| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,761,620 | T→G | 15.2% | K641Q (AAG→CAG) | yfjK ← | radiation resistance protein; DEAD/H helicase‑like protein; CP4‑57 putative defective prophage |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,761,620 | 0 | T | G | 15.2% | 512.4 / 85.0 | 197 | K641Q (AAG→CAG) | yfjK | radiation resistance protein; DEAD/H helicase‑like protein; CP4‑57 putative defective prophage |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (80/87); new base G (17/13); total (97/100) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.31e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.00e-01 | |||||||||||
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
TGCCAATCTCTTCTAAGGCATTGACACCTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCTTCAAATCATTGTTGAGGGC > NC_000913/2761521‑2761719 | tGCCAATCTCTTCTAAGGCATTGACACCTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCtt < 1:3626235/100‑1 (MQ=255)tGCCAATCTCTTCTAAGGCATTGACACCTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCtt < 1:2202320/100‑1 (MQ=255) ccAATCTCTTCTAAGGCATTGACACCTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTa < 2:4116958/100‑1 (MQ=255) cAATCTCTTCTAAGGCATTGACACCTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTAc > 2:1186936/1‑100 (MQ=255) aaTCTCTTCTAAGGCATTGACACCTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACa > 2:3285367/1‑100 (MQ=255) aTCTCTTCTAAGGCATTGACACCTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAg < 2:1963649/100‑1 (MQ=255) tcttctAAGGCATTGACACCTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCgt > 2:3397369/1‑100 (MQ=255) cttctAAGGCATTGACACCTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCgtg > 1:1391887/1‑100 (MQ=255) ttctAAGGCATTGACACCTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTGTAAAGCgtgg < 1:1008417/100‑1 (MQ=255) ctAAGGCATTGACACCTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCgtggtg < 2:1986542/100‑1 (MQ=255) ctAAGGCATTGACACCTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTGTAAAGCgtggta < 1:1422217/100‑2 (MQ=255) tAAGGCATTGACACCTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTGTAAAGCgtggtat < 1:2661288/100‑3 (MQ=255) tAAGGCATTGACACCTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGACAATTTGACATGTGTGTAAGCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGgtgt > 1:2407363/1‑100 (MQ=255) aaGGCATTGACACCTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGtt > 2:1790663/1‑100 (MQ=255) aaGGCATTGACACCTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTGTAAAGCgtggtata < 2:839823/100‑4 (MQ=255) aGGCATTGACACCTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTGTAAAGCgtggtatac < 2:1655912/100‑5 (MQ=255) ggtaTTGACACCTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTa > 2:887128/4‑100 (MQ=255) ggCATTGACACCTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTa < 2:3997050/100‑1 (MQ=255) cATTGACACCTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAAc > 2:237231/1‑100 (MQ=255) cATTGACACCTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTGTAAAGCgtggtatacg < 2:137300/98‑6 (MQ=39) aTTGACACCTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGAGATGTGTGTAATCGACTGTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAAc < 1:2358184/99‑1 (MQ=255) aTTGACACCTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTGTAAAGCgtggtatacgcag < 2:2444918/100‑9 (MQ=38) aTTGACACCTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTGTAAAGCgtggtatacgcag > 2:1881878/1‑92 (MQ=38) aTTGACACCTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTGTAAAGCgtggtatacgcag < 1:972786/100‑9 (MQ=38) ccTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACAtcct > 2:2072822/1‑100 (MQ=255) ccTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACAtcct > 2:3986357/1‑100 (MQ=255) cTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACAtcctc < 1:2610496/100‑1 (MQ=255) ggtAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCa > 2:824543/1‑100 (MQ=255) ggtAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCa < 1:408159/100‑1 (MQ=255) gtAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCaa > 1:2312186/1‑100 (MQ=255) tAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCaa > 1:2995264/1‑99 (MQ=255) aGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAg < 1:1043998/99‑1 (MQ=255) gATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCt > 1:3702096/1‑100 (MQ=255) attgagaCTTTCTAACGCCAATTGTACTTTTGTGTAATCGTCTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTg < 1:2717575/94‑1 (MQ=255) tGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGa > 1:726188/1‑100 (MQ=255) ggAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAg < 2:2415504/100‑1 (MQ=255) ggAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAg < 1:2684062/100‑1 (MQ=255) aatttCTAACGTCAATTTGACATGTGTGTAATCGACAATGTTGCGTATACCACGATTTACAGAGTATTGTTTAACAACATCCTCAATCAAGAAGAGc < 1:1494964/95‑1 (MQ=255) aCTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCAcc < 2:1494042/100‑1 (MQ=255) cTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCt > 1:514190/1‑100 (MQ=255) tttCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAAATACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCtt > 2:697404/1‑100 (MQ=255) ttCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTta < 2:744177/100‑1 (MQ=255) gAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTtaggt > 1:2247503/1‑100 (MQ=255) gCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAggg < 2:3081777/100‑1 (MQ=255) gCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAggg < 2:937466/100‑1 (MQ=255) gCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAggg > 1:3252803/1‑100 (MQ=255) gCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAggg < 1:3870978/100‑1 (MQ=255) ttGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGc < 2:908144/100‑1 (MQ=255) cATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGaa > 1:623664/1‑100 (MQ=255) tgtgtgTAATCGACTTTGCTGTGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAgg < 1:4229456/100‑1 (MQ=255) tgtgtgTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAgg < 2:4231294/100‑1 (MQ=255) gtgtgtAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGt > 1:1764159/1‑100 (MQ=255) gtgtAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTa > 1:4372592/1‑99 (MQ=255) gtgtAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTAt > 1:2245643/1‑100 (MQ=255) tgtAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTAtt < 2:2861816/100‑1 (MQ=255) tgtAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTAtt < 1:385976/100‑1 (MQ=255) gtAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCAGCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTg > 1:4143215/1‑100 (MQ=255) gtAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTg > 2:51029/1‑100 (MQ=255) tAATCGACTTTGCTGCGTATACCCCGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCTTCCATCCAGGTGAGCACCTTAGGGAGGGTAGAGCCGAAGGTATTgg < 1:2116659/100‑1 (MQ=255) tAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTCTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTgg < 2:3362582/100‑1 (MQ=255) aaTCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTgg < 2:1270794/99‑1 (MQ=255) aaTCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGt > 2:1825259/1‑100 (MQ=255) aaTCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGt > 1:2925488/1‑100 (MQ=255) aaTCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGt > 1:1872540/1‑100 (MQ=255) aTCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGtt > 2:3633895/1‑100 (MQ=255) aTCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGtt < 2:923365/100‑1 (MQ=255) aTCGACTTTGCTGCGTATACAACGCTTTACAGCGTGGTGTTAAACTACATCCTTCATCAAGCAGACCATGTTCAGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTgg > 1:693072/1‑98 (MQ=255) tCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGAGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTa > 2:3104933/1‑100 (MQ=255) gACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATg > 2:3246236/1‑100 (MQ=255) cTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAg > 2:1592495/1‑100 (MQ=255) cTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAg > 1:3403588/1‑100 (MQ=255) tttGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGTACCTTAGGTAGGGTATCGCCGATGGTATTGGTTATgcg > 2:1908830/1‑97 (MQ=255) ttGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGCTGTTTAACTACATCCGCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCt < 1:2563392/100‑1 (MQ=255) tgctgcGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCAGCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCtt > 1:4191317/1‑100 (MQ=255) tgcGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCTTCaa > 2:3711122/1‑100 (MQ=255) tgcGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCTTCa > 1:4064424/1‑99 (MQ=255) gttaaacaCCACGCTGTAAAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCTTCaa > 2:3114971/8‑100 (MQ=38) gttaaacaCCACGCTGTAAAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCTTCaa > 2:3793331/8‑100 (MQ=38) ttaaacaCCACGCTGTAAAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCTTCaaa > 2:2387275/7‑100 (MQ=39) taaacaCCACGCTGTAAAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCTTCAAAt > 1:2500413/6‑100 (MQ=255) taaacaCCACGCTGTAAAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCTTCAAAt > 1:3459609/6‑100 (MQ=255) cGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCTTCAAAt < 2:1755430/100‑1 (MQ=255) gTATACCACGCTTTATAGCGTGGTGTTTAACTACATGCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCTTCAAAt < 1:3711621/99‑1 (MQ=255) gTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCTTCAAATc < 2:3512937/100‑1 (MQ=255) aacaCCACGCTGTAAAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCTTCAAATCa > 2:1654690/4‑100 (MQ=255) aacaCCACGCTGTAAAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGAATAGCCGAAAGTAATAGTTATGAGCTTCAAATCa > 1:920483/4‑100 (MQ=255) acaCCACGCTGTAAAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCTTCAAATCAt > 1:3029951/3‑100 (MQ=255) taCCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCTTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCTTCAAATCAtt < 2:2538151/100‑1 (MQ=255) acaaCGCTTTACAGCGTTGTGTTTAACTACATCGTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCAGCAGGGATTGGTTATGAGATTTAAATCAttg > 1:2261170/4‑100 (MQ=255) aCCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCTTCAAATCAttn < 1:1266731/100‑2 (MQ=255) aCCACGCTGTAAAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCTTCAAATCAttg > 2:3843672/1‑100 (MQ=255) ccACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCTTCAAATCAttgt > 1:2153480/1‑100 (MQ=255) ccACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCTTCAAATCAttgt > 1:192049/1‑100 (MQ=255) ccACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCTTCAAATCAttgt > 1:1739820/1‑100 (MQ=255) aCGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCTTCAAATCAttgttg < 2:1015899/100‑1 (MQ=255) gCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCTTCAAATCATTGTTGAg < 2:3889410/100‑1 (MQ=255) cTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCTTCAAATCATTGTTGAgg > 1:2297253/1‑100 (MQ=255) tttACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCTTCAAATCATTGTTGAggg < 1:2755310/100‑1 (MQ=255) tttACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCTTCAAATCATTGTTGAggg > 1:382958/1‑100 (MQ=255) ttACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCTTCAAATCATTGTTGAGGGc > 1:1789905/1‑100 (MQ=255) | TGCCAATCTCTTCTAAGGCATTGACACCTGGTGGTAGATGGAAACTTTCGAACGCCAATTTGACATGTGTGTAATCGACTTTGCTGCGTATACCACGCTTTACAGCGTGGTGTTTAACTACATCCTCCATCAAGCTGAGCACCTTAGGTAGGGTATAGCCGAAGGTATTGGTTATGAGCTTCAAATCATTGTTGAGGGC > NC_000913/2761521‑2761719 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |