| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,533,536 | A→G | 100% | A83A (GCT→GCC) | yjhQ ← | GNAT family putative N‑acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,533,536 | 0 | A | G | 97.4% | 471.8 / ‑0.3 | 148 | A83A (GCT→GCC) | yjhQ | GNAT family putative N‑acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/3); new base G (93/51); total (94/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.38e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.00e-01 | |||||||||||
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
CCGTCTGGCAGCCCATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGAGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATACCGGGCTAGC > NC_000913/4533439‑4533632 | ccGTCTGGCAGCCCATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGc > 2:1826461/1‑100 (MQ=255) gTCTGGCAGCCCATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGa > 2:2604568/1‑100 (MQ=255) cTGGCAGCCCATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAgg > 1:707913/1‑100 (MQ=255) tGGCAGCCCATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGa > 1:2589066/1‑100 (MQ=255) ggCAGCCCATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGAt > 2:383613/1‑100 (MQ=255) ggCAGCCCATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGAt > 1:1788129/1‑100 (MQ=255) ggCAGCCCATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCCCCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGAt > 1:3412780/1‑100 (MQ=255) ggCAGCCCATCAACCTCAGATGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAgg > 2:257417/1‑98 (MQ=255) gCAGCCCATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGAtg < 2:646607/100‑1 (MQ=255) gCAGCCCATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGAtg < 2:799193/100‑1 (MQ=255) cAGCCCATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGAtgt > 1:3190194/1‑100 (MQ=255) aGCCCATCAACCTCAGGTGTTCGATGCTAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGAtgtg < 1:595868/100‑1 (MQ=255) cccATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCa < 1:1245291/100‑1 (MQ=255) cccATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCa > 1:2532391/1‑100 (MQ=255) cccATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTACCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCa < 2:362607/100‑1 (MQ=255) ccATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCAt < 2:2029266/100‑1 (MQ=255) cATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCCCGCCCATCCCTTTGTATTCCGGCATCACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATc > 1:1701439/1‑100 (MQ=255) cATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCAGCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATc > 2:923565/1‑100 (MQ=255) aTCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCa < 1:3792076/100‑1 (MQ=255) aaCCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACg < 1:2421262/100‑1 (MQ=255) cTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTg < 1:2393154/100‑1 (MQ=255) cTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTg < 2:3871441/100‑1 (MQ=255) cTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTg < 1:3442563/100‑1 (MQ=255) agttGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTg < 2:3084174/94‑1 (MQ=255) ggTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATc > 1:3882380/1‑100 (MQ=255) ggTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATc > 2:445099/1‑100 (MQ=255) gTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATcc > 1:151641/1‑100 (MQ=255) cTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCAtt < 2:2710024/100‑1 (MQ=255) cTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGAATCAACAGTAAATCCAtt > 2:3613105/1‑100 (MQ=255) cGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTtc > 1:3732127/1‑100 (MQ=255) gTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGAGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGa < 2:2763770/100‑1 (MQ=255) cGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAgg > 1:1814458/1‑100 (MQ=255) cGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAgg > 2:3195607/1‑100 (MQ=255) gTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGt > 2:1276259/1‑100 (MQ=255) tATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGtt > 1:3294723/1‑100 (MQ=255) tCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGc > 2:2965516/1‑100 (MQ=255) cAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGcc > 2:1933260/1‑100 (MQ=255) cAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGcc > 2:1934795/1‑100 (MQ=255) cAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGcc > 1:563355/1‑100 (MQ=255) cAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGAGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGcc < 1:904910/100‑1 (MQ=255) aaCCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCG‑GGGGGGCGAGGATGGGCATAAACGGAGAAAACATTACTACTTAGAAgg > 1:3551131/1‑94 (MQ=255) aaCCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGccc > 2:2161797/1‑100 (MQ=255) aCCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGTCTTCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCg < 1:469024/100‑1 (MQ=255) aCCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCg > 2:939404/1‑100 (MQ=255) aCCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGAGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCg > 2:3009682/1‑100 (MQ=255) ccGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCgg > 1:500035/1‑100 (MQ=255) ccGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCgg > 2:2504045/1‑100 (MQ=255) ccGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCgg > 2:1683625/1‑100 (MQ=255) cGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCggg > 2:3547349/1‑100 (MQ=255) gTCCTCCCACGCCCATCCCTTGTTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCggg < 2:3513563/99‑1 (MQ=255) gTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGt > 2:590455/1‑100 (MQ=255) tcctccCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGta > 2:1540599/1‑100 (MQ=255) tcctccCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGta < 2:1038964/100‑1 (MQ=255) cctccCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGtaa > 2:1652190/1‑100 (MQ=255) ctccCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGtaaa > 2:3738367/1‑100 (MQ=255) ctccCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGtaaa > 1:448650/1‑100 (MQ=255) ctccCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTATCCTTTGAAGGTTGCCCGGGtaaa > 1:441584/1‑100 (MQ=255) cccACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGtaaata > 1:2943253/1‑100 (MQ=255) cccACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGaaaata > 1:1767250/1‑100 (MQ=255) ccACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGtaaataa < 2:2957072/100‑1 (MQ=255) cACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGtaaataaa < 2:1788764/100‑1 (MQ=255) cACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGtaaataaa > 1:2245839/1‑100 (MQ=255) cACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GCGGGGAGAGGATGTGCATTAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGACCGGGtcaatcaa > 2:778379/1‑100 (MQ=255) gCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTaaataaaata > 2:1148615/1‑100 (MQ=255) cccATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAatat > 2:1696921/1‑100 (MQ=255) cATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGc > 2:1691479/1‑100 (MQ=255) aTCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGcc < 1:3369015/100‑1 (MQ=255) aTCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCAAGGAAAATAAAATATGc > 1:1619388/1‑99 (MQ=255) cccTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCg > 2:1326553/1‑100 (MQ=255) ggTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGc > 2:3481369/1‑100 (MQ=255) gTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCt < 1:3051094/100‑1 (MQ=255) tATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCtt > 2:2242014/1‑100 (MQ=255) aTTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCttt < 2:1537151/100‑1 (MQ=255) tCCGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGc > 1:1550581/1‑100 (MQ=255) ccGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGcc > 2:3376456/1‑100 (MQ=255) ccGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGcc < 1:3493990/100‑1 (MQ=255) cGGTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCATTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCt < 2:3461305/100‑1 (MQ=255) cGGTATGACCGCCA‑GGGGAGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCt < 1:1025719/100‑1 (MQ=255) ggTATGACCGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGTATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGTCCGGGTAAATAAAATATGACCGACGGCTTTACCtt > 1:1728227/1‑100 (MQ=255) 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2:2072541/1‑100 (MQ=255) ccGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTACCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATACCg > 1:3137901/1‑100 (MQ=255) cGCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATACCgg > 1:2854295/1‑100 (MQ=255) gCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATACCggg > 2:1318995/1‑100 (MQ=255) gCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATACCggg < 1:883916/100‑1 (MQ=255) gCCA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATACCggg > 1:2616760/1‑100 (MQ=255) ccA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGTTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATACCGGGc < 1:1901323/100‑1 (MQ=255) cA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATACCGGGCt < 2:3294689/100‑1 (MQ=255) cA‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATACCGGGCt < 1:3835951/100‑1 (MQ=255) a‑GGGGGGCTAGTATGTGCATCTACTGTGAATCCATTTCCCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCTACGGCTTTGCCTTCATACCggg < 2:3351283/97‑1 (MQ=255) a‑GGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATACCGGGCTa > 1:675512/1‑100 (MQ=255) a‑GGGGAGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATACCGGGCTa > 2:3375664/1‑100 (MQ=255) ggggggCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATACCGGGCTag > 1:255998/1‑100 (MQ=255) ggggGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATACCGGGCTagc < 1:1156660/100‑1 (MQ=255) | CCGTCTGGCAGCCCATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCA‑GGGGAGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATACCGGGCTAGC > NC_000913/4533439‑4533632 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |