| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,758,920 | C→T | 16.6% | intergenic (+64/‑65) | alpA → / → yfjI | CP4‑57 prophage; DNA‑binding transcriptional activator/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,758,920 | 0 | C | T | 16.6% | 477.6 / 74.2 | 203 | intergenic (+64/‑65) | alpA/yfjI | CP4‑57 prophage; DNA‑binding transcriptional activator/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (86/83); new base T (21/13); total (107/96) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.65e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.77e-02 | |||||||||||
Only 100 of 209 total aligned reads displayed.
GATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATT > NC_000913/2758821‑2759019 | gatgaGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGcc < 1:615066/100‑1 (MQ=255) tgaGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCAt < 1:4267053/100‑1 (MQ=255) aGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTa > 2:1483631/1‑100 (MQ=255) aGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTa < 2:2501990/100‑1 (MQ=255) gTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTaa > 1:2808356/1‑100 (MQ=255) gTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTaa < 1:1359824/100‑1 (MQ=255) gTTATTACAACGCTGACAACCTGCTTGAGGCCGTTACTTGAATTCAGACGCAGTTGCTGGCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGACGTtagtag < 1:114654/100‑1 (MQ=255) ttATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGc > 2:3371801/1‑100 (MQ=255) tcttCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGc < 2:1499530/97‑1 (MQ=255) tATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCg < 1:2214827/100‑1 (MQ=255) tCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑a > 2:2436533/1‑100 (MQ=255) tCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑a > 1:1644881/1‑100 (MQ=255) tCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑a > 2:560083/1‑100 (MQ=255) caACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTATATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCTATTAATGGCGG‑aaat < 2:4194857/100‑3 (MQ=255) caACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCTATTAATGGCGG‑aaat < 1:562539/100‑3 (MQ=255) caACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATa > 1:2147391/1‑100 (MQ=255) aaCGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCTATTAATGGCGG‑aaata < 2:633106/100‑4 (MQ=255) aaCGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAg < 2:3002022/100‑1 (MQ=255) aCGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGc < 1:1944260/100‑1 (MQ=255) aCGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTA‑TTCCGCTATTAATGGCGG‑aaatagc < 1:2998279/100‑6 (MQ=38) aCGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTA‑TTCCGCTATTAATGGCGG‑aaatagc < 1:3393413/100‑6 (MQ=38) gCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCTATTAATGGCGG‑aaatagca < 1:3263390/100‑7 (MQ=39) gCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTA‑TTCCGCTATTAATGGCGG‑aaatagcag < 2:4211635/100‑8 (MQ=37) gCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTA‑TTCCGCTATTAATGGCGG‑aaatagcag < 2:4367288/100‑8 (MQ=37) cTGTAAACTTATTTTAAGGTGTTACATAAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCTATTAATGGCGG‑aaatagcag < 1:3828044/100‑8 (MQ=37) tGTAAACTTAGTTGAGTGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGT‑AATAGCCata < 1:3571736/100‑1 (MQ=255) gTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCatat > 2:179936/1‑100 (MQ=255) tAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATAtt < 2:863669/100‑1 (MQ=255) aaCTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTg > 1:1903925/1‑100 (MQ=255) cTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCt < 2:1441275/100‑1 (MQ=255) cTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCt < 1:1034361/100‑1 (MQ=255) cTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCt < 1:1435487/100‑1 (MQ=255) tttGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAAc < 1:2476026/100‑1 (MQ=255) tGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACaa > 2:2116350/1‑100 (MQ=255) tGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACaa > 1:88965/1‑100 (MQ=255) aGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAAtt > 2:2646909/1‑100 (MQ=255) gggTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAAttt > 2:2359566/1‑100 (MQ=255) ggTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AGTAGCCATATTTGCTAAACAATTTc < 1:3763404/100‑1 (MQ=255) gtgtTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCt > 2:4306212/1‑100 (MQ=255) gtTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCtta > 1:2296071/1‑100 (MQ=255) cATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATCGCGG‑AATAGCCATACTTGCTAAACAATTTCttaa > 1:4090397/1‑97 (MQ=255) cATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaattt > 2:2009236/1‑100 (MQ=255) cATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaattt < 1:310859/100‑1 (MQ=255) taaaTTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaatttaa > 2:2982407/3‑100 (MQ=255) tGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaatttaa > 2:933030/1‑100 (MQ=255) tGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaatttaa > 1:4219872/1‑100 (MQ=255) aaTTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTtaatttaatt < 2:2689269/100‑1 (MQ=255) aTTCATACTCAATTGCTGTCATCAGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATttaatta > 1:949356/1‑100 (MQ=255) cATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAAt > 2:2083176/1‑100 (MQ=255) cATACTCAATTGCTGTCATAGGAGTGTAAACAGCCTGCTATTTCCGCCATTAATGGCGG‑AAAAGCCATATGTGCTAAACAACTTCTTAATTTAATTAAAt < 1:3195518/100‑1 (MQ=255) cATACTCAATAGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATCGACATCTTTTCTAAACAATTTCttaatttaatcacat > 1:1291807/1‑95 (MQ=255) ntACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATa > 1:3717806/2‑100 (MQ=255) aTACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATa < 1:3749776/100‑1 (MQ=255) tACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATATCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATaa > 1:3983549/1‑100 (MQ=255) tACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATaa < 1:3323168/100‑1 (MQ=255) cTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAaga > 2:1394173/1‑100 (MQ=255) cTCAATTGCTGCCATCGGAGTGTAACCATCCTTCTATTTCCGCCATTAATAGCGT‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATaa < 1:4353180/98‑1 (MQ=255) tCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAagag < 2:1173115/100‑1 (MQ=255) cAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAgg > 1:1278290/1‑100 (MQ=255) aaTTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCAGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGc > 1:2364364/1‑100 (MQ=255) tGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCAtt > 2:3472258/1‑100 (MQ=255) tGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCa < 2:1647568/100‑1 (MQ=255) tGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCa < 1:1474301/100‑1 (MQ=255) tGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCa < 1:3179025/100‑1 (MQ=255) tGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCa < 2:3148672/100‑1 (MQ=255) gTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCAt < 2:1544906/100‑1 (MQ=255) aTCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGtt > 1:1850136/1‑100 (MQ=255) tCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTc < 2:3636287/100‑1 (MQ=255) cGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCa < 2:198170/100‑1 (MQ=255) ggAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCaa > 2:806157/1‑100 (MQ=255) gAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAAt > 2:3708832/1‑100 (MQ=255) gAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAAt < 1:1188812/100‑1 (MQ=255) aGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATg < 1:1009895/100‑1 (MQ=255) gtgtAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATgg > 2:1116652/1‑100 (MQ=255) gtgtAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATgg > 1:3310646/1‑100 (MQ=255) tgtAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGgt > 2:1887117/1‑100 (MQ=255) tAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAGTTTAAGTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGgtcg > 1:2970625/1‑100 (MQ=255) tAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGgtcg < 1:1785450/100‑1 (MQ=255) tAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGgtcg > 2:2821230/1‑100 (MQ=255) tAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGgtcg > 1:733212/1‑100 (MQ=255) tCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCttt < 2:1687534/100‑1 (MQ=255) ccTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTc < 2:3755598/100‑1 (MQ=255) ccTGCTATTTCCCCCATTAATAGCGG‑AATAGTCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTc < 1:1102348/100‑1 (MQ=255) atggctattCCGCTATTAATGGCGGAAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTc > 2:657447/8‑100 (MQ=37) tggctattCCGCTATTAATGGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTccc > 2:3556755/7‑100 (MQ=39) gctattCCGCTATTAATGGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTg > 2:1717225/5‑100 (MQ=255) cTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTg < 1:2046822/100‑1 (MQ=255) ctattCCGCTATTAATGGCGGAAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTg > 2:3279779/4‑100 (MQ=38) ctattCCGCTATTAATGGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGt > 1:2945033/4‑100 (MQ=255) tttCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAg > 2:4036313/1‑100 (MQ=255) attCCGCTATTAATGGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAg > 2:2901065/2‑100 (MQ=255) ttCCGCTATTAATGGCGGAAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAg > 1:4242337/1‑100 (MQ=255) tCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAg < 1:1689008/98‑1 (MQ=255) tCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGAt < 2:707728/100‑1 (MQ=255) tCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGAt > 2:352774/1‑100 (MQ=255) cGCCATTACTAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTACACAACTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGATCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGc > 1:187995/1‑100 (MQ=255) cGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGc < 2:1470873/100‑1 (MQ=255) cGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGc > 2:3919639/1‑100 (MQ=255) cGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGc < 2:2247867/100‑1 (MQ=255) cATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCAtt > 2:3829500/1‑100 (MQ=255) | GATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATT > NC_000913/2758821‑2759019 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |