| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,285,193 | T→A | 15.6% | W19R (TGG→AGG) | narJ → | molybdenum‑cofactor‑assembly chaperone delta subunit of nitrate reductase 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,285,193 | 0 | T | A | 15.6% | 395.5 / 58.6 | 160 | W19R (TGG→AGG) | narJ | molybdenum‑cofactor‑assembly chaperone delta subunit of nitrate reductase 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (74/61); new base A (18/7); total (92/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.27e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.94e-01 | |||||||||||
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
CGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACG > NC_000913/1285095‑1285291 | aTCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGgca < 2:3480468/100‑1 (MQ=255) aTCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGgca > 2:2842201/1‑100 (MQ=255) tCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGgcag > 2:1797009/1‑100 (MQ=255) cGATGCCATCGATGTGACGAGCAAAACGGGGCCGCGTCCATGATCGAATTCGTGTTTGTATCGCGCCTCCTTGAATATCCAGATGCTGCCTTATGgcagc < 2:2189796/100‑1 (MQ=255) cGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGgcagc > 1:3235065/1‑100 (MQ=255) aTGCCATCGATGTGACCAGCAAATCGGAGTCGCATCCATGATCGATCTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGATTTTCCGTATGCTGCCTTATGGCAGCAt < 2:505936/100‑1 (MQ=255) tGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCATAAGGCAGCATc < 2:3189543/100‑1 (MQ=255) tGCCATCGATGTGACCAGCAAAAAGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATc > 2:1581662/1‑100 (MQ=255) gCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCGTATGGCAGCATca < 1:2630370/100‑1 (MQ=255) ccATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTTAATATCCGGATGCTGCCATAAGGCAGCATccg < 2:1353353/100‑3 (MQ=255) ccATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCTTATGCTGCCATAAGGCAGCATccg < 2:1829290/100‑3 (MQ=255) ccATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCATAAGGCAGCATccg < 1:2107261/100‑3 (MQ=255) aTCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATcaaca > 1:3415629/1‑100 (MQ=255) gATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAaga > 2:830577/1‑100 (MQ=255) gATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAaga > 2:3378111/1‑100 (MQ=255) aTGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAagag > 2:2881204/1‑100 (MQ=255) gtgACCAGCAAAACGGAGCAGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGCATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAagag > 2:2532467/1‑98 (MQ=255) tgACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATg > 1:901850/1‑100 (MQ=255) tgACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATg < 2:333597/100‑1 (MQ=255) gACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGt > 1:1807227/1‑100 (MQ=255) gACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATAGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATg > 2:529541/1‑99 (MQ=255) aCCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGACTGTATCGCGTCTCCTTGAACATACGGACGCTGCCTAATGGCAGCATCAACAAaaga > 2:3436636/1‑96 (MQ=255) ccAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGttt < 2:3595135/100‑1 (MQ=255) ccAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATACCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGtt > 1:892477/1‑99 (MQ=255) cAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTg < 1:3472558/100‑1 (MQ=255) cAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTg > 1:2026338/1‑100 (MQ=255) aaaaCGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGc > 1:3624975/1‑100 (MQ=255) cGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATACTGCCTTATAACAACATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGAtt > 1:302736/1‑100 (MQ=255) gCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCcg > 1:251963/1‑100 (MQ=255) gCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCcg > 2:442532/1‑100 (MQ=255) gCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCcg > 1:3600685/1‑100 (MQ=255) ccGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACCAGAGATGTTTGAGGCGATTg < 2:2332855/96‑1 (MQ=255) cGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCcgcg < 1:1914402/100‑1 (MQ=255) cATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTc < 1:3884275/100‑1 (MQ=255) cATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTc < 2:2242217/100‑1 (MQ=255) aTCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCg < 1:2228244/100‑1 (MQ=255) tCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGa > 1:1522638/1‑100 (MQ=255) ccATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGaa > 2:1124232/1‑100 (MQ=255) ccATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGaa > 1:2288962/1‑100 (MQ=255) aTGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGaaaa > 2:1003804/1‑100 (MQ=255) tGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGaaaaa > 1:1648205/1‑100 (MQ=255) gATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAAt > 2:2564150/1‑100 (MQ=255) gATCGAACGCGTGTTTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGTATGCTGCCTTATGGCATCATCAACAAGTTATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGaa < 2:1058753/96‑1 (MQ=255) cGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTg < 1:2118395/100‑1 (MQ=255) gAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGc > 2:2979726/1‑100 (MQ=255) gAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGc > 1:783921/1‑100 (MQ=255) gAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAAAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTg > 1:1797215/1‑99 (MQ=255) aaCTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGcc < 2:3235034/100‑1 (MQ=255) aCTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGTATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCa < 2:444004/100‑1 (MQ=255) cTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGCGATGTTTGAGGCGTTTGCCGCGTAGAAAAATTTGCCa > 1:1618985/1‑99 (MQ=255) cTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCaa > 1:1851533/1‑100 (MQ=255) gATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATTCGGATTCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAagag < 1:1402944/100‑1 (MQ=255) gATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAagag > 2:3619587/1‑100 (MQ=255) aacgcgTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCTAAAAGAGGATGcc < 2:1870701/98‑1 (MQ=255) cgcgTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCa > 2:3749277/1‑100 (MQ=255) cgTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGTCAAAAGAGGATGCCCa < 2:2485622/98‑1 (MQ=255) ccgttaaTATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATTTTTGAGGCGATTGCCACGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑Tg < 2:1749568/95‑1 (MQ=255) ccTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑t > 2:1217742/1‑99 (MQ=255) ccTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑Tg < 1:2357917/100‑1 (MQ=255) ccTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCACGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑Tg > 1:1454372/1‑100 (MQ=255) cTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑Tgg > 2:3556995/1‑100 (MQ=255) cTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑Tgg < 2:3229176/100‑1 (MQ=255) cTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑Tgg > 1:3456852/1‑100 (MQ=255) ttGAATTTTCGGATGTTGCCTTATGGCAGCATCAACACGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑Tgg < 1:2688904/99‑1 (MQ=255) ttGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAGAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑Tggg > 2:2805120/1‑100 (MQ=255) ttGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑Tggg < 2:142043/100‑1 (MQ=255) ttGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑Tggg < 1:975186/100‑1 (MQ=255) ttGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑Tggg < 1:762056/100‑1 (MQ=255) tGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGAAGCATCAAGAATAGGTGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCAAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGc < 2:415672/100‑1 (MQ=255) gAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCa < 1:2842227/100‑1 (MQ=255) atatCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGACGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCAtt > 1:168648/1‑100 (MQ=255) tatCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCAttt > 1:219532/1‑100 (MQ=255) ttgttgATGCTGCCATAAGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCAtttt > 1:1045558/6‑100 (MQ=39) tgttgATGCTGCCATAAGGCAGCATCCACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCATCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCACATACGC‑TGGGCAttt > 1:631715/5‑98 (MQ=37) tgttgATGCTGCCATAAGGCAGCATCAACAAGAGTTGTTTGAGGTGATTGTTGTGTCGAAAAATATGTTAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCAtttt > 1:3262525/5‑99 (MQ=25) tCCGGATGCTGCCTTATGGTAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCAtttt < 1:940832/99‑1 (MQ=255) tCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCA‑GCGCATGGGCAtcctc < 2:699720/100‑5 (MQ=255) gttgATGCTGCCATAAGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTcc > 2:632172/4‑100 (MQ=255) gttgATGCTGCCATAAGGCACCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTcc > 1:3694385/4‑100 (MQ=255) ccGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCA‑GCGCATGGGCAtcctct < 1:1808509/100‑6 (MQ=255) ccGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCA‑GCGCATGGGCAtcctct < 1:3669979/100‑6 (MQ=255) ttgATGCTGCCATAAGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCt > 1:118155/3‑100 (MQ=255) tgATGCTGCCATAAGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTg > 1:3728311/2‑100 (MQ=255) gATGCTGCCATAAGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTgc > 1:639590/1‑100 (MQ=255) gATGCTGCCATAAGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTgc > 2:156492/1‑100 (MQ=255) gATGCTGCCATAAGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTgc > 1:1665165/1‑100 (MQ=255) aTGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTgcg < 2:490958/100‑1 (MQ=255) aTGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTgcg < 1:2980541/100‑1 (MQ=255) aTGCTGCCATAAGGCAGCATCAACAAGCGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAAAGGATGCCAATGCAC‑TGGGCATTTTCCTgcg > 1:2467660/1‑100 (MQ=255) tgctgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGTCACAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGCCATTTTCCTgcgc < 2:2413035/100‑1 (MQ=255) tgctgcCATAAGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTgcgc > 1:1365199/1‑100 (MQ=255) ctgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGa > 2:1401361/1‑100 (MQ=255) ctgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGa > 2:3300931/1‑100 (MQ=255) ctgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGa > 2:1724478/1‑100 (MQ=255) tgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGAt < 1:1473204/100‑1 (MQ=255) tgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGAt < 2:1772460/100‑1 (MQ=255) gcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGAtt > 2:1111558/1‑100 (MQ=255) ccTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGAttt > 2:2872652/1‑100 (MQ=255) ttATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTaa < 1:715370/100‑1 (MQ=255) ttATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTaa > 2:3711963/1‑100 (MQ=255) | CGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACG > NC_000913/1285095‑1285291 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |