Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,743,165 | C→G | 15.1% | V26V (GTG→GTC) | ribC ← | riboflavin synthase, alpha subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,743,165 | 0 | C | G | 15.1% | 426.7 / 58.1 | 151 | V26V (GTG→GTC) | ribC | riboflavin synthase, alpha subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (61/67); new base G (6/17); total (67/84) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.90e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.54e-01 |
Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
GACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATCAG > NC_000913/1743066‑1743263 | gACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTcc > 1:2262147/1‑100 (MQ=255) tGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTccacca > 2:2641149/1‑100 (MQ=255) gTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACcaca < 1:961400/100‑1 (MQ=255) ttGCCGCTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATCCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCcaccac < 1:4325348/98‑1 (MQ=255) gCCGTTAATTTCCGTCGCGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTGGAGTTACCCGACCACATGc < 1:1416952/100‑1 (MQ=37) gCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTGGAGTTACCCGACCACATGc < 2:1716685/100‑1 (MQ=38) ccGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTGGAGTTACCCGACCACATGct < 2:2620377/100‑2 (MQ=37) ccGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTGGAGTTACCCGACCACATGct < 1:2949298/100‑2 (MQ=37) ccGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTGGAGTTACCCGACCACATGct < 1:1377948/100‑2 (MQ=37) ccGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑g < 1:3207232/100‑1 (MQ=255) cGTTGATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTGGAGTTACCCGACCACATGct < 1:997270/99‑2 (MQ=37) cGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTGGAGTTACCCGACCACATGctg < 2:2864203/100‑3 (MQ=37) cGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTGGAGTTACCCGACCACATGctg < 2:909155/100‑3 (MQ=37) cGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑Gt > 1:1536751/1‑100 (MQ=255) gTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTa > 2:3706930/1‑100 (MQ=255) gTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTa > 2:172983/1‑100 (MQ=255) gTTAATTTCCGTCACGGCCAGGCTGCACGCGTTATGCGCCACGGACGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTGGAGTTACCCGACCACATGctg < 1:3720004/99‑3 (MQ=21) tgattttGCGTCACGGGCAGACAGGAACCGTTATCGGCCACGGAAGCACCGGGTTCCAGGCGGTCCAGTATGTGGTGGAGTTACCCGACCACATGctg < 1:2177897/94‑3 (MQ=12) tAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACg < 1:3615378/100‑1 (MQ=255) aaTTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACg > 1:1195499/1‑99 (MQ=255) aTTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGaa > 1:1311751/1‑100 (MQ=255) tttCCGTCACGGTCAGGCAGCAGCCGTGATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGaa < 2:3913079/99‑1 (MQ=255) tttCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGaaa > 2:70920/1‑100 (MQ=255) ccGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAAtt < 1:108048/100‑1 (MQ=255) ccGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAAtt < 1:1859289/100‑1 (MQ=255) cGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAAttt > 2:1565966/1‑100 (MQ=255) gTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTg < 2:125508/100‑1 (MQ=255) tCACGTTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCGCCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTgg < 1:451939/100‑1 (MQ=255) tCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTgg > 2:2233768/1‑100 (MQ=255) tCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTgg > 1:4252402/1‑100 (MQ=255) tCACGGTCAAGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTgg < 1:4024551/100‑1 (MQ=255) aCGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGtt < 1:2630971/100‑1 (MQ=255) aCGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGt > 1:3986110/1‑99 (MQ=255) cGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGttt > 1:2476137/1‑100 (MQ=255) cGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGttt > 2:1790882/1‑100 (MQ=255) tCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTtctc < 2:1344895/100‑1 (MQ=255) cAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCg < 2:2271371/100‑1 (MQ=255) cAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGAAACGCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCg > 1:2975210/1‑100 (MQ=255) aGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGt > 2:2122247/1‑100 (MQ=255) ggCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTc < 1:3863457/100‑1 (MQ=255) gcagcaACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTCCTCGTCa > 1:2366584/1‑100 (MQ=255) ctggaaCCGATATGCGCGGCGGAAGCCCCGGTTCCCAGGCCGTCCAGCCTGTGGGCGGGTGCCTCCACCACATGC‑GTACGAAAATGTCGtt > 1:2495740/5‑91 (MQ=255) gcaACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATc < 1:2273658/100‑1 (MQ=255) caACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCg > 2:485741/1‑100 (MQ=255) aaCCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGa < 2:3383942/100‑1 (MQ=255) aCCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGATCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTGCTCGTCAATCGac < 1:2185297/100‑1 (MQ=255) gTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACAcc < 2:3142642/100‑1 (MQ=255) gTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACAcc > 1:2045162/1‑100 (MQ=255) tATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAg < 2:108217/100‑1 (MQ=255) gcCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTg < 1:1704872/100‑1 (MQ=255) ccACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGc < 2:2900792/100‑1 (MQ=255) aCGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCgg < 2:3329926/100‑1 (MQ=255) aCGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCgg > 1:88958/1‑100 (MQ=255) aCGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCgg < 2:3034196/100‑1 (MQ=255) cGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGt < 2:3291073/100‑1 (MQ=255) gCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCt < 1:950211/100‑1 (MQ=255) gCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCt > 2:3540217/1‑100 (MQ=255) cACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTg > 1:3280926/1‑100 (MQ=255) cACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTg < 2:1948730/100‑1 (MQ=255) cACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTg > 2:1775416/1‑100 (MQ=255) cACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTg < 2:3115538/100‑1 (MQ=255) cACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTg > 1:3885108/1‑100 (MQ=255) aCCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGt < 2:2539138/100‑1 (MQ=255) ccGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGt > 2:270105/1‑99 (MQ=255) ccGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTa > 2:797725/1‑100 (MQ=255) gTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACaa < 1:70920/100‑1 (MQ=255) tttCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAAt < 2:2905456/100‑1 (MQ=255) tCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATcc < 1:1843327/100‑1 (MQ=255) tCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATcc < 1:2238987/100‑1 (MQ=255) cAGGCCGTCCCGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGATACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATcccc < 1:2899750/100‑1 (MQ=255) cAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATcccc < 1:3395840/100‑1 (MQ=255) aGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCg < 1:797724/100‑1 (MQ=255) aGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCg > 2:2453216/1‑100 (MQ=255) aGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCg < 2:4290696/100‑1 (MQ=255) gCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTa > 1:544937/1‑100 (MQ=255) ccGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTaa > 1:98216/1‑100 (MQ=255) tCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACa > 2:1293283/1‑100 (MQ=255) gtacgCATGTGGTGGAGTTACCCGACCACATGCTGGACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAAc > 2:1870862/5‑100 (MQ=18) tacgCATGTGGTGGAGTTACCCGACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGCCACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACAt > 1:1422367/4‑100 (MQ=25) cAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATa > 2:3340852/1‑100 (MQ=255) cAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATa < 2:1162033/100‑1 (MQ=255) aGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATAc > 2:2114392/1‑100 (MQ=255) gCATGTGGTGGAGTTACCCGACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCACTCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACt > 1:578746/1‑100 (MQ=37) gCATGTGGTGGAGTTACCCGACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACt > 2:640503/1‑100 (MQ=38) cATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACtt > 1:765001/1‑100 (MQ=255) aTGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACtt < 1:1657503/99‑1 (MQ=255) aTGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTa < 1:4237457/100‑1 (MQ=255) tgtgGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACTAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTAc < 2:2577288/100‑1 (MQ=255) gtgGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACa < 2:2716714/100‑1 (MQ=255) ggTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAAc > 2:3910093/1‑100 (MQ=255) cGGGTGACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTcc > 1:410732/1‑100 (MQ=255) cGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTcc > 1:3231611/1‑100 (MQ=255) gTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGa < 1:3801035/100‑1 (MQ=255) gTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTCTTGCGGTGCCCTGTACAATCACCCTAAACATACTTCCACCTCCTGa > 1:3669913/1‑100 (MQ=255) tAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGaa > 1:1009582/1‑100 (MQ=255) aaCTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGaaa > 2:75903/1‑100 (MQ=255) aCTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAAt > 2:1435703/1‑100 (MQ=255) cTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAAt > 1:4318091/1‑99 (MQ=255) ccaccaCATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATCAg < 2:2228807/100‑1 (MQ=255) ccaccaCATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATCAg > 1:3126217/1‑100 (MQ=255) | GACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATCAG > NC_000913/1743066‑1743263 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |