| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 285,204 | C→T | 16.8% | intergenic (+36/‑191) | yagF → / → yagG | CP4‑6 prophage; dehydratase family protein/CP4‑6 prophage; putative sugar transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 285,204 | 0 | C | T | 16.8% | 295.3 / 46.7 | 130 | intergenic (+36/‑191) | yagF/yagG | CP4‑6 prophage; dehydratase family protein/CP4‑6 prophage; putative sugar transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/73); new base T (4/18); total (39/91) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.13e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.05e-01 | |||||||||||
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
TATTTATGACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATA > NC_000913/285105‑285303 | tATTTATGACATTGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAACAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTc < 1:4093427/100‑1 (MQ=255)tATTTATGACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTc > 2:3527496/1‑100 (MQ=255) aTTTATGACACCTATAAAATTATCGAGTTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTcc < 1:891336/100‑1 (MQ=255) aTTTATGACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTcc > 2:3460212/1‑100 (MQ=255) tttATGACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGATAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTccc < 2:4133133/100‑1 (MQ=255) tATGACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGc < 2:245447/100‑1 (MQ=255) aTGACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCa > 2:2866702/1‑100 (MQ=255) aTGACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCa > 2:32077/1‑100 (MQ=255) tGACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAg > 2:546916/1‑100 (MQ=255) acacCAATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGT‑AAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACg < 2:4176335/100‑1 (MQ=255) cacCGATAAAATTATCGAGTTAATTATCGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATCTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGGAAATATTCCGCAGACg < 1:686016/100‑1 (MQ=37) cacCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAGCCGTCTGCGGGAAATATTCCGCAGACg < 2:1449713/100‑1 (MQ=37) cacCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGGAAATATTCCGCAGACg < 1:1774496/100‑1 (MQ=38) cacCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACg < 2:3918378/100‑1 (MQ=255) cacCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACg > 2:3278747/1‑100 (MQ=255) cacCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACg > 2:3437230/1‑100 (MQ=255) acCGATAAAATTATCGATGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGGAAATATTCCGCAGACgg < 1:2480078/100‑1 (MQ=38) acCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGGAAATATTCCGCAGACgg < 2:1246764/100‑1 (MQ=38) acCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGGAAATATTCCGCAGACgg < 1:3987300/100‑1 (MQ=38) acCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACgg > 2:2495086/1‑100 (MQ=255) aacGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTGAAGAGATAAAACCGTCTGCGGGAAATATTCCGCAGAc < 1:3107839/96‑1 (MQ=37) ccGATACCATTATCGAGGTAATTCACGCCGGTAAAACAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATATAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGAct < 1:1813463/98‑2 (MQ=255) ccGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGGAAATATTCCGCAGACggt < 2:2289226/100‑2 (MQ=38) gagaagaTTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCtt < 1:4044569/94‑1 (MQ=255) gATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGGAAATATTCCGCAGACggt < 2:3212944/98‑2 (MQ=38) aTAAAATTATCGAGGTAATTAATGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGCGATAAAACCGTCTGCGGGAAATATTCCGCAGACggt < 2:3106006/97‑2 (MQ=37) aTAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCttt < 1:1221180/100‑1 (MQ=255) tAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGGAAATATTCCGCAGACGGtttta < 1:2600819/100‑2 (MQ=37) tAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTCTAAAAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCttcg > 2:400874/1‑98 (MQ=255) aaaaTTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTttgt < 2:2326897/100‑1 (MQ=255) aaTTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTttgttg > 2:1721624/1‑100 (MQ=255) aaTTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTttgttg < 1:3611581/100‑1 (MQ=255) aTTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGGAAATATTCCGCAGACGGttttatctc < 1:3804098/100‑6 (MQ=25) ttATCGAGGTAATTAACGCCAGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTtgttgt < 2:3131348/99‑1 (MQ=255) aTCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGtttt < 1:3342774/100‑1 (MQ=255) aTCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGtttt < 1:2638257/100‑1 (MQ=255) cGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTg < 2:2263113/100‑1 (MQ=255) cGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTg < 2:3617050/100‑1 (MQ=255) gAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGa < 2:187989/100‑1 (MQ=255) gTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAAt < 1:2320264/100‑1 (MQ=255) tAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTGTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAAtt < 1:3746703/100‑1 (MQ=255) aTTAACGAAAGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATtta < 1:1693923/100‑1 (MQ=255) tAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCTGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATttatt < 2:2966807/100‑1 (MQ=255) tAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATttatt > 2:37011/1‑100 (MQ=255) tAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATttatt > 2:2540534/1‑100 (MQ=255) aaCGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATttatta < 1:2035034/100‑1 (MQ=255) gCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAAtt < 2:2201726/100‑1 (MQ=255) ggTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTaa < 2:1381340/100‑1 (MQ=255) gTAAAAAAGTGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAATCCTTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTaaa < 1:1101251/100‑1 (MQ=255) tAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAAc < 1:506638/100‑1 (MQ=255) tAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAAc > 2:1779013/1‑100 (MQ=255) aaaaaaGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACa < 1:4314249/100‑1 (MQ=255) aaaaaGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACaa > 2:3751503/1‑100 (MQ=255) aaaGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAAtt < 1:1721636/100‑1 (MQ=255) aaGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTa > 2:1553520/1‑100 (MQ=255) gcgcTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGt < 1:2951362/100‑1 (MQ=255) cgcTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGtt < 2:2835116/100‑1 (MQ=255) gcTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACCATCAGTTg > 2:4095529/1‑100 (MQ=255) gcTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTg < 1:3314161/100‑1 (MQ=255) gcTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTg < 1:2866685/100‑1 (MQ=255) cTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTga < 2:235244/100‑1 (MQ=255) cGGAATTTAATTATTTTAAGAGATATAACATTCTGCGGAATATTGCCCGCAGACGGCATTGTTGTTTTTTAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTgag < 1:4048668/99‑1 (MQ=255) cGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTgaga < 1:1569370/100‑1 (MQ=255) gAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGata < 1:3377222/100‑1 (MQ=255) aaTTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGata < 1:3960067/99‑1 (MQ=255) aTTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGatata > 2:1614331/1‑100 (MQ=255) aTTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTCCGGAATATTTCCCGCACACGGCTTTGTTGTTTTTAAAAATTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGatata > 2:828427/1‑100 (MQ=255) tttAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGatatat < 1:3321070/100‑1 (MQ=255) tAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCg > 2:3803793/1‑100 (MQ=255) aaTTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGt > 2:3906237/1‑100 (MQ=255) aaTTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGt < 2:4313275/100‑1 (MQ=255) attattTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGtt > 2:338794/1‑100 (MQ=255) ttattTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGtt > 2:931265/1‑99 (MQ=255) ttattTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTg < 2:2650279/100‑1 (MQ=255) ttattTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTg < 1:546914/100‑1 (MQ=255) attTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGc < 1:149996/100‑1 (MQ=255) attTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGc > 2:2098104/1‑100 (MQ=255) ttttAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCg < 1:3600876/100‑1 (MQ=255) tttAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGt < 2:1165110/100‑1 (MQ=255) ttAAGAGCTAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTc < 1:3711530/100‑1 (MQ=255) ttAAGAGATAAAACCGTCTGTGGAATATTTCACGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTc < 1:3145365/100‑1 (MQ=255) aaGAGATAGAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACTGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTca < 1:3059066/99‑1 (MQ=255) agagATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTcaca < 2:1889130/100‑1 (MQ=255) agagATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTcaca > 2:1125717/1‑100 (MQ=255) caacaaagccGTCTGCGGGAAATATTCCGCAGACGGTTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACaaa > 2:72243/9‑100 (MQ=21) ccgatctgTCTGCGGGAAATATTCCGCAGACGGTTTTTTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACAAAAg < 1:4215814/92‑1 (MQ=25) caaagCCGTCTGCGGGAAATATTCCGCAGACGGATTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACAAAAGc > 2:250640/2‑100 (MQ=25) aatacagTCTGTGGAATATTTCCCGCAGACGGCGTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACAAAAg < 2:4302522/92‑1 (MQ=255) aaaaCCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCa < 1:930759/100‑1 (MQ=255) aagccGTCTGCGGGAAATATTCCGCAGACGGTTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCaa > 2:568196/4‑100 (MQ=25) aCCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACATTTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCaaaa < 1:2361324/100‑1 (MQ=255) cGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATa < 1:1742513/100‑1 (MQ=255) gTCTGCGGGAAATATTCCGCAGACGGTTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACAAAAgagatcgga > 2:4215845/1‑92 (MQ=25) tGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGt < 1:1553514/100‑1 (MQ=255) cGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTaa > 2:1766882/1‑100 (MQ=255) ggAATATTTTCCATATATTGCTTTGTTGTTTTTTAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGTCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAAt < 1:1861846/100‑1 (MQ=255) aaTATTTCACGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTc < 1:2122540/100‑1 (MQ=255) cccGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATa > 2:2030652/1‑100 (MQ=255) cccGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATa > 2:2107343/1‑100 (MQ=255) cccGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATa < 1:3560060/100‑1 (MQ=255) | TATTTATGACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATA > NC_000913/285105‑285303 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |