| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4596219 | 123 (0.780) | 4 (0.030) | 4/164 | NT | 3.2% | coding (230/1023 nt) | lgoD | L‑galactonate oxidoreductase; L‑gulonate oxidoreductase |
| ? | NC_000913 | = 4596231 | 129 (0.890) | coding (242/1023 nt) | lgoD | L‑galactonate oxidoreductase; L‑gulonate oxidoreductase | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
TTCATGCCTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTC > NC_000913/4596120‑4596318 | tCATGCCTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGTGAAAAATATTGCTGAt > 2:3848123/1‑100 (MQ=255) tGCCTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCGATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAACTATTGCTGATc < 1:4413516/98‑1 (MQ=255) tGCCTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCtt < 2:492214/100‑1 (MQ=255) gCCTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTa > 2:1695891/1‑100 (MQ=255) cTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTaaa > 2:854576/1‑100 (MQ=255) cTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTaaa > 1:221577/1‑100 (MQ=255) cTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTaaa < 2:1503654/100‑1 (MQ=255) ggTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATg > 2:2526345/1‑100 (MQ=255) gTGGAAATCAACCATTTTTTTTTTTTTTTCGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGTGTGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATgg > 1:3354322/1‑100 (MQ=255) tGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGt > 2:3919931‑M2/1‑99 (MQ=255) gAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGtca < 1:1190648‑M2/100‑4 (MQ=255) aaaTCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAACATGGtcag < 1:1823988‑M2/100‑5 (MQ=255) aTCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGtcagca > 2:3589171‑M2/1‑94 (MQ=255) tCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGtcagcaa > 1:2840598‑M2/1‑93 (MQ=255) cAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAg > 1:616499/1‑100 (MQ=255) cAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAg > 2:1831848/1‑100 (MQ=255) cAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAg < 2:1020405/100‑1 (MQ=255) cATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGttac > 1:3112500/1‑98 (MQ=255) ttttttAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCtg > 2:3325027/1‑100 (MQ=255) tttttAGTGATTCACGTGGTTTAGGCCATGAAATTGGTGGCGAGATGGTTGCGTTGGGTACAACTTTTCCTGATCTGAAAAATGGTCAGCAAGTGGCtgt < 1:508973/100‑1 (MQ=255) tttAGTTATCCTCGTGTTTTAGAACATTAAATTTGTAGGGAGATTTTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGAccatttttaagatcagcaatatttttacc < 1:1925621‑M1/100‑30 (MQ=255) tttAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGa < 1:741056/100‑1 (MQ=255) tAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATc < 2:375907/100‑1 (MQ=255) aGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATc < 1:1246225/99‑1 (MQ=255) gTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTACTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATccc > 2:155848/1‑100 (MQ=255) ttATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCt < 1:3768962/100‑1 (MQ=255) aTCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTa < 2:1186112/100‑1 (MQ=255) aTCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTa < 1:2432704/100‑1 (MQ=255) ccACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATg > 1:2807144/1‑100 (MQ=255) ccACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATg < 2:623041/100‑1 (MQ=255) ccACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATg < 1:2055214/100‑1 (MQ=255) cACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGCGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAACATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGt > 1:845526/1‑100 (MQ=255) cACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGt > 1:2000663/1‑100 (MQ=255) gtgtTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTa < 1:3898908/94‑1 (MQ=255) gtggTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGc > 1:1402741/1‑100 (MQ=255) tgtTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGcc > 2:3576132/1‑100 (MQ=255) gtTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATTTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCt > 1:2149867/1‑100 (MQ=255) gtTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCt > 1:3571481/1‑100 (MQ=255) gtTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCt > 2:1802753/1‑100 (MQ=255) gtTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCt > 1:863287/1‑100 (MQ=255) tttAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGt < 1:3257882/100‑1 (MQ=255) ttAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTc > 2:1735901/1‑100 (MQ=255) ttAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTAATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTc < 1:1882738/100‑1 (MQ=255) ccATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCaa > 2:4293072/1‑100 (MQ=255) ccATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATAGCTGTTCTTAACAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCaa > 1:3574109/1‑100 (MQ=255) cATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAAt > 1:158253/1‑100 (MQ=255) aaaTATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGccc < 2:401914/100‑1 (MQ=255) gtgGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCgtg < 2:2930263/100‑1 (MQ=255) gtgGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCgtg < 1:1058586/100‑1 (MQ=255) tgGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCgtgt < 1:1785304/100‑1 (MQ=255) tgGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCg > 1:2064385/1‑97 (MQ=255) ggggAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTa < 2:1306688/100‑1 (MQ=255) ggAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTaaa > 1:1285043/1‑100 (MQ=255) agaTTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAg < 2:2670947/100‑1 (MQ=255) agaTTGTTGGGCTGGGTAAAAATATGTCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTa < 1:1079953/96‑1 (MQ=255) tgttgGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCggg > 2:3420809/1‑100 (MQ=255) gttgGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGc < 1:1486278/100‑1 (MQ=255) gttgGGCTGGGTAAAAATATTGAAAAAAAAAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGc < 1:250075/100‑1 (MQ=255) ttgGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCg < 2:575598/100‑1 (MQ=255) tgGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGt < 1:1635026/100‑1 (MQ=255) tgGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGt < 2:1773349/100‑1 (MQ=255) gggCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTa > 2:3909835/1‑100 (MQ=255) ggCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTAc < 2:328854/100‑1 (MQ=255) gCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTAcc < 2:1627174/100‑1 (MQ=255) gCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTAcc < 1:2916537/100‑1 (MQ=255) gCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTAcc > 2:2140445/1‑100 (MQ=255) gTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGtcagcaatatttttacccagcccaacaatctccccacatatttcatggcctaaaacacgtggataactaaaa < 1:1174567‑M2/100‑73 (MQ=255) gTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTg > 2:281040/1‑100 (MQ=255) tAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGtcagcaatatttttacccagcccaacaatctccccacatatttcatggcctaaaacacgtggataactaaaaa < 1:3279472‑M2/100‑74 (MQ=255) tAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGc > 2:2220442/1‑100 (MQ=255) aaaaaTATTGCTGAGCTTAAAAATGGTCAGTAAGTTGCTGTGATCATTTCTGTTGCCTGTCAGCAATGCCGGGCGTGTAAAAACGGGCGTACCAATTg > 1:4063335/1‑98 (MQ=255) aaaaTATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCtg < 2:4265106/100‑1 (MQ=255) aaaaTATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCtg < 2:2798605/100‑1 (MQ=255) aaaTATTGCTGATCTTAAAAATGGtcagcaatatttttacccagcccaacaatctccccacatatttcatggcctaaaacacgtggataactaaaaaatg < 1:407349‑M2/100‑77 (MQ=255) aaaTATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCtgt < 2:2439948/100‑1 (MQ=255) ctcttccgATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGaa < 1:2307215/93‑1 (MQ=255) atTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGaaa < 2:1467738/100‑1 (MQ=255) ttGCTGAccatttttaagataagcaatatttttacccagcccaacaatctccccacatatttcatggcctaaaacacgaaaataaaaaaaaaatggttg < 1:1857176‑M1/99‑93 (MQ=255) tGCTGAccatttttaagatcagcaatatttttacccagcccaacaatctccccacatatttcatggcctaaaacacgtggataactaaaaaatggttgat > 1:4366133‑M1/1‑6 (MQ=255) tGCTGAccatttttaagatcagcaatatttttacccagcccaacaatctccccacatatttcatggcctaaaacacgtggataactaaaaaatggttgat > 1:555157‑M1/1‑6 (MQ=255) tGCTGAccatttttaagatcagcaatatttttacccagcccaacaatctccccacatatttcatggcctaaaacacgtggataactaaaaaatggttgat > 1:555170‑M1/1‑6 (MQ=255) tGCTGAccatttttaagatcagcaatatttttacccagcccaacaatctccccacatatttcatggcctaaaacacgtggataactaaaaaatggttgat > 2:1276786‑M1/1‑6 (MQ=255) tGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGCGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGaaaaa > 2:4183978/1‑100 (MQ=255) gCTGAccatttttaagatcagcaatatttttacccagcccaacaatctccccacatatttcatggcctaaaacacgtggataactaaaaaatggttgatt > 1:4389405‑M1/1‑5 (MQ=255) gCTGAccatttttaagatcagcaatatttttacccagcccaacaatctccccacatatttcatggcctaaaacacgtggataactaaaaaatggttgatt > 1:727881‑M1/1‑5 (MQ=255) cTGAccatttttaagatcagcaatatttttacccagcccaacaatctccccacatatttcatggcctaaaacacgtggataactaaaaaatggttgattt > 2:2521939‑M1/1‑4 (MQ=255) cTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAAt < 2:2062878/100‑1 (MQ=255) tGAccatttttaagatcagcaatatttttacccagcccaacaatctccccacatatttcatggcctaaaacacgtggataactaaaaaatggttgatttc > 2:1514134‑M1/1‑3 (MQ=255) tGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAAtt > 1:2374789/1‑100 (MQ=255) tGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAAtt < 1:3883960/100‑1 (MQ=255) gAccatttttaagatcagcaatatttttacccagcccaacaatctccccacatatttcatggcctaaaacacgtggataactaaaaaatggttgatttcc > 1:3703464‑M1/1‑2 (MQ=255) gAccatttttaagatcagcaatatttttacccagcccaacaatctccccacatatttcatggcctaaaacacgtggataactaaaaaatggttgatttcc > 2:1542300‑M1/1‑2 (MQ=255) gAccatttttaagatcagcaatatttttacccagcccaacaatctccccacatatttcatggcctaaaacacgtggataactaaaaaatggttgatttcc > 2:2267919‑M1/1‑2 (MQ=255) gATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCATGTAAGAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAAttt > 1:2967776/1‑100 (MQ=255) accatttttaagatcagcaatatttttacccagcccaacaatctccccacatatttcatggcctaaaacacgtggataactaaaaaatggttgatttcca < 2:2552324‑M1/100‑100 (MQ=255) accatttttaagatcagcaatatttttacccagcccaacaatctccccacatatttcatggcctaaaacacgtggataactaaaaaatggttgatttcca > 2:236542‑M1/1‑1 (MQ=255) accatttttaagatcagcaatatttttacccagcccaacaatctccccacatatttcatggcctaaaacacgtggataactaaaaaatggttgatttcca > 2:2331622‑M1/1‑1 (MQ=255) aTCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTc < 2:1416882/100‑1 (MQ=255) aTCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTc < 1:2533736/100‑1 (MQ=255) aTCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTc < 2:24745/100‑1 (MQ=255) | TTCATGCCTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTC > NC_000913/4596120‑4596318 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |