| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,304,221 | C→T | 24.3% | A106V (GCC→GTC) | eco → | ecotin, a serine protease inhibitor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,304,221 | 0 | C | T | 24.3% | 300.4 / 96.9 | 172 | A106V (GCC→GTC) | eco | ecotin, a serine protease inhibitor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (68/62); new base T (21/21); total (89/83) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.60e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.50e-01 | |||||||||||
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
TCGTCTCGGCGGGAAGCTGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCGTGGTGTATAC > NC_000913/2304123‑2304320 | ggctcGGCGGGAAGCTGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTAGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGcc < 1:3828889/96‑1 (MQ=255) gTCTCGGCGGGAAGCTGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATCATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTg < 2:1224495/100‑1 (MQ=255) gTCTCGGAGGGAAGATGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCACGGTTTCAACGATGATGGCCTg < 1:3613781/100‑1 (MQ=255) tctcGGCGGGAAGCTGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGc < 2:1501845/100‑1 (MQ=255) ctcGGCGGGAAGCTGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGcc > 2:3423855/1‑100 (MQ=255) gggAAGCTGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGAt < 1:2295319/99‑1 (MQ=255) gAAGCTGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGc < 1:1333116/100‑1 (MQ=255) aaacTGGAAAAGAAAACGCTGTAAACCTAGCGCTATGATTATTATGTCTTTAATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGAAt < 1:878227/93‑1 (MQ=255) aaGCTGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCa < 2:2794366/100‑1 (MQ=255) aaGCTGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCa < 1:4063301/100‑1 (MQ=255) gCTGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCaag > 2:1370548/1‑100 (MQ=255) tGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCaagaa > 2:683399/1‑100 (MQ=255) nggAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCCTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGCCaagaa > 1:1775285/2‑100 (MQ=255) aaaacgaaacGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCaagaaag < 1:2846721/99‑1 (MQ=255) aaaacaaaacGCTGGAAGGCTGGGGCTATCATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTACCAGGTTTCAACGATGATGGCATGCCCGGATGGCaagaaaga < 1:524639/100‑1 (MQ=255) aaacaaaacGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAagag < 2:613375/100‑1 (MQ=255) aacaaaacGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAgaga < 2:4077145/100‑1 (MQ=255) acaaaacGCTGGCAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCTCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGagaa > 1:2547825/1‑100 (MQ=255) acaaaacGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGagaa > 2:3510174/1‑100 (MQ=255) acaaaacGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGagaa > 1:179939/1‑100 (MQ=255) caaaacGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGagaag > 1:3530578/1‑100 (MQ=255) caaaacGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGagaag > 2:2285532/1‑100 (MQ=255) caaaacGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGagaag > 1:2960259/1‑100 (MQ=255) caaaacGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCAGGTTTCAACGATGATGGCCTGCGCGGATGGCAAGAAAGagaag > 1:4040653/1‑100 (MQ=255) aaacGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAgaagaa > 2:2637426/1‑100 (MQ=255) aacGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGaaa > 2:1940470/1‑100 (MQ=255) cGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAAtt < 2:3060717/100‑1 (MQ=255) cGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTACAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAAtt < 1:2146701/100‑1 (MQ=255) gcgagAAGCCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTAAACAATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGACAAGAAAttt < 1:4415252/96‑1 (MQ=255) cTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTg < 2:1154068/100‑1 (MQ=255) cTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTg > 2:3687672/1‑100 (MQ=255) tGGAAGGGTGGGGCTATGATTAGTATGTCTCCGATAAAGTAAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTg < 1:2733787/99‑1 (MQ=255) ggAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTg < 1:2542342/98‑1 (MQ=255) ggAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTc > 2:2762436/1‑100 (MQ=255) ggAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTc < 2:909502/100‑1 (MQ=255) gAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCa > 1:1209019/1‑100 (MQ=255) aGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCAcc < 1:467762/100‑1 (MQ=255) aGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATCGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCAcc < 2:2684978/100‑1 (MQ=255) cTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACcgcg > 1:307698/1‑100 (MQ=255) cTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACcacg < 1:3254911/100‑1 (MQ=255) ggCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATc > 2:4254999/1‑100 (MQ=255) gCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCt < 2:3642923/100‑1 (MQ=255) gCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCt < 1:3567483/100‑1 (MQ=255) tATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTgg > 2:1427955/1‑100 (MQ=255) aTGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTggg < 2:3932613/100‑1 (MQ=255) tGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGc > 1:4297881/1‑100 (MQ=255) tGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGc > 1:1754709/1‑100 (MQ=255) gaatataatGTCATTGATAAATTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGTTCTGCTCGAGTGGCAAGAACGAGGAGAGATTTGTGCCCGCGTAACTg > 1:1834125/4‑96 (MQ=255) attattATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGa > 2:4090058/1‑100 (MQ=255) tatGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTg > 1:3429748/1‑100 (MQ=255) atGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTgg > 1:4356372/1‑100 (MQ=255) gTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGaa > 2:1292092/1‑100 (MQ=255) gTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGaa < 1:3415426/100‑1 (MQ=255) gTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGCGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGaa > 1:746672/1‑100 (MQ=255) gTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGACGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGaa > 1:3369541/1‑100 (MQ=255) tCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGACAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAAt > 1:3103552/1‑100 (MQ=255) tCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAAt < 1:1310094/100‑1 (MQ=255) tCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAAt < 2:1632747/100‑1 (MQ=255) cTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAAtg > 1:1709517/1‑100 (MQ=255) cTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAAtg > 1:2803558/1‑100 (MQ=255) tttGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCCCCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAAtgc > 2:3678728/1‑100 (MQ=255) ttGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAAtgct < 2:225934/100‑1 (MQ=255) ttGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAAtgct > 2:2035767/1‑100 (MQ=255) tGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAAtgc < 1:1271019/98‑1 (MQ=255) gATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAAtgctgc < 1:3245639/100‑1 (MQ=255) aTAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCg < 2:612648/100‑1 (MQ=255) aTAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCg > 2:2376713/1‑100 (MQ=255) tAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGt > 2:15984/1‑100 (MQ=255) tAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGt < 2:4348670/100‑1 (MQ=255) tAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGt > 1:927406/1‑100 (MQ=255) aGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGGAGAAAGTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTac < 1:3888874/100‑1 (MQ=255) aGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTac > 1:1181579/1‑100 (MQ=255) aGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTac > 2:2604489/1‑100 (MQ=255) tccgatctcccGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTaca < 1:3150626/92‑1 (MQ=255) gTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTaca < 2:2468168/100‑1 (MQ=255) gTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTaca > 1:3949321/1‑100 (MQ=255) tCAGTTCCCCGGTTTAAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTacaa < 2:4338309/100‑1 (MQ=255) aGTTCCTCGTTTTCAACTTTGATGGCCTGCCCGGAAGGCAAGAAATAGAAGAAATTTCTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTaaa < 1:819425/97‑3 (MQ=255) aGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTacaaca < 2:22025/100‑1 (MQ=255) ttCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGc > 2:3002338/1‑100 (MQ=255) cccGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAg > 2:2940124/1‑100 (MQ=255) cccGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTacaagatcgga > 2:3150644/1‑93 (MQ=255) cccGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAg > 2:3599961/1‑100 (MQ=255) ccGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGc < 2:833278/100‑1 (MQ=255) ccGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGc < 2:3535756/100‑1 (MQ=255) gTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGc > 1:193998/1‑100 (MQ=255) tttCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGcc < 2:3378889/100‑1 (MQ=255) ttCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGAGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCACGCTGcc > 1:59895/1‑99 (MQ=255) cAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGAt > 1:4020724/1‑100 (MQ=255) cAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGAt > 1:562958/1‑100 (MQ=255) cAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGTCGAt > 1:1645958/1‑100 (MQ=255) aCGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCg > 1:1107665/1‑100 (MQ=255) cGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCgt > 1:1831233/1‑100 (MQ=255) atgatgGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCgtgg < 1:1503089/100‑1 (MQ=255) gatgGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCgtggtg < 2:1759888/100‑1 (MQ=255) atgGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCGTGgtgt > 1:3216005/1‑100 (MQ=255) tgGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCGTGGTGta > 2:161884/1‑100 (MQ=255) ggCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCGTGGTGtat < 2:1753383/100‑1 (MQ=255) ggCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCGTGGTGtat > 2:1848950/1‑100 (MQ=255) ccTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACAGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCGTGGTGTATAc > 1:2363617/1‑100 (MQ=255) | TCGTCTCGGCGGGAAGCTGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCGTGGTGTATAC > NC_000913/2304123‑2304320 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |