| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4344813 = | NA (NA) | 19 (0.130) | 13/160 | NT | NA | intergenic (+23/+116) | melB/yjdF | melibiose:sodium symporter/DUF2238 family inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | 4344842 = | NA (NA) | noncoding (28/95 nt) | RIP327 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences and 1 IHF site | RIP327 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences and 1 IHF site | |||||
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
ATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATC > NC_000913/4344714‑4344912 | ataaccggataacaacttgcgctttgttgatgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgt > 2:4056846‑M1/100‑100 (MQ=255) taaccggataacaacttgcgctttgttgatgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTg > 2:3380716‑M1/99‑100 (MQ=255) aaccggataacaacttgcgctttgttgatgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTgg > 1:357021‑M1/98‑100 (MQ=255) accggataacaacttgcgctttgttgatgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGc < 2:2916366‑M1/4‑1 (MQ=255) accggataacaacttgcgctttgttgatgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGc > 2:1363793‑M1/97‑100 (MQ=255) ccggataacaacttgcgctttgttgatgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattacaacgTgg < 1:2134016‑M1/3‑1 (MQ=255) atatCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCC < 2:1488415‑M1/100‑1 (MQ=255) atatCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCC < 1:2012536‑M1/100‑1 (MQ=255) atCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTG > 2:4271280‑M1/1‑100 (MQ=255) atCGCAAAGTACCGCCCGAGCATGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGAAGGGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCT > 2:776616‑M1/1‑99 (MQ=255) gataacaacttgcgctttgttgatgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCTGa < 1:1149933‑M1/8‑1 (MQ=255) ataacaacttgcgctttgttgatgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCTGAt < 2:3957286‑M1/9‑1 (MQ=255) ataacaacttgcgctttgttgatgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCTGAt < 2:4008387‑M1/9‑1 (MQ=255) cAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGc > 2:2019426/1‑100 (MQ=255) aaaGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCg > 1:3898642/1‑100 (MQ=255) aaGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGa > 2:504387/1‑100 (MQ=255) gTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATaaacat > 2:2565134‑M1/1‑94 (MQ=255) aCCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATg < 1:2256615/100‑1 (MQ=255) aCCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATg > 1:96160/1‑100 (MQ=255) aCCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATg > 2:4380197/1‑100 (MQ=255) ccGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGt > 1:2112121/1‑100 (MQ=255) ccGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGt < 2:1847040/100‑1 (MQ=255) gCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGttt < 2:1219647/100‑1 (MQ=255) gCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTCACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGttt > 1:2823094/1‑100 (MQ=255) cGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTatc > 2:1739122‑M2/1‑97 (MQ=255) aGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTatcag > 2:2661014‑M2/1‑95 (MQ=255) tgatgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGcc > 2:3019897‑M1/73‑100 (MQ=255) cTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTatcaggcc > 2:1833681‑M2/1‑92 (MQ=255) tGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATTGCTACCGAAAATGGCCAGATGCGATATGTTTatcacgcc < 1:3358600‑M2/99‑9 (MQ=255) tGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAGTGGCCTGATaaacatatcgcatcaggccn < 1:481908‑M1/100‑21 (MQ=255) tGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATaaccatatcgcatcaggcca < 1:3196462‑M1/100‑21 (MQ=255) tGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATaaacatatcgcatcaggcca < 1:4339636‑M1/100‑21 (MQ=255) ngtTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTatcaggcca < 2:2240531‑M2/99‑10 (MQ=255) gatgccggatgcgtcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccacagcattacattaagacgTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCa > 1:4285925‑M1/72‑100 (MQ=255) gatgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCa < 1:3019879‑M1/29‑1 (MQ=255) atgccgggtgcggtgtgaattccttatcctgtctacaaaatttgcaaatacaaagcattacattaagacgTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCAc > 1:4141854‑M1/71‑100 (MQ=255) atgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCAc > 1:868953‑M1/71‑100 (MQ=255) atgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCAc > 2:1929954‑M1/71‑100 (MQ=255) tgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACg > 2:3247015‑M1/70‑100 (MQ=255) gccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCAcgn > 2:2115078‑M1/69‑99 (MQ=255) gccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGt > 2:394066‑M1/69‑100 (MQ=255) ccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTc > 1:442348‑M1/68‑100 (MQ=255) cggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCt > 2:665579‑M1/67‑100 (MQ=255) aTGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCt > 2:728586/1‑100 (MQ=255) tGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCtt > 1:1035093/1‑100 (MQ=255) tGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCtt > 1:3851558/1‑100 (MQ=255) tGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGACACGTCtt > 2:948814/1‑100 (MQ=255) gCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATaaacatatcgcatcaggccattttcgt < 1:283076‑M1/100‑28 (MQ=255) gATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTtaatg < 1:2665941/100‑1 (MQ=255) ttCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTtaatgtaat > 1:3220344/1‑100 (MQ=255) ttCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTtaatgtaat > 2:2237603/1‑100 (MQ=255) ttCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTtaatgtaat > 2:520541/1‑100 (MQ=255) ccGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGc > 1:344033/1‑100 (MQ=255) cggtcggtGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCt > 1:2536653/1‑100 (MQ=255) ggtcggtGCAGTGAGTTATGTGAAAGCCTGACGTTGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTtaatgt < 1:1447717/93‑1 (MQ=255) tcggtGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTg < 1:2910489/100‑1 (MQ=255) tcggtGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTg < 2:3280297/100‑1 (MQ=255) cggtGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGTTGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTg < 1:526604/99‑1 (MQ=255) ggtGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGa > 2:2537649/1‑100 (MQ=255) ggtGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGa > 2:3319828/1‑100 (MQ=255) gtGCAGTAAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTg < 1:4380165/97‑1 (MQ=255) gCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACGATAGCGAACGAAAATGGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCACGGCTTAATGTAATGCTTTGGAtt > 1:1705610/1‑99 (MQ=39) cAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTg < 2:618656/100‑1 (MQ=255) atccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTg > 2:1621023‑M1/46‑100 (MQ=255) nagtgaTGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCaaa > 2:481830/2‑100 (MQ=255) tgtgAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGt < 2:1454198/100‑1 (MQ=255) gtgAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTa > 1:1171440/1‑100 (MQ=255) tgAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAg < 2:911786/100‑1 (MQ=255) gAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCACGCCACGTCTTAATGTAATACTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGa > 2:107726/1‑100 (MQ=255) aaGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGAcc < 2:2649543/100‑1 (MQ=255) gCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCgg < 2:3065535/100‑1 (MQ=255) gCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCgg < 2:2135775/100‑1 (MQ=255) tGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGACACGTCTTAATGTAATACTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACAGGATa > 1:2203659/1‑100 (MQ=255) cGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAgg < 2:2379052/100‑1 (MQ=255) cGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAgg < 1:501954/100‑1 (MQ=255) cGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAgg > 2:1389731/1‑100 (MQ=255) acgcattacattaagacgTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAAtt > 2:1527846‑M1/19‑100 (MQ=255) aTAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCAcg < 1:729846/100‑1 (MQ=255) tAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCAcgc < 2:3796496/100‑1 (MQ=255) tAGCTAACGAAAATGACCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCAcgc < 1:4034626/100‑1 (MQ=255) gCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCAcgccg > 1:2414709/1‑100 (MQ=255) cTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCAcgccgc > 2:3121815/1‑100 (MQ=255) aaCGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTattaggccattttcgttagctattgtccacgtcaggctttcacatcactcactgcaccgaccggaatatcag < 1:87074‑M2/100‑73 (MQ=255) aaCGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCAt > 1:2284320/1‑100 (MQ=255) aCGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATc > 1:2504247/1‑100 (MQ=255) cGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTatcaggccattttcgttagctattgtccacgtcaggctttcacatcactcactgcaccgaccggaatatcagca < 1:3148475‑M2/100‑75 (MQ=255) cGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCTCa > 1:4123107/1‑97 (MQ=255) cGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATcc > 1:1312087/1‑100 (MQ=255) gAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTatcaggccattttcgttagctattgtccacgtcaggccttcacatcactcactgcaccgaccggaatatcagcat < 1:1347926‑M2/100‑76 (MQ=255) gAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCCTCCg > 1:162425/1‑100 (MQ=255) aaaaTGGCCTGATGCGATATGTTTatcaggccattttcgttagctattgtccacgtcaggctttcacatcactcactgcaccgaccggaatatcagcatg < 2:4095260‑M2/100‑77 (MQ=255) aaaaTGGCCTGATGCGATATGTTTatcaggccattttcgttagctattgtccacgtcaggctttcacatcactcactgcaccgaccggaatatcagcatg < 2:693623‑M2/100‑77 (MQ=255) aaaTGGCCTGATGCGATATGTTTatcaggccattttcgttagctattgtccacgtcaggctttcacatcactcactgcaccgaccggaatatcagcatga < 2:3669465‑M2/100‑78 (MQ=255) aaaTGGCCTGATGCGATATGTTTatcaggccattttcgttagctattgtccacgtcaggctttcacatcactcactgcaccgaccggaatatcagcatga < 1:4224506‑M2/100‑78 (MQ=255) aTGGCCTGATGCGATATGTTTatcaggccattttcgttagctattgtccacgtcaggctttcacatcactcactgcaccgaccggaatatcagcatgaac < 1:2635728‑M2/100‑80 (MQ=255) aTGGCCTGATGCGATATGTTTatcaggccattttcgttagctattgtccacgtcaggctttcacatcactcactgcaccgaccggaatatcagcatgaac < 1:2636815‑M2/100‑80 (MQ=255) tGGCCTGATaaacatatcgcatcaggccattttcgttagctattgtccacgtcaggctttcacatcactcactgcaccgaccgtaatatcagcatgaaca < 2:2134023‑M1/100‑92 (MQ=255) tGGCCTGATGCGATATGTTTatcaggccattttcgttagctattgtccacgtcaggctttcacatcactcactgcaccgaccggaatatcagcatgaaca < 1:2565121‑M2/100‑81 (MQ=255) tGGCCTGATGCGATATGTTTatcaggccattttcgttagctattgtccacgtcaggctttcacatcactcactgcaccgaccggaatatcagcatgaaca < 2:340457‑M2/100‑81 (MQ=255) TGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATc > 2:1586599‑M1/1‑100 (MQ=255) | ATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATC > NC_000913/4344714‑4344912 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |