| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,594,256 | (C)8→7 | 100% | pseudogene (3732/3861 nt) | yneO ← | pseudogene, AidA homolog |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,594,249 | 0 | C | . | 70.6% | 257.9 / 183.5 | 143 | pseudogene (3739/3861 nt) | yneO | pseudogene, AidA homolog |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (22/17); new base . (47/54); total (70/73) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.48e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.76e-01 | |||||||||||
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
CTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGAT > NC_000913/1594153‑1594348 | cTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑cccc > 2:1864005/1‑100 (MQ=255)cTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑cccc < 1:260566/100‑1 (MQ=255) tGCAGTTGTTACATTTTCCGACGTCACAGCGCTGTTATGGATATTCATGTGTTGACTTGCCATATTAATTGCAGAGTCGGAACTGAAAGCAATTT‑‑ccccc < 1:215002/100‑1 (MQ=255) cAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑ccccccc < 1:2172547/100‑1 (MQ=255) aGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑cccccccc < 1:3941009/100‑1 (MQ=255) tggtaACATTTCCCGACAACACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTTTGAACCGAAAGCAATTT‑‑cccccccacg < 1:1528492/100‑4 (MQ=255) ggtgACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑cccccccacga > 2:4299597/1‑96 (MQ=255) gtgACATTTCCCTACATCTCACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTATTTGCAGAGTCGGAACCGAAAGCATTTT‑‑CCCCCCCCACGa < 1:3256071/100‑1 (MQ=255) gtgACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGat > 2:4141418/1‑100 (MQ=255) cATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATcc > 2:2840314/1‑100 (MQ=255) cATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGAGATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTC‑CCCCCCCCACGatat > 1:3297268/1‑100 (MQ=255) aTTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCcg > 1:1803344/1‑100 (MQ=255) ttCCCGACATGACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGTACAGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCcgtc < 1:2899890/100‑1 (MQ=255) ttCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCcgtc < 1:3125328/100‑1 (MQ=255) cGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGGACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTAc > 1:461489/1‑100 (MQ=255) cGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTAc > 2:3732093/1‑100 (MQ=255) aCATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTAccc < 2:2480047/100‑1 (MQ=255) cATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTAccc < 2:2734796/100‑1 (MQ=255) cATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCt > 1:636068/1‑100 (MQ=255) aTCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTg < 2:2369540/100‑1 (MQ=255) tCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTg < 1:2631065/100‑1 (MQ=255) tCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTg > 1:667172/1‑100 (MQ=255) tCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTg > 2:2933093/1‑99 (MQ=255) cacaCCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGAt < 2:1803351/100‑1 (MQ=255) cacaCCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGAt > 1:3799195/1‑100 (MQ=255) acacCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATa < 2:3075311/100‑1 (MQ=255) cacCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATAc < 2:3836279/100‑1 (MQ=255) cTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATAcgccgc > 1:2044674/1‑100 (MQ=255) cTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATAcgccgc < 2:1966289/100‑1 (MQ=255) tGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCcgcg < 2:686706/100‑1 (MQ=255) tGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCcgcg < 2:740625/100‑1 (MQ=255) tATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGa > 1:1046437/1‑100 (MQ=255) tATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGa > 2:3295268/1‑100 (MQ=255) tATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGaa < 2:3702827/100‑1 (MQ=255) tATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGaa > 2:314903/1‑100 (MQ=255) aTGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAAt < 1:2346040/100‑1 (MQ=255) ttgATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAAt < 1:4342118/97‑1 (MQ=255) tGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATc > 1:3474384/1‑100 (MQ=255) ggATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATc < 1:3804287/100‑1 (MQ=255) ggATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCACCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCg < 2:1681205/100‑1 (MQ=255) gATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCg > 2:2117949/1‑100 (MQ=255) gATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCAAGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGaa > 1:436581/1‑96 (MQ=255) aatatTAATGTGTTGACTTGCCATATAAATGGCAGAGACGGAACCGAAAGAAAGTT‑‑GCCCCCGCACGTAATCGGATGTACCCTAATACACagcgccataa > 1:3076374/2‑94 (MQ=255) atatTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCgtt > 2:1654722/1‑100 (MQ=255) atatTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCgtt < 2:450948/100‑1 (MQ=255) tatTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGTAGAGTCGGAACCGAAAGCAATGT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCgttg < 1:996198/100‑1 (MQ=255) tatTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCgttg < 1:3341110/100‑1 (MQ=255) tagtAATGTTTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCTGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CACCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCgttg < 1:1833185/97‑1 (MQ=255) ttAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTCCCCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCgtt > 1:2930535/1‑100 (MQ=255) gtgtTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAagag > 2:1595046/1‑100 (MQ=255) tgtTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAaga > 1:1228699/1‑100 (MQ=255) tgtTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAagag > 2:2017076/1‑100 (MQ=255) tgtTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGt < 1:1293935/100‑1 (MQ=255) gtTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTc > 1:2770338/1‑100 (MQ=255) ttGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCa < 1:370628/100‑1 (MQ=255) ttGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTAGGAACCGAAAGCAATTT‑‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGt > 1:1413870/1‑99 (MQ=255) gACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAgg > 2:392069/1‑100 (MQ=255) gACCTGCCATATCAATTGCTGTTTCCGAACCGCAA‑CCATGT‑‑TCCCCCCCACGAGATCCCTCCTACCCTGATACGCCTCGGAATCg < 1:4269502/85‑1 (MQ=255) aCTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAgg < 1:129308/100‑1 (MQ=255) cTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAGCCGAAAGCAA‑TT‑‑CCCTCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGGGTCAGGAt < 1:3697269/100‑1 (MQ=255) tGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATcc > 2:618227/1‑100 (MQ=255) tGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATcc < 1:961403/100‑1 (MQ=255) gCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATccc > 2:3890474/1‑100 (MQ=255) gCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAA‑TT‑‑GCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATccc < 1:4409324/100‑1 (MQ=255) ccATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATccc > 2:4107408/1‑100 (MQ=255) cATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCgg < 2:471339/100‑1 (MQ=255) cATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCgg < 2:2205540/100‑1 (MQ=255) cATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCgg > 2:3665370/1‑100 (MQ=255) atatTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCgg < 1:3253493/100‑1 (MQ=255) atatTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCgg < 2:3835405/100‑1 (MQ=255) tatTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACAATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTa < 2:2527072/100‑1 (MQ=255) atTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTAc < 1:4067249/100‑1 (MQ=255) aaTGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTAccc > 2:1528675/1‑100 (MQ=255) ggCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGt > 1:718422/1‑100 (MQ=255) ggCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGtt > 2:1640228/1‑100 (MQ=255) gCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGttt < 2:779409/100‑1 (MQ=255) cAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGtttt < 1:1040090/100‑1 (MQ=255) agTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTc < 1:1137518/100‑1 (MQ=255) agTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTc < 1:3890445/100‑1 (MQ=255) gTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTca < 2:3382964/100‑1 (MQ=255) cGGAACCGAAAGCAATTTCCCCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTc < 1:3073163/100‑1 (MQ=255) cGGAACCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTcaca < 1:4278880/100‑1 (MQ=255) aCCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCac > 2:4054855/1‑100 (MQ=255) aCCGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCac < 2:2320384/100‑1 (MQ=255) ccGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCacc < 2:1339650/100‑1 (MQ=255) ccGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCacc < 1:149720/100‑1 (MQ=255) ccGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATACCGGTACCCAGTTTTGTCACATCacc > 2:53550/1‑100 (MQ=255) cGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccg > 1:385915/1‑100 (MQ=255) cGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccg > 2:1319869/1‑100 (MQ=255) cGAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccg > 2:2696693/1‑100 (MQ=255) gAAAGCAATTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCacc > 2:2650614/1‑100 (MQ=255) gAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGATTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgc > 2:438212/1‑100 (MQ=255) gAAAGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgc > 1:2406067/1‑100 (MQ=255) aaaGCAATTTC‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccg > 1:3438221/1‑100 (MQ=255) aaGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgcta > 1:4198903/1‑100 (MQ=255) aaGCAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgcta > 2:3621321/1‑100 (MQ=255) aGCAATTT‑‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgct < 1:271184/99‑1 (MQ=255) cAATTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgctaccg > 2:2349641/1‑100 (MQ=255) aaTTT‑‑‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgctaccgc < 2:1827363/100‑1 (MQ=255) ccccccccACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGAt > 1:1515069/1‑100 (MQ=255) | CTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑‑CCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGAT > NC_000913/1594153‑1594348 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |