Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,903,571 | A→G | 61.7% | T164A (ACC→GCC) | manY → | mannose‑specific enzyme IIC component of PTS |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,903,571 | 0 | A | G | 61.7% | 106.8 / 134.8 | 133 | T164A (ACC→GCC) | manY | mannose‑specific enzyme IIC component of PTS |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (21/30); new base G (32/50); total (53/80) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.56e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.31e-01 |
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
CAACCTGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGG > NC_000913/1903474‑1903670 | cAACCTGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGcc < 1:3016003/100‑1 (MQ=255) cAACCTGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTAcc < 1:3008027/100‑1 (MQ=255) cAACCTGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTAcc < 2:314839/100‑1 (MQ=255) aCCTGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAg > 2:579159/1‑100 (MQ=255) aCCTGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAg > 2:4315142/1‑100 (MQ=255) aCCTGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAg > 1:2982747/1‑100 (MQ=255) cTGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCg < 1:2781050/100‑1 (MQ=255) tGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGTCGTCATCGTTGCGCTGTCGGTTGGTACCAGCGa < 1:752301/100‑1 (MQ=255) gACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGaa > 2:2827071/1‑100 (MQ=255) gACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGaa < 1:1186169/100‑1 (MQ=255) gACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGaa > 1:3090866/1‑100 (MQ=255) actgCGATGTCCTGGATGCAGGTTTCTTCTCTTTTCCTGTAAGCACTGCGTGCGGCTATTCCGGCCGTGATCGTTGCGCTGTCTGTTGGAGCCAGCGAAg < 1:958880/97‑1 (MQ=255) aCAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAg < 2:1950819/100‑1 (MQ=255) cAGTGATTTCCTGGATTCACGTTTCTTCTCTGTGCCTGCAAGCAATGCGTGTGTCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAg < 1:1979911/99‑1 (MQ=255) cAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGt > 1:1689173/1‑100 (MQ=255) cAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGt > 2:3156391/1‑100 (MQ=255) gCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTAc < 1:4065028/100‑1 (MQ=255) gCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTAc > 1:2756841/1‑100 (MQ=255) gCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGGACCAGCGAAGTAc < 2:2965080/100‑1 (MQ=255) cGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGGGCCAGCGAAGTa > 1:1579353/1‑98 (MQ=255) gATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAg < 2:476150/100‑1 (MQ=255) gATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAg > 2:1814999/1‑100 (MQ=255) tttCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCCTCGTTGCGCTGTCTGCTGGTGCCAGCGAAGTACAg > 1:3520938/1‑98 (MQ=255) tttCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGaa < 2:4176737/100‑1 (MQ=255) ttCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGGGGGGGGCTATCCGGGCCGTCACCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAAc < 1:4407254/100‑1 (MQ=255) ttCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAAc < 2:1356439/100‑1 (MQ=255) ttCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGCCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAAc > 1:2592516/1‑100 (MQ=255) ccTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACAt > 2:548610/1‑100 (MQ=255) gATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTg < 2:3427610/100‑1 (MQ=255) gATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTg > 2:4202354/1‑100 (MQ=255) ccACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAAt > 2:4357031/1‑100 (MQ=255) cACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATg > 2:480769/1‑100 (MQ=255) cACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATg > 2:4203299/1‑100 (MQ=255) aCGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGc < 2:5835/100‑1 (MQ=255) aCGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGc < 2:1689180/100‑1 (MQ=255) cGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCg < 1:1411841/100‑1 (MQ=255) cGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCACCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCg < 1:998686/100‑1 (MQ=255) tcttctCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTc < 2:2451802/100‑1 (MQ=255) tcttctCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTc < 2:636760/100‑1 (MQ=255) cttctCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTcc < 1:2582752/100‑1 (MQ=255) ttctCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTccn < 1:1665469/100‑2 (MQ=255) ctctGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGa > 2:4075096/1‑100 (MQ=255) ctctGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCgg > 2:3977955/1‑99 (MQ=255) ctctGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGa < 2:3149380/100‑1 (MQ=255) tctTTTCCTTCAAGCAATGCGTATGGCTATTCCGGCAGTCATCGTTGCGTTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGaa < 1:3380175/100‑1 (MQ=255) tctGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGaa < 1:4202323/100‑1 (MQ=255) gTTCCTGCAAGCAATGCGTTTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAgtg < 1:2331022/100‑1 (MQ=255) ttCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAgtgg < 2:1734275/100‑1 (MQ=255) tCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCTGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAgtggt > 1:3435489/1‑100 (MQ=255) ccTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAgtggtg > 1:3835066/1‑100 (MQ=255) ccTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAgtggtg < 2:1897434/100‑1 (MQ=255) ccTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAgtggtg < 2:1551070/100‑1 (MQ=255) cggcaagcaaTGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTTATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGa < 1:74831/98‑1 (MQ=255) cTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAgtggtg < 1:1000308/99‑1 (MQ=255) cTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGa > 1:2043034/1‑100 (MQ=255) cTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGa > 2:3407251/1‑100 (MQ=255) tGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGAc > 2:1015049/1‑100 (MQ=255) gcaagcaaTGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGAcc < 1:1255381/100‑1 (MQ=255) gcaagcaaTGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGAcc < 2:3573536/100‑1 (MQ=255) gcaagcaaTGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGAcc < 2:2135383/100‑1 (MQ=255) agcaaTGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAAt > 2:3657110/1‑100 (MQ=255) caaTGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATgg < 1:3786878/100‑1 (MQ=255) caaTGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGCAGTGGTGACCAATgg > 1:653044/1‑100 (MQ=255) tGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCt < 2:3062345/100‑1 (MQ=255) tgGCTCTTCCTGCCGTCCTCGGTGCGCTGCCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAAAACATGCTGACTGCGATTCCGGAAGTGGTGAACAATGGTCTGAata > 1:146530/1‑99 (MQ=255) ggCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAatata > 2:1988047/1‑99 (MQ=255) gCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCg > 2:2199105/1‑100 (MQ=255) aTTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCg > 2:2363547/1‑100 (MQ=255) ccGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTg > 2:1275772/1‑100 (MQ=255) ccGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCACCGGTg > 2:839225/1‑100 (MQ=255) cGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTgg < 2:352499/100‑1 (MQ=255) cGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTgg < 2:3854409/100‑1 (MQ=255) cGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCGGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTgg < 1:274619/100‑1 (MQ=255) ggCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTgg < 1:1321020/99‑1 (MQ=255) ggCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGc < 1:1688954/100‑1 (MQ=255) ggCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGc > 1:1654421/1‑100 (MQ=255) gCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCa > 2:2192849/1‑100 (MQ=255) cGTCATCGTTGCGCTGTCGGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCAt < 2:4017693/99‑1 (MQ=255) tCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGAt < 1:4396167/100‑1 (MQ=255) aTCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCg < 1:323846/100‑1 (MQ=255) cGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCgtg < 2:1526221/100‑1 (MQ=255) cGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCgtg < 1:2241835/100‑1 (MQ=255) cGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCgtg < 2:739028/100‑1 (MQ=255) gTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCgtgg > 2:1985681/1‑100 (MQ=255) gTTGCGATGTCTGTTGGGGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGGGCGGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCgtgg < 1:4203268/100‑1 (MQ=255) ttGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCgtggt < 2:4318689/100‑1 (MQ=255) ttGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCgtggt < 1:3317143/100‑1 (MQ=255) tGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCgtggtg < 2:2627241/100‑1 (MQ=255) gcgcTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACAGGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATCATCGtggtgg < 1:3778728/100‑1 (MQ=255) cgcTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCTCCGGTGGCATGATCGTggtggt < 1:2560906/100‑1 (MQ=255) gcTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGtggtt > 1:3878940/1‑100 (MQ=255) ctgtctgtTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGtggttg < 2:1760768/100‑1 (MQ=255) tgtctgtTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGtggttgg > 1:4044073/1‑100 (MQ=255) tctgtTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTggttggtt < 2:3920290/100‑1 (MQ=255) tctgtTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTggttggtt < 2:3640601/100‑1 (MQ=255) ctgtTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTa < 2:3998524/100‑1 (MQ=255) ctgtTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTa > 2:1825429/1‑100 (MQ=255) gtTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATg < 1:4239696/100‑1 (MQ=255) ggTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGa > 2:1298631/1‑100 (MQ=255) aCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATgg < 1:445352/100‑1 (MQ=255) | CAACCTGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGG > NC_000913/1903474‑1903670 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |