gAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTc > 1:1507965/1‑100 (MQ=255) aGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTcc < 1:3639420/100‑1 (MQ=255) ggATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCa > 2:2623197/1‑100 (MQ=255) ggATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGATCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCa > 1:3016998/1‑100 (MQ=255) ggATTTTTAACACCTTAAGAGGAATAAAAACCGTAATCTTTTTAACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAAAGTATGGGTTGCTATATTCCCCGCTcc > 2:2925247/1‑99 (MQ=255) gATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCAt < 1:2420544/100‑1 (MQ=255) aTTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCAtt > 1:398293/1‑100 (MQ=255) aTTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCAtt > 1:3453518/1‑100 (MQ=255) aTTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCAtt > 1:2102044/1‑100 (MQ=255) ttttAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCa > 1:2907982/1‑100 (MQ=255) ttAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGc > 1:1768843/1‑100 (MQ=255) ttAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGc < 2:379746/100‑1 (MQ=255) tAACACCTTAAGAGTAATGGAAACCGTATTCTTTTTTACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGcc < 1:835638/100‑1 (MQ=255) tAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGcc < 2:2857400/100‑1 (MQ=255) tAACACCTTAAGAGGAATAGAAACCGGAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGGGCTCAGCGTATGGGCTGATGGATTCGCCTCTCCATTCAGcc > 2:1750794/1‑100 (MQ=255) acacCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCAt > 1:305586/1‑100 (MQ=255) cgatctAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATg < 1:900209/95‑1 (MQ=255) cacCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATAGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATg > 1:679963/1‑100 (MQ=255) ccTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATgag > 2:225447/1‑100 (MQ=255) ccTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGAGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATgag > 1:2572943/1‑100 (MQ=255) ttAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGAt < 1:1209374/100‑1 (MQ=255) naaGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATa > 1:1544216/2‑100 (MQ=255) aaGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATAc < 1:2447052/100‑1 (MQ=255) gagGAATGGAAACCGTAAGCTTTGTGACTTTGTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTGGTCGCTCCATTCAGCCATGAGATACtt < 2:1696090/100‑1 (MQ=255) ggAATGGGAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTaa > 1:2051744/1‑100 (MQ=255) ggAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTaa > 2:1717941/1‑100 (MQ=255) ggAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTaa > 2:2251021/1‑100 (MQ=255) ggAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGATCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTaa > 2:1192835/1‑100 (MQ=255) aaTGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATc < 1:2213343/100‑1 (MQ=255) aTGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTTAGCCATGAGATACTTAATcc < 2:262697/100‑1 (MQ=255) aTGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATcc < 1:2816387/100‑1 (MQ=255) aTGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATcc < 2:3205289/100‑1 (MQ=255) aTGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATcc < 1:740709/100‑1 (MQ=255) tGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCct > 1:2724640/1‑100 (MQ=255) aCCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCg < 1:107596/100‑1 (MQ=255) ccGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGt > 2:53056/1‑100 (MQ=255) ccGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGt > 1:2149865/1‑100 (MQ=255) ccGTAATCTATATGACAAGTTCACTCGTCTGGCGGAGCCGAGCGTATGGGCTGTTATATTCGCCGCTCCATTGAGCCATGGGATACTTaagcgtc > 2:320428/1‑90 (MQ=255) cGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTc < 2:2493101/100‑1 (MQ=255) gTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCTATGAGATACTTAATCCTCTTCGTc < 2:2340901/99‑1 (MQ=255) gTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCa < 2:2877286/100‑1 (MQ=255) tAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCAAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACCTAATCCTCTTCGTCaa > 2:2287848/1‑100 (MQ=255) tttttGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAAt > 1:3012212/1‑100 (MQ=255) tttGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTg < 1:1717956/100‑1 (MQ=255) tttGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTg < 1:3899914/100‑1 (MQ=255) ttGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTga > 1:3451150/1‑100 (MQ=255) gACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTTCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTgaga < 2:789574/100‑1 (MQ=255) gACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTgaga < 1:3689314/100‑1 (MQ=255) cTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGagacc > 2:494381/1‑100 (MQ=255) cTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGagacc < 1:430963/100‑1 (MQ=255) cTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGagac > 2:3546720/1‑99 (MQ=255) tGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTTATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGagaccag < 1:1008422/100‑1 (MQ=255) tGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGagaccag > 2:1852069/1‑100 (MQ=255) gTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGagaccaga < 2:1027062/100‑1 (MQ=255) tCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGagaccagacc > 2:1418069/1‑100 (MQ=255) tCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGagaccagacc < 2:976579/100‑1 (MQ=255) cACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAgaccagacca < 2:1551246/100‑1 (MQ=255) aCTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACcac > 2:3320676/1‑100 (MQ=255) aCTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACcac > 2:13977/1‑100 (MQ=255) ctctTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACcaca > 2:1935307/1‑100 (MQ=255) ttcttGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCTATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAg < 1:3038796/100‑1 (MQ=255) ttGCCGAGCTCAGGGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTg < 2:1935831/100‑1 (MQ=255) gCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGAt > 2:3383652/1‑100 (MQ=255) gCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGAt < 2:2930571/100‑1 (MQ=255) gCCGAGCTCAGCGTAT‑GGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGAtg < 1:1836752/100‑1 (MQ=255) gCCGAGCGCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGAt > 1:2057787/1‑100 (MQ=255) | GTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGATG > NC_000913/4128255‑4128448 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |