Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,329,743 | G→A | 29.6% | V138M (GTG→ATG) | sohB → | inner membrane protein, S49 peptidase family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,329,743 | 0 | G | A | 29.6% | 206.0 / 100.3 | 135 | V138M (GTG→ATG) | sohB | inner membrane protein, S49 peptidase family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (53/42); new base A (25/15); total (78/57) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.68e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
GTGCTGGATTTTAAAGGCAGCATGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTAACTGT > NC_000913/1329644‑1329840 | gTGCTGGATTTTAAAGGCAGCATGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTtg < 1:1053316/100‑1 (MQ=255) tGCTGGATTTTAAAGGCAGCATGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTtgt < 2:2120875/100‑1 (MQ=255) cTGGATTTTAAAGGCAGCATGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTATGc > 1:266400/1‑100 (MQ=255) tGGATTTTAAAGGCAGCATGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGCTCCGGTTGTGc > 1:1345939/1‑99 (MQ=255) tGGATTTTAAAGGCAGCATGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCt > 2:4405737/1‑100 (MQ=255) ggATTTTAAAGGCAGCATGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTc > 2:3716387/1‑100 (MQ=255) ggATTTTAAAGGCAGCATGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTc > 2:1429207/1‑100 (MQ=255) ggATTTGAAAGGCAGCATGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTATGCTc < 1:2642102/100‑1 (MQ=255) gATTTTAAAGGCAGCATGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTcc < 2:2083236/100‑1 (MQ=255) gATTTTAAAGGCAGCATGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTcc > 1:1531770/1‑100 (MQ=255) gATTTTAAAGGCAGCATGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTATGCTcc > 2:2897113/1‑100 (MQ=255) tAAAGGCAGCATGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTATGCTCCGTCTg < 2:3294878/100‑1 (MQ=255) aaGGCAGCATGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGTATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGa < 1:1568542/100‑1 (MQ=255) aGGCAGCATGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGaa > 1:1288023/1‑100 (MQ=255) aGGCAGCATGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGaa > 2:3421686/1‑100 (MQ=255) aGGCAGCATGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGa > 2:682975/1‑99 (MQ=255) ggCAGCATGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTATGCTCCGTCTGGaaa > 2:1870842/1‑100 (MQ=255) gcagcaTGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAg > 2:4008720/1‑100 (MQ=255) cagcaTGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGc > 1:956740/1‑100 (MQ=255) cagcaTGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGc > 2:2276350/1‑100 (MQ=255) cagcaTGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTATGCTCCGTCTGGAAAGc > 2:1098115/1‑100 (MQ=255) gcaTGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGccc < 2:2998869/100‑1 (MQ=255) caTGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCTCAGCATTCAAACCTCAGGATCAGGTTATGCTCCGTCTGGAAAGCCCt > 1:596494/1‑100 (MQ=255) caTGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTATGCTCCGTCTGGAAAGCCCt < 2:1126798/100‑1 (MQ=255) cGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGgc > 1:2479834/1‑100 (MQ=255) gCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTATGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGgca < 2:1087162/100‑1 (MQ=255) cATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGgcatgg < 1:3332964/100‑1 (MQ=255) tGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGgcatggtg < 2:231641/100‑1 (MQ=255) gAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGgcatggtgc > 2:2399747/1‑100 (MQ=255) aaGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAAACGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGgcatggtgca > 1:4150146/1‑100 (MQ=255) gTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGgcatggtgcatg < 2:4230222/100‑1 (MQ=255) gTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGgcatggtgcatg < 1:3421665/100‑1 (MQ=255) tGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGgcatggtgcatgg < 1:3124079/100‑1 (MQ=255) gAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGgcatggtgcatggt > 1:2294456/1‑100 (MQ=255) gAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGgcatggtgcatggt > 2:2425537/1‑100 (MQ=255) gAACTCGCTACGCGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCCTTCAAACCGCAGGATCAGGTTATGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGgcatggtgcatggt > 1:2020615/1‑100 (MQ=255) aCTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTa < 1:3565388/100‑1 (MQ=255) aCTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTATGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTa < 2:3136452/100‑1 (MQ=255) cGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACgg > 2:351519/1‑100 (MQ=255) cGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACgg > 2:2553581/1‑100 (MQ=255) cGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACgg < 2:2947649/100‑1 (MQ=255) cGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACgg < 2:3131738/100‑1 (MQ=255) cGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACg < 2:4045863/99‑1 (MQ=255) cTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGc > 2:2495849/1‑100 (MQ=255) cTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGc < 2:3043321/100‑1 (MQ=255) cTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGc < 1:2615100/100‑1 (MQ=255) aCGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTATGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTg < 1:2534415/100‑1 (MQ=255) cGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTgg < 1:1429201/100‑1 (MQ=255) cGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTATGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTgg > 2:2826867/1‑100 (MQ=255) gTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTggc > 2:1397783/1‑100 (MQ=255) gAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTggcgg > 1:1564296/1‑100 (MQ=255) gAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTggcgg > 2:3676862/1‑100 (MQ=255) gAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTATGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTggcgg > 1:105547/1‑100 (MQ=255) gagaTAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCtt > 2:1765959/1‑100 (MQ=255) gaTAACGGCTGTCCTCGCAGCATTCAAACCGCAGTCTCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCg < 2:3699566/100‑1 (MQ=255) gaTAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCg > 2:3402961/1‑100 (MQ=255) gaTAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCg > 1:479593/1‑100 (MQ=255) aTAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGc < 2:4139305/100‑1 (MQ=255) tAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCa > 2:3228007/1‑100 (MQ=255) tAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCa > 2:1539128/1‑100 (MQ=255) cGGCTGTACTCGCAGCATTCGAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACt < 1:3196803/100‑1 (MQ=255) gCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGc > 1:1929327/1‑100 (MQ=255) gCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTATGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGc < 1:2849733/100‑1 (MQ=255) cTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCa < 2:1504547/100‑1 (MQ=255) tACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCg > 2:1720284/1‑100 (MQ=255) cTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTATGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTc < 2:4328587/100‑1 (MQ=255) cTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTATGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTc > 2:3946416/1‑100 (MQ=255) cGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTg > 2:1214229/1‑100 (MQ=255) cGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTg > 2:634521/1‑100 (MQ=255) agcaTTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTgcgc < 2:3484469/100‑1 (MQ=255) gcaTTCAAACCGTAGGATCAGGTTATGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGcgcg > 2:2898586/1‑100 (MQ=255) gcaTTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTGTGcgcg > 1:1960513/1‑100 (MQ=255) gcaTTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGcgcg > 1:1687288/1‑100 (MQ=255) caTTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGa > 1:3743545/1‑100 (MQ=255) aTTCAAACCGCAGGATCAGGTTATGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGAt < 2:4378523/100‑1 (MQ=255) ttCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATa > 1:628547/1‑100 (MQ=255) tCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATaa > 1:3300221/1‑100 (MQ=255) tCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATaa > 1:235612/1‑100 (MQ=255) cAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCCACTGCAGCGTCTGCGCGATaaa > 1:699436/1‑100 (MQ=255) cAAACCGCAGGATCAGGTTATGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATaaa > 1:3116625/1‑100 (MQ=255) cAAACCGCAGGATCAGGTTATGCTCCGTCTGGAAAGCACTGGGGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGcgcg > 1:2089168/1‑95 (MQ=255) aaaCCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATaaaa > 2:3421322/1‑100 (MQ=255) aaCCGCAGGATCAGGTTATGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATaaaaa > 1:4012484/1‑100 (MQ=255) aCCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCACTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAAc < 1:2313351/100‑1 (MQ=255) gCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACAtt < 1:589130/100‑1 (MQ=255) gCAGGATCAGGTTATGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAAc < 1:1179980/97‑1 (MQ=255) ggATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCt > 2:546133/1‑100 (MQ=255) ggATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCt > 1:3546836/1‑100 (MQ=255) ggATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCt > 2:2656166/1‑100 (MQ=255) ggATCAGGTTATGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTcc < 2:863152/99‑1 (MQ=255) gATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCtt > 2:431963/1‑100 (MQ=255) aTCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCttt < 1:1126061/100‑1 (MQ=255) tCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTa < 2:779498/100‑1 (MQ=255) cAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTaa < 2:941749/100‑1 (MQ=255) aGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTAAc < 2:2233083/100‑1 (MQ=255) aGGTTATGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTAAc > 1:2830582/1‑100 (MQ=255) ggTTATGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTAACt > 2:1036823/1‑100 (MQ=255) gTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTAACTg > 1:4274551/1‑100 (MQ=255) gTTATGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTAACTg > 1:4189453/1‑100 (MQ=255) ttGTGCGCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCAGGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTAACTGt < 1:2075056/100‑1 (MQ=255) | GTGCTGGATTTTAAAGGCAGCATGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTAACTGT > NC_000913/1329644‑1329840 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |