| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,156,112 | T→C | 25.2% | A117A (GCT→GCC) | holB → | DNA polymerase III, delta prime subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,156,112 | 0 | T | C | 25.2% | 248.8 / 102.6 | 155 | A117A (GCT→GCC) | holB | DNA polymerase III, delta prime subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (64/52); new base C (19/20); total (83/72) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.78e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.39e-01 | |||||||||||
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
AAAAATACGCTGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAGCCTGAACG > NC_000913/1156014‑1156210 | aaaTACGCTGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGcc < 1:3294747/100‑1 (MQ=255) tACGCTGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTa < 1:1655864/100‑1 (MQ=255) aCGCTGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTAc < 1:803702/100‑1 (MQ=255) aCGCTGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTAc < 2:4268071/100‑1 (MQ=255) gggCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAAcc < 2:285672/100‑1 (MQ=255) ggctgggATGCGGTCCTGGAGCTCTCCTCAAAGCTGCACGAGCGCGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGACTCTGCCTTAc < 1:3358225/88‑1 (MQ=255) gCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCg > 1:2474864/1‑99 (MQ=255) cGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGa > 1:1276891/1‑99 (MQ=255) ttGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTCACCCATGCTCCCTTACTAACCGAcgc > 1:3972305/1‑100 (MQ=255) tGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCcgcg > 2:415502/1‑100 (MQ=255) tGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCcgcg > 1:1468256/1‑100 (MQ=255) tGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCcgcg < 2:3635390/100‑1 (MQ=255) tGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCcgcg > 1:2295848/1‑100 (MQ=255) tGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACACACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCcgcg > 1:2344793/1‑100 (MQ=255) gCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCgg > 1:4313805/1‑100 (MQ=255) cGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGc < 2:2140158/100‑1 (MQ=255) ggTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCt > 2:3933293/1‑100 (MQ=255) aCGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAAc < 1:707517/100‑1 (MQ=255) aCGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAAc < 2:1143610/100‑1 (MQ=255) aCGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAAc < 1:1038323/100‑1 (MQ=255) tGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCa > 2:3789569/1‑100 (MQ=255) gAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCAt < 1:1943907/100‑1 (MQ=255) ggTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTg > 2:3532532/1‑100 (MQ=255) ggTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTg > 2:551854/1‑100 (MQ=255) gTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGc < 2:3911844/100‑1 (MQ=255) gTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGc < 1:1031587/100‑1 (MQ=255) tCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCt > 1:2843704/1‑100 (MQ=255) cACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTg > 2:1481148/1‑100 (MQ=255) cACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTg > 2:3245880/1‑100 (MQ=255) cACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTg > 2:1368955/1‑100 (MQ=255) aCCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGa < 1:85475/100‑1 (MQ=255) ccGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGaa > 2:2176291/1‑100 (MQ=255) ccGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGaa > 1:2556223/1‑100 (MQ=255) gAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGaaaa > 1:4290297/1‑100 (MQ=255) aaaGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGGCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCAGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACg > 1:1943201/1‑100 (MQ=255) aGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCt < 1:1750235/100‑1 (MQ=255) aGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCt < 2:3889850/100‑1 (MQ=255) gCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCtt < 1:4038312/100‑1 (MQ=255) cTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTg < 2:740651/100‑1 (MQ=255) cTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTg > 1:3044453/1‑100 (MQ=255) cTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTg < 2:2756536/100‑1 (MQ=255) cTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTg < 1:4035502/100‑1 (MQ=255) tGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGa > 1:936662/1‑100 (MQ=255) tGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGa < 1:3621419/100‑1 (MQ=255) gAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGaa > 1:3130934/1‑100 (MQ=255) aTGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAaga < 1:960208/100‑1 (MQ=255) tGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAagag > 2:2037237/1‑100 (MQ=255) tGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAagag > 1:1428880/1‑100 (MQ=255) gAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGc < 1:2220722/100‑1 (MQ=255) aGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGcc < 1:1274219/100‑1 (MQ=255) gcacgcacGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGcca < 1:1824577/100‑1 (MQ=255) gcacgcacGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGcca < 2:353752/100‑1 (MQ=255) acgcacgcTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGccacc > 1:1353999/1‑100 (MQ=255) acgcacgcTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGccac > 2:1940894/1‑99 (MQ=255) cgcacgcTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTGCTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGccac > 2:3077858/1‑98 (MQ=255) cgcacgcTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGccacca > 1:3972330/1‑100 (MQ=255) cgcacgcTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGccacca < 1:3823108/100‑1 (MQ=255) cgcacgcTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGccacca > 1:1805314/1‑100 (MQ=255) gcacgcTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACcag > 2:1872415/1‑100 (MQ=255) cacgcTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACcagc > 2:796792/1‑100 (MQ=255) cacgcTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACcagc < 2:159119/100‑1 (MQ=255) cacgcTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACcagc < 2:4290329/100‑1 (MQ=255) cgcTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACcagcag > 2:2263429/1‑100 (MQ=255) gcTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGccacctaagcg > 1:3304481/1‑94 (MQ=255) cTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGaa < 1:284632/100‑1 (MQ=255) aGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACt < 2:3287051/100‑1 (MQ=255) gtggtgCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTg > 1:3687470/1‑100 (MQ=255) gtggtgCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTg > 2:51346/1‑100 (MQ=255) tggtgCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTgg < 2:3922825/100‑1 (MQ=255) tggtgCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTgg < 2:4128876/100‑1 (MQ=255) ggtgCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGt < 1:144146/100‑1 (MQ=255) ggtgCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGt < 2:3524252/100‑1 (MQ=255) ggtgCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGt > 2:3424001/1‑100 (MQ=255) gtgCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACTCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGtt > 1:2225364/1‑100 (MQ=255) gtgCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGtt > 2:3423627/1‑100 (MQ=255) tgCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGttt > 1:2978955/1‑100 (MQ=255) gCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGtttt > 2:2733398/1‑100 (MQ=255) gCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGtttt > 2:2014141/1‑100 (MQ=255) cGATAGTCGTGTGGGTAGCCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATGGCTGAAAACGCTTTAAGAGCCATCAGCAGAAACTTgggtgt < 1:3442664/99‑5 (MQ=255) aaGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCt > 2:4153633/1‑100 (MQ=255) aGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTg > 2:3948174/1‑100 (MQ=255) gTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTgg < 2:3166450/100‑1 (MQ=255) tCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGc < 1:3288567/100‑1 (MQ=255) tCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGc < 2:2417011/100‑1 (MQ=255) cGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCt > 1:4387732/1‑100 (MQ=255) ttGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTAcc < 1:3570382/100‑1 (MQ=255) tGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTAccc > 1:266164/1‑100 (MQ=255) ggTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCcgc > 2:1477167/1‑100 (MQ=255) ggTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCcgc > 2:921595/1‑100 (MQ=255) tagccGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGa < 2:2644360/97‑1 (MQ=255) aCCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAGc > 2:1968319/1‑100 (MQ=255) ccGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAGcc > 1:1904794/1‑100 (MQ=255) cGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAGCCt < 1:1748115/100‑1 (MQ=255) gATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAGCCTg > 2:1809964/1‑100 (MQ=255) gATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAGCCTg > 1:3721112/1‑100 (MQ=255) gATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAGCCTg > 2:2181627/1‑100 (MQ=255) tgccgcCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAGCCTGaa < 2:479732/100‑1 (MQ=255) gctgcCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAGCCTGAAc < 1:1477161/100‑1 (MQ=255) gctgcCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAGCCTGAAc > 1:2283054/1‑100 (MQ=255) ctgcCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAGCCTGAACg > 2:1194579/1‑100 (MQ=255) | AAAAATACGCTGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAGCCTGAACG > NC_000913/1156014‑1156210 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |