| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,950,955 | Δ1 bp | 17.3% | coding (124/567 nt) | yecD → | isochorismatase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,950,954 | 0 | G | . | 17.3% | 536.5 / 113.7 | 185 | coding (123/567 nt) | yecD | isochorismatase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (68/85); new base . (20/12); total (88/97) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.99e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
ACTGCGCTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGCCC > NC_000913/1950856‑1951050 | aCTGCGCTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTggcgg > 2:2092236/1‑100 (MQ=255) cTGCGCTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTggcggc > 1:3161406/1‑100 (MQ=255) cTGCGCTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTggcggc < 2:2628009/100‑1 (MQ=255) gttggtggTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGaaa < 1:2100816/98‑1 (MQ=255) gcTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCACCGGGAAGCTGGCGGCGaaa > 1:4266970/1‑100 (MQ=255) cTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAAt < 1:1513074/100‑1 (MQ=255) ggtggtGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAAttt > 2:2710516/1‑100 (MQ=255) gtggtgATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTc < 1:3878486/100‑1 (MQ=255) ggtgtgATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAAtt < 1:510277/95‑1 (MQ=255) gtgATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCGGGGAAGCTGGCGGCGAAAtttgg > 1:4304262/1‑96 (MQ=255) gtgATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTcg‑c‑g < 1:2544065/100‑1 (MQ=255) gATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑Gcc > 2:2191099/1‑100 (MQ=255) aTCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑Gcc < 2:1522049/99‑1 (MQ=255) tCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAg < 1:4213100/100‑1 (MQ=255) tCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGC‑GCGAAATTTCGCC‑GCCAg < 1:1830563/100‑1 (MQ=255) tCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGC‑GCGAAATTTCGCC‑GCCAg < 1:756480/100‑1 (MQ=255) cGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGc < 2:1041344/100‑1 (MQ=255) cGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGC‑GCGAAATTTCGCC‑GCCAg < 2:408929/99‑1 (MQ=255) cGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGC‑GCGAAATTTCGCC‑GCCAGc < 2:766870/100‑1 (MQ=255) cGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGC‑GCGAAATTTCGCC‑GCCAGc < 2:3245599/100‑1 (MQ=255) cGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGC‑GCGAAATTTCGCC‑GCCAGc < 2:3348482/100‑1 (MQ=255) cGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGC‑GCGAAATTTCGCC‑GCCAGc < 2:1695878/100‑1 (MQ=255) aTTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCgg < 2:846545/100‑1 (MQ=255) aTTTACAAGAAGGCATCTTACCGTTTGCCGGTGGGCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCGGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCgg < 1:2466661/100‑1 (MQ=255) ttACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTc > 1:3471136/1‑100 (MQ=255) ttACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTc < 2:4358673/100‑1 (MQ=255) aCAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAg > 1:3653673/1‑100 (MQ=255) cAAGGAGGCAGCTTACCTTTTGCCGGTGGTCGACATACTGCGGATGATGTAGGTAAGCGCGCCGGGAAGGTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGc < 1:903642/100‑1 (MQ=255) cAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAg > 2:1832087/1‑99 (MQ=255) cAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGc > 2:2009411/1‑100 (MQ=255) tagaagGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTTATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGcc < 1:2438853/99‑1 (MQ=255) agaagGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGccc > 2:1933753/1‑100 (MQ=255) agaagGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGcca > 2:2438864/1‑99 (MQ=255) aagGCATCTTAGCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGccc > 1:781048/1‑98 (MQ=255) agGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCgtg > 2:1175129/1‑100 (MQ=255) agGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCgtg < 2:884544/100‑1 (MQ=255) ggCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCgtg < 1:2935622/99‑1 (MQ=255) gCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGtt < 2:4393484/100‑1 (MQ=255) gCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGtt < 2:1466537/100‑1 (MQ=255) tCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCt > 2:2260730/1‑100 (MQ=255) cTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTg > 1:1961521/1‑100 (MQ=255) ttACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTgg < 2:3726350/100‑1 (MQ=255) ttACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTgg > 2:2674854/1‑100 (MQ=255) ttACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTgg > 2:1095252/1‑100 (MQ=255) tACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGt < 2:1994290/100‑1 (MQ=255) tACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGt < 2:828481/100‑1 (MQ=255) tACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGt > 2:2819308/1‑100 (MQ=255) aCCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTg > 2:1653051/1‑100 (MQ=255) ccTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAACCCGTGGTTCTGGTgc > 1:3615427/1‑100 (MQ=255) cTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTgcg > 2:584876/1‑100 (MQ=255) cTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTgcg < 1:2191334/100‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGGTCCACATACTTCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGcgcg < 1:1652883/99‑1 (MQ=255) tGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGtt > 1:1894789/1‑100 (MQ=255) tGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGtt < 2:3695607/100‑1 (MQ=255) tGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGtt < 2:4185219/100‑1 (MQ=255) gCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTg < 1:3001699/100‑1 (MQ=255) gCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTg > 2:3955030/1‑100 (MQ=255) gCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTg > 2:3865085/1‑100 (MQ=255) gtggtCCATATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGCAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGCTTATGGAGCGCGTTGGCTg < 1:650944/100‑1 (MQ=255) ggtCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGt > 2:4114778/1‑100 (MQ=255) ggtCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCACCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGt < 2:4267002/100‑1 (MQ=255) gtCCAGATACGGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTGCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTc < 1:3752640/100‑1 (MQ=255) gtCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGt < 1:986419/99‑1 (MQ=255) gtCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTc < 2:2397025/100‑1 (MQ=255) ccACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCt > 1:1063038/1‑99 (MQ=255) ccACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTg < 1:1183544/100‑1 (MQ=255) ccACATACTGAAAATGAGGAAGTGAATTGCGCATGTAAGCTGGCGGCGAAATTATT‑T‑GACAGCGGTAAGTCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTgg > 1:1253156/1‑92 (MQ=255) acaTACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGcc > 1:1048911/1‑100 (MQ=255) caTACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCg < 2:1430869/100‑1 (MQ=255) aTACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGa < 2:2153765/100‑1 (MQ=255) aTACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGa < 2:3554328/100‑1 (MQ=255) cTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTa > 2:1154403/1‑100 (MQ=255) cTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTa < 1:2259067/100‑1 (MQ=255) tGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTAc < 1:1095249/100‑1 (MQ=255) gCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACg < 1:2040527/100‑1 (MQ=255) ccGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGc < 1:4404098/100‑1 (MQ=255) gATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTg < 1:533602/100‑1 (MQ=255) gATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTCGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGc > 1:3511058/1‑98 (MQ=255) tGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGATGCTGGCGGGGAAAGTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATGACGc < 1:2669959/96‑1 (MQ=255) gTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTaa > 1:2497930/1‑100 (MQ=255) gTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTaa < 1:1426932/100‑1 (MQ=255) gTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTaa > 2:477539/1‑100 (MQ=255) tAATCGCGCCGGGAAGCTTGCGGTGAAATTTCG‑T‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTaaa < 1:311298/99‑1 (MQ=255) aTCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACa > 2:3810692/1‑100 (MQ=255) gcgcCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGcc > 2:2883601/1‑100 (MQ=255) cgcCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCg < 2:2417541/100‑1 (MQ=255) gggAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCg > 1:3962198/1‑100 (MQ=255) gAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGAt < 1:2764834/100‑1 (MQ=255) accgCTGGC‑GCGAAATTTCGCC‑GCCAGCGGTCAGCCCCTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGAt > 1:2354835/4‑100 (MQ=38) ccgCTGGC‑GCGAAATTTCGCC‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGAt > 1:833385/3‑99 (MQ=38) ccgCTGGC‑GCGAAATTTCGCC‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATg > 2:3844558/3‑100 (MQ=39) ccgCTGGC‑GCGAAATTTCGCC‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATg > 2:2390300/3‑100 (MQ=39) cgCTGGC‑GCGAAATTTCGCC‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATgc > 2:2546175/2‑100 (MQ=39) cgCTGGC‑GCGAAATTTCGCC‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATgc > 2:4240833/2‑100 (MQ=39) cgCTGGC‑GCGAAATTTCG‑CTGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTACAGGTGCGCGTTGGATGGTCTGCCGCTTACGCTGAAGCTTTAAACCAGCTGAGCGATg > 1:2434324/2‑99 (MQ=255) gCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATgcg < 2:1790706/100‑1 (MQ=255) gCTGGC‑GCGAAATTTCGCC‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATgcg > 1:4352362/1‑100 (MQ=255) tGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGcc > 2:3283864/1‑100 (MQ=255) tGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGcc < 2:2464244/100‑1 (MQ=255) tGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGcc < 2:1346172/100‑1 (MQ=255) | ACTGCGCTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑C‑GCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGCCC > NC_000913/1950856‑1951050 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |