| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,573,528 | A→G | 100% | pseudogene (1115/1503 nt) | yjiT → | pseudogene |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,573,528 | 0 | A | G | 99.8% | 572.4 / ‑6.7 | 171 | pseudogene (1115/1503 nt) | yjiT | pseudogene |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (75/94); total (75/96) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
AAAAGCGAAGTGAGATTTGGCAGGCAAAATCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGACAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGCTGTTACAGGGACAGGCTTCTTGCAGTGTGCGAAGC > NC_000913/4573431‑4573622 | aGCGAAGTGAGATTTGGCAGGCAAAATCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTg < 1:3548607/100‑1 (MQ=255) cGAAGTGAGATTTGGCAGGCAAAATCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGaa > 1:1324592/1‑100 (MQ=255) gAAGTGAGATTTGGCAGGCAAAATCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGaaa > 1:3247319/1‑100 (MQ=255) aGTGAGATTTGGCAGGCAAAATCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGAATTAAACTTGATGGCAGTGAAAtt > 1:951106/1‑100 (MQ=255) gTGAGATTTGTCAGGCAAAATCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTg < 1:3918032/100‑1 (MQ=255) gTGAGATTTGGCAGGCAAAATTCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTAGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTg < 1:3647752/100‑1 (MQ=255) gTGAGATTTGGCAGGCAAAATCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTg > 1:688224/1‑100 (MQ=255) gagaTTTGGCAGGCAAAATCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGcc < 1:1653386/100‑1 (MQ=255) gagaTTTGGCAGGCAAAATCCATCGGCAGGTTGGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGcc > 2:3275682/1‑100 (MQ=255) gaTTTGGCAGGCAAAATCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCAt > 2:187692/1‑100 (MQ=255) gaTTTGGCAGGCAAAATCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCAt > 1:2180444/1‑100 (MQ=255) gaTTTGGCAGGCAAAATCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCAt > 2:1628381/1‑100 (MQ=255) aTTTGGCAGGCAAAATCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCAtt < 1:3381115/100‑1 (MQ=255) ttGGCATGCAAAATCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGTCTGTGAAATTGCCATTgg < 2:285581/100‑1 (MQ=255) ttGGCAGGCAAAATCCATCGGCAGGTTTGTTGTTAGTGGTTCGTTCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTgg < 1:3283908/100‑1 (MQ=255) ttGGCAGGCAAAATCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTgg < 2:125669/100‑1 (MQ=255) ttGGCAGGCAAAATCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTgg < 1:3681578/100‑1 (MQ=255) ttGGAAGGCAAAATCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTAGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTgg < 1:2128561/100‑1 (MQ=255) ggcaggcaAAATCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTg < 2:2858231/100‑1 (MQ=255) gcaggcaAAATCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGa < 1:1484780/100‑1 (MQ=255) gcaggcaAAATCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGa < 1:2604585/100‑1 (MQ=255) caggcaAAATCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTTCTGGGGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTg > 1:2607368/1‑98 (MQ=255) caggcaAAATCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAg < 2:1397367/100‑1 (MQ=255) caggcaAAATCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAg < 1:2112092/100‑1 (MQ=255) ggcaAAATCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGTCTCGTGCTGGAGAGATCATTATTGGGAGCATTAATCTTGATGGCTGTGAAATTGCCAGTGGTGAgg < 2:147006/99‑1 (MQ=255) gcaAACTCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGCGGCTCGTGCTGGCGGGATGATTGTTCGCAGCACTAAACTCGATGGCCGTGAAATTGCCATTGCTGacg > 2:684434/1‑96 (MQ=255) gcaAAATCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTg > 1:1175099/1‑100 (MQ=255) gcaAAATCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTg < 1:3147008/100‑1 (MQ=255) ccaactCCATCGGCAGGTATGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGAGATAATTTTTGGGAGTATTAAACTTGATTGCAGTGAAATTGCCATTGTTGAgg < 2:3692233/92‑1 (MQ=255) aaTCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGt < 1:3527685/100‑1 (MQ=255) aaTCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTACCATTGGTGAGGTGCCGt < 1:1863031/100‑1 (MQ=255) aTCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGtt > 2:2232651/1‑100 (MQ=255) aTCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGtt > 1:1972667/1‑100 (MQ=255) ccATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTaa < 2:2195103/100‑1 (MQ=255) cATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAAc < 1:2835187/100‑1 (MQ=255) cGGCAGTTTTGTTGTTAGTTGTTCGTTTTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCtt < 1:220618/100‑1 (MQ=255) ggTCTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGCGATGCTTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCCGTGACATTGCCCTTGGCGCGGTGCCGTTACCCTTCATCg > 2:1970232/1‑100 (MQ=255) gTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTTTTTGTAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGAt < 1:8518/100‑1 (MQ=255) cGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGc < 2:3607151/100‑1 (MQ=255) cGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGc > 2:3871555/1‑100 (MQ=255) cGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGc > 2:3314591/1‑100 (MQ=255) gTTAGTGGCTCGTTCTGGAGGTATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGc < 1:1717358/99‑1 (MQ=255) gTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGAAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGc < 1:490814/99‑1 (MQ=255) ttAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAg < 2:137232/100‑1 (MQ=255) aGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGAt > 1:3143635/1‑100 (MQ=255) aGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGAt < 1:1270504/100‑1 (MQ=255) gTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATc < 1:579855/100‑1 (MQ=255) gTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATc < 1:2243757/100‑1 (MQ=255) ggCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCGATTGGTGAGGTGGCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCa > 2:2470400/1‑99 (MQ=255) ggCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCaa > 2:2521577/1‑100 (MQ=255) gCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAAt < 2:384041/100‑1 (MQ=255) gCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAAt < 1:2878927/100‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATg < 2:1223461/100‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATg < 1:2984886/100‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATg < 1:2053354/100‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATg < 2:496923/100‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATg < 2:3905844/100‑1 (MQ=255) cTCGTGCTGGAGGGATGATTATTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCTATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATg > 2:3506405/1‑100 (MQ=255) tCGTTCTGGATGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTTATGGCAGTTAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATg < 1:1299541/99‑1 (MQ=255) cGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGATTATTAAACTTTATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGc < 1:108329/100‑1 (MQ=255) cGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCTTTAAACTTGTTTGCAGTGTATTTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGc < 1:372893/100‑1 (MQ=255) cGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGATGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGc < 2:1521667/100‑1 (MQ=255) cGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGc < 2:763159/100‑1 (MQ=255) cGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAAATGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGc < 1:3778602/100‑1 (MQ=255) gTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGCt > 2:1991544/1‑100 (MQ=255) gCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGATGt > 1:1689078/1‑100 (MQ=255) tGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGCTGttn < 2:3006713/100‑2 (MQ=255) tGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGCTGTTa < 2:208155/100‑1 (MQ=255) ggAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGCTGTTAc > 1:3119002/1‑100 (MQ=255) ggAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGCTGTTAc < 1:1618467/100‑1 (MQ=255) ggAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGACGTTAACATTAATCGTTGATGCAGATCAATGACTGTTAc > 1:903305/1‑100 (MQ=255) gggATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGCTGTTACAgg > 2:572503/1‑100 (MQ=255) gggATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGCTGTTACAgg > 1:3598838/1‑100 (MQ=255) tgatTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGGCTGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCAGCGTTGATGCAGATCAATGGCTGTTACAGGGACa < 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gggAGCATTAAACTTGATGGAAGTGAAATTTCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATAAATGGCTGTTACAGGGACAGGcttctt < 2:1647164/100‑1 (MQ=255) gggAGCATCAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGCTGTTACAGGGACAg > 2:258089/1‑93 (MQ=255) gAGCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGCTGTTACAGGGACAGGCTTCTTGc < 2:444611/100‑1 (MQ=255) gCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGCTGTTACAGGGACAGGCTTCTTGCAg < 2:2722587/100‑1 (MQ=255) gCATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGCTGTTACAGGGACAGGCTTCTTGCAg > 1:2812032/1‑100 (MQ=255) cATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGCTGTTACAGGGACAGGCTTCTTGCAgt > 1:407568/1‑100 (MQ=255) cATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGCTGTTACAGGGACAGGCTTCTTGCAgt > 2:3309005/1‑100 (MQ=255) cATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGCTGTTACAGGGACAGGCTTCTTGCAgt > 2:2496270/1‑100 (MQ=255) cATTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGCTGTTACAGGGACAGGCTTCTTGCAg < 1:544455/99‑1 (MQ=255) aTTAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCGATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGCTGTTACAGGGACAGGCTTCTTGCAgt > 1:2386834/1‑99 (MQ=255) tAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCTATTGGTGAGTTGCTGTTAATCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGCTGTTACAGGGACAGGCTTCTTGCAGtgtg < 1:13946/100‑1 (MQ=255) tAAACTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGCTGTTACAGGGACAGGCTTCTTGCAGtgtg < 1:2564641/100‑1 (MQ=255) aaCTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGCTGTTACAGGGACAGGCTTCTTGCAGTGTGCg > 1:1547511/1‑100 (MQ=255) aCTTGATTGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGCTGTTACAGGGACAGGCTTCTTGCAGTGTGCGa > 2:1620987/1‑100 (MQ=255) cTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGCTGTTACAGGGACAGGCTTCTTGCAGTGTGCGaa < 1:533194/100‑1 (MQ=255) cTTGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGCTGTTACAGGGACAGGCTTCTTGCAGTGTGCGaa > 1:3297740/1‑100 (MQ=255) ttGATGGCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGCTGTTACAGGGACAGGCTTCTTGCAGTGTGCGAag > 2:3388766/1‑100 (MQ=255) tgatggCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGCTGTTACAGGGACAGGCTTCTTGCAGTGTGCGAagc > 1:2746070/1‑100 (MQ=255) tgatggCAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGCTGTTACAGGGACAGGCTTCTTGCAGTGTGCGAagc > 1:397219/1‑100 (MQ=255) | AAAAGCGAAGTGAGATTTGGCAGGCAAAATCCATCGGCAGGTTTGTCGTTAGTGGCTCGTGCTGGAGGGATGATTGTTGGGAGCATTAAACTTGATGACAGTGAAATTGCCATTGGTGAGGTGCCGTTAACCTTCATCGTTGATGCAGATCAATGGCTGTTACAGGGACAGGCTTCTTGCAGTGTGCGAAGC > NC_000913/4573431‑4573622 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |