| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,215,832 | (C)5→6 | coding (645/732 nt) | yehW ← | putative ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,215,827 | 1 | . | C | 97.9% | 336.5 / 0.3 | 95 | coding (650/732 nt) | yehW | putative ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/0); new base C (50/43); total (52/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
GCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACG‑CCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGATCGTC > NC_000913/2215728‑2215919 | gCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACg < 2:136362/100‑1 (MQ=255) gCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACG‑ccc‑c < 1:2229329/100‑1 (MQ=255) ggTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACG‑ccc‑ccct > 2:2233233/1‑98 (MQ=255) gTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACG‑ccc‑ccctg > 1:385979/1‑97 (MQ=255) tataCCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACG‑ccc‑ccctgga < 1:996075/100‑6 (MQ=255) tataCCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACG‑ccc‑ccctgga < 1:285792/100‑6 (MQ=255) tataCCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCACCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACG‑ccc‑ccctgga > 2:1777970/1‑95 (MQ=255) ataCCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGAt < 2:2097719/100‑1 (MQ=255) taCCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATc < 1:1243176/100‑1 (MQ=255) taCCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATc < 2:2532911/100‑1 (MQ=255) taCCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATc < 1:1869096/100‑1 (MQ=255) ccTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATcac < 1:414783/100‑1 (MQ=255) cTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATcaca > 1:2640706/1‑100 (MQ=255) cTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATcaca > 1:1893459/1‑100 (MQ=255) tttATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACAt < 2:2846879/100‑1 (MQ=255) ttttGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATAcgc < 2:2042585/100‑1 (MQ=255) tttGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATAcgcg > 1:692413/1‑100 (MQ=255) tttGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATAcgcg > 2:1594516/1‑100 (MQ=255) tttGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATAcgcg > 1:519778/1‑100 (MQ=255) ttGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCgg < 1:849175/100‑1 (MQ=255) tGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGTACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGt > 1:1360566/1‑100 (MQ=255) tGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGt > 2:2538696/1‑100 (MQ=255) gCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTa < 1:2288742/100‑1 (MQ=255) cGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTAt > 1:268051/1‑100 (MQ=255) cGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTAt > 1:267983/1‑100 (MQ=255) gCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTaa < 1:144530/100‑1 (MQ=255) cTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTaaa < 2:2460406/100‑1 (MQ=255) tGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAAt < 1:2245639/100‑1 (MQ=255) tGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAAt > 1:815766/1‑100 (MQ=255) ggCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACTCCCC‑CCTGGATCACATATGCGGTATTAAATc < 1:2074341/100‑1 (MQ=255) ggCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATc > 2:2654259/1‑100 (MQ=255) gCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATcc < 1:601526/100‑1 (MQ=255) gCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATcc < 1:2246909/100‑1 (MQ=255) cTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCg < 1:416138/100‑1 (MQ=255) tAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGc > 2:1299441/1‑100 (MQ=255) aaGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCt > 2:920358/1‑100 (MQ=255) aGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTa > 1:1206377/1‑100 (MQ=255) aGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTa < 1:1594533/100‑1 (MQ=255) gcgcCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGTTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTa < 2:2963248/99‑1 (MQ=255) gcCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGc < 2:1625974/100‑1 (MQ=255) ccTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACG‑CCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGccc > 2:505996/1‑100 (MQ=255) tGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCg > 2:459725/1‑100 (MQ=255) tGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCg > 2:375897/1‑100 (MQ=255) tGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTCGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGccc < 2:1850060/99‑1 (MQ=255) cACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGcccatc < 1:2299585/100‑4 (MQ=255) cACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCgat > 1:1462307/1‑100 (MQ=255) aCCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCgatg < 2:2264087/100‑1 (MQ=255) aCCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCgatg < 2:1883580/100‑1 (MQ=255) aCCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCgatg > 2:1775613/1‑100 (MQ=255) ccAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCgatga > 1:2672438/1‑100 (MQ=255) gCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCgatgatga < 1:1558973/100‑1 (MQ=255) ccTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCgatgatgat < 2:1439601/100‑1 (MQ=255) tttCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTACGCCCGATGATGATgg > 1:965245/1‑100 (MQ=255) tttCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATgg > 1:2870863/1‑100 (MQ=255) ttCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATggg > 1:988136/1‑100 (MQ=255) ntCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATggg > 1:1693178/2‑100 (MQ=255) tCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGc < 2:819336/100‑1 (MQ=255) cAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCg > 2:1086450/1‑100 (MQ=255) cAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCg > 2:2430189/1‑100 (MQ=255) cAAAAAGGCGGTCAGCGATAATCACCGCCAGGGCGAACAGTAACG‑CCCTCCTGGATCAAATACGAGGTATTAAAGCCGCGAAGCCCGatgatgatg > 2:1339606/1‑96 (MQ=255) cAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTAcc > 2:2768275/1‑100 (MQ=255) cAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTAcc > 2:2897731/1‑100 (MQ=255) aGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTAccc < 1:2659530/100‑1 (MQ=255) ggTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCg > 2:910326/1‑100 (MQ=255) gCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTg > 1:429636/1‑100 (MQ=255) cGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTgg < 2:1960890/100‑1 (MQ=255) cGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTgg < 2:2864260/100‑1 (MQ=255) cGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTgg > 1:591987/1‑100 (MQ=255) cGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTgg > 1:1637002/1‑100 (MQ=255) gatgatCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGc > 2:2781181/1‑100 (MQ=255) atgatCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGcc < 1:2538719/100‑1 (MQ=255) atgatCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGcc > 1:1516872/1‑100 (MQ=255) atCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCt > 1:655816/1‑100 (MQ=255) atCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCt > 1:959727/1‑100 (MQ=255) cgccgcCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTAc > 2:2133042/1‑100 (MQ=255) cgccgcCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTAc > 2:499554/1‑100 (MQ=255) cgccgcCAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTAc < 2:1543688/100‑1 (MQ=255) gccgccAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTAcc < 2:2640682/100‑1 (MQ=255) gccgccAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTAcc > 1:376111/1‑100 (MQ=255) gccgccAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTAcc > 1:1917696/1‑100 (MQ=255) gccgccAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTAcc < 1:2806686/100‑1 (MQ=255) ccgccAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCg < 2:385977/100‑1 (MQ=255) cgccAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGt > 1:2279495/1‑100 (MQ=255) ccAGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTg < 1:1480370/100‑1 (MQ=255) aGTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAg < 1:2781208/100‑1 (MQ=255) gTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAgn < 2:2427986/100‑2 (MQ=255) gTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAgg < 2:2498000/100‑1 (MQ=255) gTGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAgg > 1:725899/1‑100 (MQ=255) tGCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGc < 2:388882/100‑1 (MQ=255) gCCACCAGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCg > 1:1326982/1‑100 (MQ=255) ccaccaGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGa < 2:1206367/100‑1 (MQ=255) caccaGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGAt > 2:1053918/1‑100 (MQ=255) caccaGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGAt < 1:2041748/100‑1 (MQ=255) accaGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGAtc < 1:1299452/100‑1 (MQ=255) accaGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGAtc > 1:2019010/1‑100 (MQ=255) caGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGTCCCTACCGTTGAGGCGAtcgt > 2:2283643/1‑100 (MQ=255) caGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGAtcgt > 1:1508047/1‑100 (MQ=255) caGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGAtcgt > 2:1888914/1‑100 (MQ=255) aGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGAtcgtc > 2:1703751/1‑100 (MQ=255) aGTAACGCCCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGAtcgtc < 1:1132008/100‑1 (MQ=255) | GCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACG‑CCC‑CCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGATCGTC > NC_000913/2215728‑2215919 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |