| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,285,190 | T→A | 15.6% | L18I (TTA→ATA) | narJ → | molybdenum‑cofactor‑assembly chaperone delta subunit of nitrate reductase 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,285,190 | 0 | T | A | 15.6% | 384.7 / 58.5 | 160 | L18I (TTA→ATA) | narJ | molybdenum‑cofactor‑assembly chaperone delta subunit of nitrate reductase 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (74/60); new base A (18/7); total (92/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.30e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.21e-02 | |||||||||||
Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
CCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAA > NC_000913/1285091‑1285289 | ccGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCt < 1:2566516/100‑1 (MQ=255)ccGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCt < 2:1359877/100‑1 (MQ=255) gtcgtATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTa > 1:1058426/1‑100 (MQ=255) tcgtATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTa < 2:2472256/99‑1 (MQ=255) cgtATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATg < 2:2803315/100‑1 (MQ=255) gtATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATgg < 1:203062/100‑1 (MQ=255) gtATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCAGGATGCTGCCTTATgg > 2:3252032/1‑100 (MQ=255) tATCGATGCCATCGATGTGAACAGCAAAACGGAGCCGCATCAATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCATTTAATATTCGGATGCTTCCTTAtag > 2:1116219/1‑97 (MQ=255) aTCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGgca < 2:3480468/100‑1 (MQ=255) tCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGgcag > 2:1797009/1‑100 (MQ=255) cGATGCCATCGATGTGACGAGCAAAACGGGGCCGCGTCCATGATCGAATTCGTGTTTGTATCGCGCCTCCTTGAATATCCAGATGCTGCCTTATGgcagc < 2:2189796/100‑1 (MQ=255) cGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGgcagc > 1:3235065/1‑100 (MQ=255) gATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCGTCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCATAAGgcagca < 1:3447972/100‑1 (MQ=255) aTGCCATCGATGTGACCAGCAAATCGGAGTCGCATCCATGATCGATCTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGATTTTCCGTATGCTGCCTTATGGCAGCAt < 2:505936/100‑1 (MQ=255) tGCCATCGATGTGACCAGCAAAAAGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATc > 2:1581662/1‑100 (MQ=255) gCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCGTATGGCAGCATca < 1:2630370/100‑1 (MQ=255) gCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCATAAGGCAGCATcc < 2:3390774/100‑2 (MQ=255) ccATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATcaa > 1:1899288/1‑100 (MQ=255) cATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATcaac > 1:1533061/1‑100 (MQ=255) tCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATcaacaa < 2:433460/100‑1 (MQ=255) gATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAaga > 2:3378111/1‑100 (MQ=255) gATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAaga > 2:830577/1‑100 (MQ=255) tgACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATg > 1:901850/1‑100 (MQ=255) gACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATAGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATg > 2:529541/1‑99 (MQ=255) ccAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGttt > 1:3776046/1‑100 (MQ=255) cAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTg > 1:2026338/1‑100 (MQ=255) gCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAg > 1:1801492/1‑100 (MQ=255) aaaaCGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGc > 1:3624975/1‑100 (MQ=255) aaaaCGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCAGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAgg < 1:3674260/99‑1 (MQ=255) cGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGAtt > 1:3628640/1‑100 (MQ=255) gCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCcg > 1:251963/1‑100 (MQ=255) gCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGAcg > 2:3164422/1‑100 (MQ=255) ccGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACCAGAGATGTTTGAGGCGATTg < 2:2332855/96‑1 (MQ=255) cATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTc < 2:2242217/100‑1 (MQ=255) ccATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGaa > 2:1124232/1‑100 (MQ=255) ccATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGaa > 1:2288962/1‑100 (MQ=255) tGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGaaaaa > 1:1648205/1‑100 (MQ=255) gATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAAt > 2:2564150/1‑100 (MQ=255) gATCGAACGCGTGTTTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGTATGCTGCCTTATGGCATCATCAACAAGTTATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGaa < 2:1058753/96‑1 (MQ=255) cGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTg < 1:2118395/100‑1 (MQ=255) gAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGc > 2:2979726/1‑100 (MQ=255) gAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAAAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTg > 1:1797215/1‑99 (MQ=255) aaCTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGcc < 2:3235034/100‑1 (MQ=255) aaCTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGcc < 2:2503290/100‑1 (MQ=255) aCTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGTATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCa < 2:444004/100‑1 (MQ=255) gTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAag > 2:3316279/1‑100 (MQ=255) gTGATTGTATCGCGTCTCCTTAAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAag > 2:3567445/1‑100 (MQ=255) gATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAagag > 2:3619587/1‑100 (MQ=255) aacgcgTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCTAAAAGAGGATGcc < 2:1870701/98‑1 (MQ=255) cgcgTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCa > 2:3749277/1‑100 (MQ=255) gcgTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCAt > 2:368754/1‑100 (MQ=255) cgTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATg < 2:1801477/100‑1 (MQ=255) tcCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑t > 2:2873825/1‑100 (MQ=255) ccgttaaTATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATTTTTGAGGCGATTGCCACGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑Tg < 2:1749568/95‑1 (MQ=255) ccTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑Tg < 1:2357917/100‑1 (MQ=255) cTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑Tgg > 2:1047528/1‑100 (MQ=255) cTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑Tgg > 1:183549/1‑100 (MQ=255) cTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑Tgg < 2:1361018/100‑1 (MQ=255) cTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑Tgg > 1:3456852/1‑100 (MQ=255) cTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑Tgg > 2:3556995/1‑100 (MQ=255) cTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGACAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑Tgg > 1:2383379/1‑100 (MQ=255) ttGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAATAAATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCGGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑Tggg < 1:2744168/100‑1 (MQ=255) ttGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑Tggg < 2:142043/100‑1 (MQ=255) ttGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑Tggg < 1:762056/100‑1 (MQ=255) tGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGAAGCATCAAGAATAGGTGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCAAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGc < 2:415672/100‑1 (MQ=255) gAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCa < 1:2842227/100‑1 (MQ=255) tatTCGGATGCTGCCTTATGGCATCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCAGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCa < 1:775334/97‑1 (MQ=255) tatCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCAttt > 1:219532/1‑100 (MQ=255) tatCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCA‑GCGCATGGGCAtcc < 1:830587/100‑3 (MQ=255) ttgttgATGCTGCCATAAGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCAtttt > 1:1045558/6‑100 (MQ=39) atCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCA‑GCGCATGGGCAtcct < 1:442538/100‑4 (MQ=255) tgttgATGCTGCCATAAGGCAGCATCCACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCATCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCACATACGC‑TGGGCAttt > 1:631715/5‑98 (MQ=37) tCCGGATGCTGCCTTATGGTAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCAtttt < 1:940832/99‑1 (MQ=255) tCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCA‑GCGCATGGGCAtcctc < 2:699720/100‑5 (MQ=255) tCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCACGTAGAAAAAACTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTc > 1:990193/1‑100 (MQ=255) gttgATGCTGCCATAAGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTcc > 2:632172/4‑100 (MQ=255) gttgATGCTGCCATAAGGCACCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTcc > 1:3694385/4‑100 (MQ=255) ccGGATGCTGCCTTTTGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTcc < 1:3191949/100‑1 (MQ=255) ccGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCA‑GCGCATGGGCAtcctct < 1:1808509/100‑6 (MQ=255) ggATGTTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGTTGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTg < 1:713529/100‑1 (MQ=255) ggATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTg < 1:1463076/100‑1 (MQ=255) gATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTgc < 1:1245847/100‑1 (MQ=255) gATGCTGCCATAAGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTTAGGCGAGTGCCGCCTCGAGAAATCGGCCAAATGAGGATGCCCAGGCTC‑TGGGCGTTTTCCTg > 2:1297089/1‑99 (MQ=255) gATGCTGCCATAAGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTgc > 2:156492/1‑100 (MQ=255) gATGCTGCCATAAGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTgc > 1:1667111/1‑100 (MQ=255) aTGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTgcg < 2:490958/100‑1 (MQ=255) aTGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTgcg < 1:2980541/100‑1 (MQ=255) tgctgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGTCACAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGCCATTTTCCTgcgc < 2:2413035/100‑1 (MQ=255) tgctgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTgcgc < 1:3376061/100‑1 (MQ=255) tgctgcCATAAGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTgcgc > 1:1365199/1‑100 (MQ=255) gctgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGcgcg < 2:2821513/100‑1 (MQ=255) gctgcCTTATGGAAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGcgcg < 2:3209022/100‑1 (MQ=255) gctgcCATAAGGCAGCATCAACAAGAGTTGTTTGAGGCGATTGCCGCATCGAAAAATCTGCCAAAAGAGAATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTgttc > 1:1407809/1‑96 (MQ=255) ctgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGa > 2:1724478/1‑100 (MQ=255) tgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGAt < 1:1473204/100‑1 (MQ=255) tgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGAt < 2:1772460/100‑1 (MQ=255) tgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAAAGGATGCCCATACGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGAt > 1:2213357/1‑100 (MQ=255) gcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGAtt > 1:1649698/1‑100 (MQ=255) ccTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGAttt > 2:2872652/1‑100 (MQ=255) cTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTa < 1:3496660/100‑1 (MQ=255) | CCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAA > NC_000913/1285091‑1285289 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |