| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,520,080 | G→T | 19.3% | intergenic (+16/‑182) | curA → / → mcbR | curcumin/dihydrocurcumin reductase, NADPH‑dependent/colanic acid and biofilm gene transcriptional regulator, MqsR‑controlled |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,520,080 | 0 | G | T | 19.3% | 525.5 / 107.1 | 217 | intergenic (+16/‑182) | curA/mcbR | curcumin/dihydrocurcumin reductase, NADPH‑dependent/colanic acid and biofilm gene transcriptional regulator, MqsR‑controlled |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (76/99); new base T (19/23); total (95/122) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.64e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.63e-01 | |||||||||||
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
GAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTT > NC_000913/1519981‑1520178 | gagaATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGgcggcg > 2:416253/1‑100 (MQ=255) aTGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAg < 2:2263734/100‑1 (MQ=255) tGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAgc > 2:1588047/1‑100 (MQ=255) tGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAgc < 2:3991851/100‑1 (MQ=255) cgcCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAgccg < 1:3244812/100‑1 (MQ=255) gcCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAgccgc < 2:1974042/100‑1 (MQ=255) ccACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAgccgcc > 1:584361/1‑100 (MQ=255) ccACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAgccgcc < 2:3436862/100‑1 (MQ=255) ccACAGACGTTTATCGGCCTGCAGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGTGAGCTTAATCAAGTTTAAACGGCGGCGTAAgcag > 1:3039761/1‑96 (MQ=255) cacaGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTTAACGGCGGCGTAAGCCGCCa < 1:2688030/100‑1 (MQ=255) cacaGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCa < 2:1300981/100‑1 (MQ=255) cacaGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCa < 1:1375445/100‑1 (MQ=255) cacaGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCa < 1:126214/100‑1 (MQ=255) acaGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgt < 1:752409/100‑3 (MQ=255) acaGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgt < 1:4185423/100‑3 (MQ=255) acaGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgt < 2:2807709/100‑3 (MQ=255) caGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgtt < 2:1617628/100‑4 (MQ=255) caGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgtt < 2:1048235/100‑4 (MQ=255) caGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgtt < 2:1126965/100‑4 (MQ=255) caGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgtt < 2:4259170/100‑4 (MQ=255) gACGTTTATCGACCTGGTGACTGGTAAAAACTGCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgtt < 1:112988/98‑4 (MQ=255) aCGGTTATCGCCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAATGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgttgaa < 1:2899707/100‑7 (MQ=255) cGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATaaaaa > 2:708257/1‑100 (MQ=255) gTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAATGGCGGCTTACgccgccgttgaaac < 1:2071584/100‑9 (MQ=38) gTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgttgaaac < 1:3447530/100‑9 (MQ=255) gTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgttgaaac < 2:547371/100‑9 (MQ=255) ttATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATcc < 1:1931606/100‑1 (MQ=255) tATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCa > 2:4122988/1‑100 (MQ=255) tATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGGGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGCTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCa < 1:2639705/100‑1 (MQ=255) aTCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAg < 2:4230464/100‑1 (MQ=255) aTCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAg > 2:1483189/1‑100 (MQ=255) cGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCCAAGTGGTGATCAGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCACCGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGc < 1:364434/100‑1 (MQ=255) cGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGc < 2:3054317/100‑1 (MQ=255) ggCCTGCTGCAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGCTCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGTCGCCATAAAAATCCAGGCa < 1:4336237/100‑1 (MQ=255) ctgAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGc < 1:3063866/100‑1 (MQ=255) gAAGGGTAAAATCTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGAGATGATTAGAGTTGCAACAGCGGCGTAGGCCGGCAGAGAAATTCATGCAAAAAGCtt > 1:3529060/1‑100 (MQ=255) gAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCtt > 2:3743885/1‑100 (MQ=255) ggTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTAttt > 2:1381926/1‑100 (MQ=255) ggTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGATTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTAttt > 1:919062/1‑100 (MQ=255) tAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTc < 2:4301466/100‑1 (MQ=255) aaCTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCt > 1:2795523/1‑100 (MQ=255) actgccgCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCtt < 1:3070306/94‑1 (MQ=255) aCTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCtt > 2:4101879/1‑100 (MQ=255) cTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCttt < 2:453381/100‑1 (MQ=255) cGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTttaat > 2:3609435/1‑100 (MQ=255) ggCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTttaatt < 2:3089566/100‑1 (MQ=255) ggCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTttaatt > 2:1910264/1‑100 (MQ=255) gCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTttaatta > 2:4390587/1‑100 (MQ=255) gCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAAACAAGACAAAAAGCTTATTTTCAGCTttaatta < 1:3319135/100‑1 (MQ=255) cAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTttaattaa < 2:2773862/100‑1 (MQ=255) cAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTttaatta < 1:3314588/99‑1 (MQ=255) aaaGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATtaac > 2:3156690/1‑100 (MQ=255) aaaGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTTATTTTCAGCTttaatta < 1:131893/98‑1 (MQ=255) gtggtgATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATtaactaa > 2:907153/1‑100 (MQ=255) ggtgATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATtaactaac < 1:4277862/99‑1 (MQ=255) gtgATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCATCGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAAGAAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAAcc < 1:3588230/99‑1 (MQ=255) tgATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACcac > 1:859180/1‑100 (MQ=255) tgATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACcac > 2:272858/1‑100 (MQ=255) tgATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACcac > 2:2706556/1‑100 (MQ=255) tCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCAcatc < 1:2620748/100‑1 (MQ=255) ccacgTGGCGAGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGTTATAAAAAACCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACcac < 1:484200/93‑1 (MQ=255) ccGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCAcatca < 1:4066828/100‑1 (MQ=255) ccGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCAcatca < 2:1845252/100‑1 (MQ=255) tGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGtt > 2:3853147/1‑100 (MQ=255) ggCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTc < 1:4069233/100‑1 (MQ=255) gggTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTctgc < 2:1200202/100‑1 (MQ=255) tgatgaTTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAAACAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTctgct < 1:2528554/98‑1 (MQ=255) gatgatTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTgctgct < 1:2280125/100‑1 (MQ=255) atgatTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCta < 2:3323449/100‑1 (MQ=255) tgatTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCtaa > 1:3575593/1‑100 (MQ=255) tgatTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTAAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTctgctg > 2:895539/1‑96 (MQ=255) gatTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCtaat < 2:3923578/100‑1 (MQ=255) gatTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCtaat < 2:588590/100‑1 (MQ=255) gatTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCtaat < 2:1727041/100‑1 (MQ=255) gatctaGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCtaata < 2:1339472/95‑1 (MQ=255) atTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCtaata < 2:3466661/100‑1 (MQ=255) tAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATaac < 2:1145763/100‑1 (MQ=255) tAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCGTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCtaataa > 1:628033/1‑99 (MQ=255) aaGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATaacaa < 2:3347068/100‑1 (MQ=255) ggtttttatggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATaacaac > 2:2987365/10‑100 (MQ=255) gTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAacaaca > 2:827370/1‑100 (MQ=255) gTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAacaaca > 2:2028371/1‑100 (MQ=255) gTTTCAACGGCGACGTAAGCCGCCATAAAAATCCAAACAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTGCTGCTGCTAATaacaac < 1:2117891/99‑1 (MQ=255) atttttatggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAacaaca > 1:779964/9‑100 (MQ=255) ttttatggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACaaa > 2:1562635/7‑100 (MQ=255) ttttatggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACaaa > 1:1596567/7‑100 (MQ=255) tCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAg < 2:2420737/100‑1 (MQ=255) ttatggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAgg > 2:3263270/5‑100 (MQ=255) cAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAgg < 1:1456359/100‑1 (MQ=255) tatggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCTGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTTCTGCTAATAACAACAAAgg > 1:1021494/4‑99 (MQ=255) tatggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTCTTTTCCGCCTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAgg > 1:244218/4‑99 (MQ=255) atggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTg > 1:1786868/3‑100 (MQ=255) atggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTg > 1:2174135/3‑100 (MQ=255) atggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTg > 1:1390655/3‑100 (MQ=255) atggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTg > 1:2984417/3‑100 (MQ=255) cggcggCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGa > 1:1242092/1‑100 (MQ=255) ggcggcGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAg < 2:649275/100‑1 (MQ=255) ggcggcGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAg < 2:2845105/100‑1 (MQ=255) gcggcgTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTg > 1:1891031/1‑97 (MQ=255) gcgTAAGCCGCCATAAACATCCAGGAAAAAAGCTTATATTCAGCTATAATTAACTAACCACAACATTATTCTGCTGCTAATAACAAAAAAGGTGAGTgg > 1:2357421/1‑99 (MQ=255) | GAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTT > NC_000913/1519981‑1520178 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |