| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3898629 = | NA (NA) | 20 (0.140) | 11/162 | NT | NA | intergenic (+20/+42) | cbrC/yieK | UPF0167 family protein/putative 6‑phosphogluconolactonase |
| ? | NC_000913 | 3898659 = | NA (NA) | intergenic (+50/+12) | cbrC/yieK | UPF0167 family protein/putative 6‑phosphogluconolactonase | |||||
GCTGCATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3898734‑3898629‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tccggcctTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATC > NC_000913/3898659‑3898757 GCTGCATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTC > 1:1201214/1‑100GCTGCATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTC > 1:2705541/1‑100 TGCATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCG > 2:3714693/1‑100 GCATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGG < 1:1378632/100‑1 GCATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGG > 1:3346543/1‑100 GCATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGG > 1:1953911/1‑100 CATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGC > 2:2212215/1‑100 CATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGC < 2:3708429/100‑1 ATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCC < 2:3307928/100‑1 ATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCC < 2:2345393/100‑1 ATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCC > 2:1927068/1‑100 TCCTTCGCTGTTGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGATTGAGCTTAAGCAATAAGGCCGGATGTGTCAATTACTCTCCGGCC > 1:557715/1‑99 TCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCT > 2:1441281/1‑100 TCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCT > 2:3485305/1‑100 AGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCAGGATGTGTGAATTACGCTTCGGCCATATTTCTGAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGTGGCA > 1:730554/1‑98 ATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGC > 2:3458372/1‑100 CTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCA > 2:2227520/1‑100 CTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCA > 2:2690582/1‑100 TTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAATCGAGTACTACTTCTTCGTCAGCGGCTTTATAAGCGATTAC > 1:3139653/1‑97 TAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATC > 2:1205107/1‑100 AGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAG > 1:3600647/1‑100 AGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAACGGCTTTATCAGCGATTACCATCA > 1:3171676/1‑99 AAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCG > 1:304193/1‑100 AAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGG > 1:3158135/1‑100 AGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGA > 2:3152323/1‑100 AGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAG > 1:1716891/1‑98 AGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAG > 1:2670981/1‑98 GGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGAT > 1:3167922/1‑100 GGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCACCAGCGAAGGA > 1:1440081/1‑99 GCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATG > 2:3564974/1‑100 GCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATG > 1:1109845/1‑100 GCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATG > 2:1416233/1‑100 GCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATG > 2:1201923/1‑100 GCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATG > 1:552820/1‑100 CCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGG < 2:485408/100‑1 CCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGG < 2:581290/100‑1 CGGCCTTATTTCTTAAGCTTAGCCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTAGCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGA < 1:129927/100‑1 CGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAGGCTGGA > 1:1067963/1‑100 GGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACAAGGAAGATGGAA > 2:3018518/1‑100 GCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAAC < 1:3364180/100‑1 GCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAAC < 2:3716008/100‑1 GCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAAC < 2:3997565/100‑1 GCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAAC < 1:1050569/100‑1 GCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCCGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAAC < 1:1480650/100‑1 CCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACA > 2:3686552/1‑100 CTTATTTCTTAAGCTTAACAGAGTGCTAAATCTGCGGCAGCAGCTATATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGATTCTGGAACA > 1:2151314/1‑99 TTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATC < 2:403277/100‑1 GCTGCATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3898734‑3898629‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tccggcctTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATC > NC_000913/3898659‑3898757 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |