| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,115,214 | C→T | 30.2% | K122K (AAG→AAA) | glpX ← | fructose 1,6‑bisphosphatase II |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,115,214 | 0 | C | T | 30.2% | 238.0 / 109.1 | 158 | K122K (AAG→AAA) | glpX | fructose 1,6‑bisphosphatase II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (52/57); new base T (29/18); total (81/77) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.19e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
CTCAACGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGC > NC_000913/4115116‑4115310 | cTCAATGGTTTGCCGAGCGCCCCCGCTACATTGCGCATGTTATCCGCCAGCGTCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACCATCAGc < 1:2898005/99‑1 (MQ=255)cTCAACGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCt < 1:3763558/100‑1 (MQ=255) tCAACGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCtt > 1:1228472/1‑100 (MQ=255) cAACGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTtc > 2:3795722/1‑100 (MQ=255) cGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTcc < 1:1563028/100‑1 (MQ=255) gTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCat > 2:3231148/1‑100 (MQ=255) gTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCat > 2:2013009/1‑100 (MQ=255) tttGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCata < 2:2085815/100‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCatat < 1:3321962/100‑1 (MQ=255) gCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGACAGGTTCAGATCAATGGTGGCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATAc > 1:2403263/1‑100 (MQ=255) gcgcCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATc > 1:3895425/1‑100 (MQ=255) gcgcCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATc > 1:1962947/1‑100 (MQ=255) gccgccgcTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCg > 2:1119393/1‑100 (MQ=255) ccgccgcTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTATCCATATACATCTCCg > 1:180878/1‑99 (MQ=255) cgccgcTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGgc < 2:2615237/100‑1 (MQ=255) ccgcTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGgcgc > 1:679998/1‑100 (MQ=255) cgcTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCa > 2:3654886/1‑100 (MQ=255) tACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTg < 1:492092/100‑1 (MQ=255) aCATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGa > 2:1792474/1‑100 (MQ=255) aCATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGa < 2:890655/100‑1 (MQ=255) cATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAg < 1:517396/100‑1 (MQ=255) cATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAg < 2:3590116/100‑1 (MQ=255) aTTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAgg < 2:1962954/100‑1 (MQ=255) tGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGacg > 2:3931649/1‑96 (MQ=255) cgcAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAagc > 2:4008661/1‑100 (MQ=255) gcAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAagca > 1:462811/1‑100 (MQ=255) gcAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAagca < 2:1228476/100‑1 (MQ=255) cAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAagcag < 2:2650324/100‑1 (MQ=255) ttATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCtt < 2:253903/100‑1 (MQ=255) ttATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCtt > 2:1523869/1‑100 (MQ=255) aTCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGCAGCAGCCttt > 1:2522047/1‑99 (MQ=255) tCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTAt > 2:2555094/1‑100 (MQ=255) ccGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATc < 2:2298016/100‑1 (MQ=255) ccGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATc > 1:1770672/1‑100 (MQ=255) cGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCg > 1:2252747/1‑100 (MQ=255) cGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCg < 1:744937/100‑1 (MQ=255) cGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCg > 1:809919/1‑100 (MQ=255) cGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTAGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGAATTGAGGAAGCAGCCTTTATCg > 2:4182433/1‑100 (MQ=255) nccAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGc > 2:3556665/2‑100 (MQ=255) gCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAAACAGTTTCTCCATATACATATCCCTCGCCGTGAGTAAGCACGCTTTATCGc > 1:2421822/1‑100 (MQ=255) ccAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGcc < 2:4183452/100‑1 (MQ=255) ccAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGcc < 2:1015127/100‑1 (MQ=255) cAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCt < 2:4180804/100‑1 (MQ=255) cAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCt < 2:4011431/100‑1 (MQ=255) aGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTa < 1:2095019/100‑1 (MQ=255) gCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTAc > 1:1119301/1‑100 (MQ=255) ggCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTg > 1:1324992/1‑100 (MQ=255) ggCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTg < 1:2719092/100‑1 (MQ=255) ggCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTg < 2:3644756/100‑1 (MQ=255) gCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGc < 2:531624/100‑1 (MQ=255) gCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGc < 1:2559530/100‑1 (MQ=255) cAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGcc < 1:2390820/100‑1 (MQ=255) aGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCa < 1:4079847/100‑1 (MQ=255) aGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCa < 2:266549/100‑1 (MQ=255) ggTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAg < 1:930500/100‑1 (MQ=255) ggTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAg > 2:4330280/1‑100 (MQ=255) gTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGc > 2:1084736/1‑100 (MQ=255) ttCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCa > 1:792260/1‑100 (MQ=255) aGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCg > 2:2167162/1‑100 (MQ=255) aGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCg > 1:650233/1‑100 (MQ=255) aGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCg > 2:1388411/1‑100 (MQ=255) gATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCTCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGc > 2:4350877/1‑100 (MQ=255) gATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGc > 1:3286384/1‑100 (MQ=255) aTCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGcc < 2:3478835/100‑1 (MQ=255) tCAATTGTGCCTTTGGCTCCCGGCGCGACAATGTGGTTCTCCATATACATATCAGGCGCATTGAGGTAGCAGCCTTTTTAGCCTACGGCGAGCACCg < 1:1338060/97‑1 (MQ=255) aaTGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAgc > 2:1761211/1‑100 (MQ=255) gatctGCCTTTGGCTCCAGGCCAGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAgcg < 1:883900/96‑1 (MQ=255) aTGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAgcg > 2:2224545/1‑100 (MQ=255) ggTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGcgcg > 1:4369988/1‑100 (MQ=255) tGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGtt < 2:3879463/100‑1 (MQ=255) gCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGtt > 2:3340235/1‑99 (MQ=255) gCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTa < 1:1130791/100‑1 (MQ=255) cttccgatcTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTa < 1:3228417/92‑1 (MQ=255) cTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGc > 2:277562/1‑100 (MQ=255) tttGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGcc < 1:2792596/100‑1 (MQ=255) ggCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTgg > 1:3835018/1‑100 (MQ=255) ggCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTgg > 2:710345/1‑100 (MQ=255) gCTCCCGGCCTGACAATCACCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTAAGGAAGCAGCCTTTATCCTCTACTGGCACCACCGCCAGCTCGTTTGCCTg > 1:3676967/1‑98 (MQ=255) gCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGc < 2:832614/100‑1 (MQ=255) gCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGc < 1:3562662/100‑1 (MQ=255) gCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGc < 2:2999235/100‑1 (MQ=255) cTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGcc > 2:3686928/1‑100 (MQ=255) cTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGcc < 1:277561/100‑1 (MQ=255) tCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGccc > 2:3319318/1‑100 (MQ=255) cccGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGcccc > 1:1227041/1‑99 (MQ=255) cccGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCa > 2:1944206/1‑100 (MQ=255) cccGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTaagatcggaag > 2:3228435/1‑90 (MQ=255) cccGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCa > 2:3167137/1‑100 (MQ=255) cccGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCa > 1:484988/1‑100 (MQ=255) ccGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCAt < 2:2706630/100‑1 (MQ=255) ggCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCg < 2:4251734/100‑1 (MQ=255) ggCCCGAAAATCAGCTTCTCCATATACGTATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCg < 2:62608/100‑1 (MQ=255) ccGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCg > 1:2879274/1‑100 (MQ=255) ccGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCg > 1:2869308/1‑100 (MQ=255) gACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTc < 2:3810431/100‑1 (MQ=255) cAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCAt < 1:3167119/100‑1 (MQ=255) aaTCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATg < 2:2742485/100‑1 (MQ=255) aTCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATgc > 1:59675/1‑100 (MQ=255) tCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATgcg > 2:206054/1‑100 (MQ=255) cAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCCGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATgcgc > 1:2728664/1‑100 (MQ=255) | CTCAACGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGC > NC_000913/4115116‑4115310 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |