| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,758,927 | A→G | 16.6% | intergenic (+71/‑58) | alpA → / → yfjI | CP4‑57 prophage; DNA‑binding transcriptional activator/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,758,927 | 0 | A | G | 16.6% | 458.8 / 79.3 | 204 | intergenic (+71/‑58) | alpA/yfjI | CP4‑57 prophage; DNA‑binding transcriptional activator/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (86/83); new base G (21/13); total (108/96) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.65e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.81e-01 | |||||||||||
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
GTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAA > NC_000913/2758829‑2759026 | tcttCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGc < 2:1499530/97‑1 (MQ=255) tATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCg < 1:2214827/100‑1 (MQ=255) tCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑a > 2:2436533/1‑100 (MQ=255) tCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑a > 1:1644881/1‑100 (MQ=255) aaCGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAg < 2:3002022/100‑1 (MQ=255) aCGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTA‑TTCCGCTATTAATGGCGG‑aaatagc < 1:2998279/100‑6 (MQ=38) aCGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTA‑TTCCGCTATTAATGGCGG‑aaatagc < 1:3393413/100‑6 (MQ=38) gCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCTATTAATGGCGG‑aaatagca < 1:3263390/100‑7 (MQ=39) gCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCa > 2:648873/1‑100 (MQ=255) gCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCa < 1:3780411/100‑1 (MQ=255) gCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTA‑TTCCGCTATTAATGGCGG‑aaatagcag < 1:1861870/100‑8 (MQ=37) cTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAAAATCCTGCTA‑TTCCGCTATTAATGGCGG‑aaatagcagg < 1:2352054/100‑9 (MQ=25) tGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCata < 1:2257083/100‑1 (MQ=255) tAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATAtt < 2:863669/100‑1 (MQ=255) cTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCt < 2:1441275/100‑1 (MQ=255) cTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCt < 1:1435487/100‑1 (MQ=255) cTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCt > 2:581221/1‑100 (MQ=255) tGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACaa > 2:4393818/1‑100 (MQ=255) tGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACaa > 2:2116350/1‑100 (MQ=255) aGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAAtt > 2:2646909/1‑100 (MQ=255) gggTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAAttt < 2:4309291/100‑1 (MQ=255) gggTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAAttt > 2:2359566/1‑100 (MQ=255) gtgtTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCt > 2:674344/1‑100 (MQ=255) gtgtTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCt < 2:2171486/100‑1 (MQ=255) ttACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaa < 1:1133342/100‑1 (MQ=255) taTGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaattt < 1:926520/99‑1 (MQ=255) cATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATCGCGG‑AATAGCCATACTTGCTAAACAATTTCttaa > 1:4090397/1‑97 (MQ=255) cATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaattt < 1:310859/100‑1 (MQ=255) cATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaattt > 2:2009236/1‑100 (MQ=255) taaaTTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaatttaa > 2:2982407/3‑100 (MQ=255) tGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaatttaa > 1:4219872/1‑100 (MQ=255) tGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaatttaa > 2:3485424/1‑100 (MQ=255) tGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaatttaa > 2:933030/1‑100 (MQ=255) gAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaatttaat < 1:2132376/100‑1 (MQ=255) aaTTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTtaatttaatt < 2:2689269/100‑1 (MQ=255) cATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAAt > 2:2083176/1‑100 (MQ=255) cATACTCAATTGCTGTCATAGGAGTGTAAACAGCCTGCTATTTCCGCCATTAATGGCGG‑AAAAGCCATATGTGCTAAACAACTTCTTAATTTAATTAAAt < 1:3195518/100‑1 (MQ=255) aTACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATa < 1:3749776/100‑1 (MQ=255) tACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATATCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATaa > 1:3983549/1‑100 (MQ=255) tACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATaa < 1:3323168/100‑1 (MQ=255) cTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAaga > 2:3684930/1‑100 (MQ=255) cTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAaga > 2:1394173/1‑100 (MQ=255) cTCAATTGCTGCCATCGGAGTGTAACCATCCTTCTATTTCCGCCATTAATAGCGT‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATaa < 1:4353180/98‑1 (MQ=255) tCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAagag < 2:3411143/100‑1 (MQ=255) tCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAagag < 2:1173115/100‑1 (MQ=255) cAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAgg < 2:3549936/100‑1 (MQ=255) aaTTGCTGTCATCGGAGTCTATACATCCTTCTATTTCCGCTATTAATAGCGA‑ATTTGCCATATTTGCTAACCAATTTCTTAATTGAATTAAATAagag < 1:2371161/98‑1 (MQ=255) gCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTg > 2:1854175/1‑100 (MQ=255) tGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCa < 1:3179025/100‑1 (MQ=255) tGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCa < 1:2041659/100‑1 (MQ=255) tGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCa < 1:1474301/100‑1 (MQ=255) tGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCa < 2:3148672/100‑1 (MQ=255) tGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCa < 2:1647568/100‑1 (MQ=255) tGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCa < 2:1693863/100‑1 (MQ=255) tGTCATCGGAGTGCAAACATCCTGGTATTTCCCTCATTAATAACTG‑AATAGACATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAAGAAGAGGCATTGCa < 1:1933297/100‑1 (MQ=255) gTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCAt < 2:1544906/100‑1 (MQ=255) cATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATg < 2:3559859/99‑1 (MQ=255) cGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCa > 1:1286521/1‑100 (MQ=255) cGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCa < 2:198170/100‑1 (MQ=255) ggAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCaa > 2:2619199/1‑100 (MQ=255) ggAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCaa > 2:175729/1‑100 (MQ=255) ggAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCaa > 2:806157/1‑100 (MQ=255) gAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAAt < 1:1188249/100‑1 (MQ=255) aGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATg < 1:1009895/100‑1 (MQ=255) gtgtAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATgg > 1:3310646/1‑100 (MQ=255) tAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAGTTTAAGTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGgtcg > 1:2970625/1‑100 (MQ=255) tAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGgtcg < 2:1683187/100‑1 (MQ=255) tAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGgtcg > 1:733212/1‑100 (MQ=255) tAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGgtcg > 2:2821230/1‑100 (MQ=255) aaCATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATg > 1:1059621/1‑94 (MQ=255) aatatggctattCCGCTATTAATGGCGGAAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCt > 1:1234457/11‑100 (MQ=25) ccTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTc < 2:3755598/100‑1 (MQ=255) atggctattCCGCTATTAATGGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTcc > 1:1825170/8‑100 (MQ=38) tggctattCCGCTATTAATGGCGGAAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTc > 1:1888462/7‑99 (MQ=37) ggctattCCGCTATTAATGGCGGAAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTcc > 1:1782406/6‑99 (MQ=37) ggctattCCGCTATTAATGGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCt > 1:3579736/6‑100 (MQ=255) gCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCACt > 2:1492203/1‑100 (MQ=255) gctattCCGCTATTAATGGCGGAAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCt > 1:564263/5‑100 (MQ=38) gctattCCGCTATTAATGGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTg > 2:3307118/5‑100 (MQ=255) gctattCCGCTATTAATGGCGG‑AATAGACATATTTGCTAAACCATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCACTTTTCGTCAtt > 1:3761867/5‑94 (MQ=25) tATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGt < 2:4170731/100‑1 (MQ=255) ctattCCGCTATTAATGGCGGAAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTg > 2:3271332/4‑100 (MQ=38) ctattCCGCTATTAATGGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGt > 1:2945033/4‑100 (MQ=255) tattCCGCTATTAATGGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCATGTa > 1:2537615/3‑100 (MQ=255) aTTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTa < 1:4357526/100‑1 (MQ=255) tttCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAg > 2:4036313/1‑100 (MQ=255) attCCGCTATTAATGGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGTGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAg > 2:4202593/2‑100 (MQ=255) attCCGCTATTAATGGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAg > 2:2901065/2‑100 (MQ=255) ttCCGCTATTAATGGCGGAAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAg > 1:4242337/1‑100 (MQ=255) tCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAg < 1:1689008/98‑1 (MQ=255) tCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGAt > 2:1059206/1‑100 (MQ=255) tCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGAt < 2:707728/100‑1 (MQ=255) cGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGc > 2:3919639/1‑100 (MQ=255) cGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGc < 2:1470873/100‑1 (MQ=255) cATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCAtt > 2:3829500/1‑100 (MQ=255) cATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCACTGTAGATGCAtt > 2:430500/1‑100 (MQ=255) ttAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATTTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTc > 1:3922075/1‑100 (MQ=255) tAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTcc < 1:278473/100‑1 (MQ=255) tAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTcc < 1:1322688/100‑1 (MQ=255) aTAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTa > 1:536038/1‑100 (MQ=255) | GTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAA > NC_000913/2758829‑2759026 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |