| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,729,408 | C→G | 15.8% | intergenic (‑37/+35) | xylB ← / ← xylA | xylulokinase/D‑xylose isomerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,729,408 | 0 | C | G | 15.8% | 494.4 / 79.2 | 177 | intergenic (‑37/+35) | xylB/xylA | xylulokinase/D‑xylose isomerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (80/69); new base G (19/9); total (99/78) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.14e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.16e-02 | |||||||||||
Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
CCCTGCTCGTTGAGCAAAATAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGACCACTCTGATGCA > NC_000913/3729310‑3729507 | cccTGCTCGTTGAGCAAAATAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTAcc > 1:3380677/1‑100 (MQ=255) tGCTCGTTGAGCAAAATAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGAt > 2:4169511/1‑100 (MQ=255) cGTTGAGCAAAATAACTTTTACGCAAGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAACAAAATGCCCAG‑TATCGCTACCGATAAcc > 1:2001449/1‑100 (MQ=255) gTTGAGCAAAATAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCg > 1:869572/1‑100 (MQ=255) tGAGCAAAATAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCggg > 1:3727094/1‑100 (MQ=255) tGAGCAAAATAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCggg < 2:4357134/100‑1 (MQ=255) gAGCAAAATAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGc > 2:939765/1‑100 (MQ=255) aGCAAAATAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGcc < 1:1478438/100‑1 (MQ=255) aGCAAAATAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGcc > 1:3208697/1‑100 (MQ=255) gCAAAATAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGGTTATCGGTAGCGAT‑ACCGGGcat < 2:3685349/100‑3 (MQ=37) aaaaTAACTTTTACGCCCGAGGTGACAAGATCTATCCCGGTATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGGTTATCGGTAGCGAT‑ACCGGGcattt < 1:3801320/100‑5 (MQ=25) aaTAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACgg < 2:1202554/100‑1 (MQ=255) tAACTTTTACGCCCGAGGTGACAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTACAAAAATGCCCGGTTATCGGTAGCGAT‑ACCGGGcattttttt < 1:1793325/100‑9 (MQ=21) aCTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTg > 1:665802/1‑100 (MQ=255) cTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGCTATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTg < 2:1913970/99‑1 (MQ=255) cTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGc > 2:3928947/1‑100 (MQ=255) cTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGc > 2:316909/1‑100 (MQ=255) ttttACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGca < 1:189327/100‑1 (MQ=255) cGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGtt > 1:2588937/1‑100 (MQ=255) cGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGtt > 2:4011116/1‑100 (MQ=255) cGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGtt < 1:2296184/100‑1 (MQ=255) cGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGtt > 2:1143102/1‑100 (MQ=255) gCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTa < 1:2804504/100‑1 (MQ=255) ccGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAg > 2:3604996/1‑99 (MQ=255) ccGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGc > 1:1148236/1‑100 (MQ=255) ccGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGc < 1:4067028/100‑1 (MQ=255) ccGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGc < 1:4314844/100‑1 (MQ=255) cGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGcc < 2:1462020/100‑1 (MQ=255) cGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGc < 1:3054689/99‑1 (MQ=255) ggTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGtt < 1:1616026/100‑1 (MQ=255) tGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGtttt < 2:4093656/100‑3 (MQ=255) gCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTAtt < 2:3135526/100‑1 (MQ=255) gCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTAtt > 2:704978/1‑100 (MQ=255) gCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTAtt > 2:258506/1‑100 (MQ=255) gCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTACTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTAt < 1:49239/99‑1 (MQ=255) cAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTg > 2:2408958/1‑100 (MQ=255) aGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTc < 2:2347115/100‑1 (MQ=255) aGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTc > 2:4162946/1‑100 (MQ=255) gATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCg < 1:3623431/100‑1 (MQ=255) gATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCg > 2:1077201/1‑100 (MQ=255) aTCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTc > 2:3027967/1‑98 (MQ=255) tCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGaa < 2:4207955/100‑1 (MQ=255) tATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACa > 2:1418744/1‑100 (MQ=255) ccGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATa > 2:2536930/1‑100 (MQ=255) ccGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCAGTTAATTGTCGacc > 1:3002227/1‑93 (MQ=255) cggtataCAGATCGAGCGTTCCTTAAAAAGATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGACAACGGACTGCACCGTTAGCCGTTATTTGTCGAAc < 1:779940/91‑1 (MQ=255) gATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTTCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAAt > 2:2857498/1‑100 (MQ=255) tataCATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATgg < 1:1273126/100‑1 (MQ=255) tataCATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TAGCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATgg > 1:2354412/1‑100 (MQ=255) tataCATATCGATCCTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATgn < 1:3556749/100‑2 (MQ=255) ataCATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TAGCGCTACCGATATCCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGt < 2:3101833/100‑1 (MQ=255) taCATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGtt > 1:789805/1‑100 (MQ=255) aCATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGttt > 1:1162824/1‑100 (MQ=255) cATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTa > 1:2505580/1‑100 (MQ=255) cATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTa > 1:3855714/1‑100 (MQ=255) cATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACAGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTa > 2:2711342/1‑100 (MQ=255) tatCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTAcc > 1:2213339/1‑100 (MQ=255) tatCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGATTccc > 2:2060783/1‑100 (MQ=255) atcgatcgTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCa < 1:612262/100‑1 (MQ=255) cgagcgTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGGTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTTGAACAGATAATGGTTTACCAGa < 1:2558439/100‑1 (MQ=255) tcgTTCCTTAAAAAAATGCCAGG‑TATCGATACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGAttt > 1:529394/1‑100 (MQ=255) gTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGAtttt > 1:676023/1‑99 (MQ=255) gTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTc > 2:3437896/1‑100 (MQ=255) ttCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTcc < 1:3501053/100‑1 (MQ=255) ccTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAATGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAg < 2:1614736/100‑1 (MQ=255) ccTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAg > 1:1925291/1‑100 (MQ=255) cTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATACTGGTTTACCAGATTTTCCAgt > 1:1285917/1‑100 (MQ=255) cTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAgt < 2:2643806/100‑1 (MQ=255) ttAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAgtt > 1:3402665/1‑100 (MQ=255) tAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTTCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAgttg < 1:2843335/100‑1 (MQ=255) aaaaaaaTGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAgttgt < 1:3164076/100‑1 (MQ=255) ccgttggCCCGGTTATCGGTAGCGAT‑ACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTCGTCGAACAGCTACTGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTc > 1:4338477/7‑100 (MQ=21) gCCCGGTTATCGGTAGCGAT‑ACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCg > 1:3865094/1‑100 (MQ=38) gCCCGGTTATCGGTAGCGAT‑ACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTAGTTCCTGGCg > 1:2893359/1‑100 (MQ=37) cccGGTTATCGGTAGCGAT‑ACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGa > 2:2762663/1‑100 (MQ=38) cccGGTTATCGGTAGCGAT‑ACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGa > 2:898526/1‑100 (MQ=38) cccGGTTATCGGTAGCGAT‑ACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGa > 2:2239613/1‑100 (MQ=38) cccGGTTATCGGTAGCGAT‑ACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGa > 2:2758796/1‑100 (MQ=38) cccGGTTATCGGTAGCGAT‑ACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGa > 2:826655/1‑100 (MQ=38) cccGGTTATCGGTACCGAT‑ACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTTGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGCTTACCAGGTTTTCCACTTGTTACTGGCg > 1:3305594/1‑99 (MQ=255) ccggttATCGGTAGCGAT‑ACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGAc > 2:2804526/6‑100 (MQ=255) ccGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGan < 1:201319/100‑2 (MQ=255) ccGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGAc < 2:3141431/100‑1 (MQ=255) cagg‑TATCGCTACAGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGAc > 2:2966454/3‑100 (MQ=255) cGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGAcc > 2:3278728/1‑100 (MQ=255) cGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTACACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGAcc > 2:3582684/1‑100 (MQ=255) g‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGACCAc < 1:2390101/100‑1 (MQ=255) cGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCGGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGACCACTCTg > 2:2448543/1‑100 (MQ=255) cGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGACCActc > 1:3982408/1‑98 (MQ=255) gCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGACCACTCTGa > 2:3548153/1‑100 (MQ=255) cTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGACCACTCTGAt < 1:3819874/100‑1 (MQ=255) tACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGACCACTCTGATg < 2:3738597/100‑1 (MQ=255) tACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGACCACTCTGATg < 1:2463129/100‑1 (MQ=255) tACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGACCACTCTGATg < 1:1841668/100‑1 (MQ=255) aCCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGACCACTCTGATGc < 2:3313401/100‑1 (MQ=255) aCCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGACCACTCTGATGc < 1:3455741/100‑1 (MQ=255) aCCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGACCACTCTGATGc < 1:3811380/100‑1 (MQ=255) aCCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGACCACTCTGATGc > 2:1864017/1‑100 (MQ=255) ccGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGTCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGACCACTCTGATGCa > 2:1269170/1‑100 (MQ=255) ccGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGACCACTCTGATGCa < 1:4168117/100‑1 (MQ=255) | CCCTGCTCGTTGAGCAAAATAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGG‑TATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGACCACTCTGATGCA > NC_000913/3729310‑3729507 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |