| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3620614 | NA (NA) | 26 (0.180) | 12/166 | NT | 100% | coding (1423/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 3620635 | 0 (0.000) | coding (1444/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
CAGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAAcgtcag‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3620516‑3620614‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT < NC_000913/3620635‑3620531 CAGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAAC > 2:2913845/1‑100CAGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAAC < 2:2267403/100‑1CAGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAAC < 2:490649/100‑1CAGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAAC < 2:2266680/100‑1CAGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACACGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACAAGTTAAC > 1:3926306/1‑100 AGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACG > 1:669686/1‑100 AGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACG < 1:4141875/100‑1 AGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACG < 2:1152563/100‑1 GAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCCCCACAACCAGTTAAC > 1:1474731/1‑98 GAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGT > 1:3413247/1‑100 GAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACG < 1:802802/99‑1 AGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTC < 1:1731451/100‑1 AGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTC < 1:432433/100‑1 gtgCAGCTCGGATGTGGTGACGGGCCTCAGCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCA < 1:2368753/97‑1 GTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCA < 2:1447817/100‑1 GTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTC < 2:1294985/99‑1 TACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAG < 1:3558494/100‑1 TACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAG < 2:3063091/100‑1 TACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAG < 1:3223029/100‑1 TACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAG < 2:3425553/100‑1 TACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAG < 2:1779970/100‑1 TACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAG < 2:522218/100‑1 TGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCT < 1:2269510/100‑1 GGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGAC < 1:4385042/100‑1 TGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGT < 2:2785014/100‑1 GACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTT < 2:823934/100‑1 GACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTT > 2:4281775/1‑100 GACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTT < 2:1548625/100‑1 ACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTA < 2:3580659/100‑1 ACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTA < 2:3095449/100‑1 CGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAA < 1:2742977/100‑1 ggtCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAAC < 2:2273134/97‑1 gcGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAAC < 2:2275690/98‑1 GGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAAC < 1:1928195/100‑1 GGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAAC < 1:477911/100‑1 GGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACT < 2:1169641/100‑1 CCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGG < 2:1516234/100‑1 CCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGG < 2:1406881/100‑1 CTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACCACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAAttcgt < 1:2860064/100‑6 GCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTT < 2:1837877/100‑1 ACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAG > 1:3861844/1‑100 CCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGG > 2:4234444/1‑100 CAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGC > 1:264138/1‑100 CAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGC > 1:1488783/1‑100 CAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGC > 1:3989809/1‑100 AGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCC > 2:3033309/1‑100 AGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCC > 2:997485/1‑100 AGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGGTATGCGCGTGATGAGG > 1:1807090/1‑98 GTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCC > 2:3636486/1‑100 GTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCC > 2:3058755/1‑100 GTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCC > 1:4281743/1‑100 GTTAACGTCAGCC‑ACCGGGCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCC > 2:4227051/1‑100 TAACGTCAGCC‑ACCGGGCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGT > 1:2076581/1‑100 CGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCTGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCAC > 1:1053180/1‑100 CGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCAC < 2:892298/100‑1 CGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCAC > 2:2712949/1‑100 CGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCAC < 2:3479417/100‑1 CGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCAC > 1:919816/1‑100 GTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACC < 2:3230255/100‑1 GTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACC < 1:191226/100‑1 GTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACC < 2:3818712/100‑1 GTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACC < 1:972959/100‑1 GTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACC < 2:1081177/100‑1 GTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACC < 2:2093729/100‑1 GTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACC < 2:2632935/100‑1 GTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACC < 2:2468412/100‑1 TCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCA < 2:2410079/100‑1 TCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCA < 2:4221848/100‑1 TCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCA < 2:2792804/100‑1 TCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCA < 2:2595662/100‑1 CAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCAC > 2:2351686/1‑100 CAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCAC > 1:1124784/1‑100 AGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACA < 2:236321/100‑1 GGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT > 2:3168595/1‑100 GGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT > 1:4027309/1‑100 GGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT > 2:2462765/1‑100 CAGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAAcgtcag‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3620516‑3620614‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT < NC_000913/3620635‑3620531 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |