| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,520,083 | A→C | 19.0% | intergenic (+19/‑179) | curA → / → mcbR | curcumin/dihydrocurcumin reductase, NADPH‑dependent/colanic acid and biofilm gene transcriptional regulator, MqsR‑controlled |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,520,083 | 0 | A | C | 19.0% | 491.1 / 119.2 | 221 | intergenic (+19/‑179) | curA/mcbR | curcumin/dihydrocurcumin reductase, NADPH‑dependent/colanic acid and biofilm gene transcriptional regulator, MqsR‑controlled |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (80/98); new base C (19/23); total (100/121) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.94e-01 | |||||||||||
Only 100 of 222 total aligned reads displayed.
ATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTTAT > NC_000913/1519985‑1520181 | tGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAgc < 2:4189885/100‑1 (MQ=255) cgcCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAgccg > 2:1293318/1‑100 (MQ=255) gcCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAgccgc < 1:4317624/100‑1 (MQ=255) gcCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAgccgc < 1:2997821/100‑1 (MQ=255) ccACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAgccgcc > 1:584361/1‑100 (MQ=255) cacaGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCa > 2:2999449/1‑100 (MQ=255) acaGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGTGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCa > 1:1898284/1‑99 (MQ=255) acaGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgt < 1:4185423/100‑3 (MQ=255) caGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgtt < 2:4259170/100‑4 (MQ=255) aGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgttg < 2:3976190/100‑5 (MQ=255) gACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGTGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATaaa < 2:1399302/100‑1 (MQ=255) gACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATaaa < 2:356749/100‑1 (MQ=255) gACGTTTATCGACCTGGTGACTGGTAAAAACTGCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgtt < 1:112988/98‑4 (MQ=255) cGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATaaaaa > 1:758317/1‑100 (MQ=255) cGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATaaaaa > 2:4396344/1‑100 (MQ=255) cGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATaaaaa > 2:708257/1‑100 (MQ=255) cGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATaaaaa < 2:2520445/100‑1 (MQ=255) gTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAATGGCGGCTTACgccgccgttgaaac < 1:2071584/100‑9 (MQ=38) gTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgttgaaac < 2:547371/100‑9 (MQ=255) tttATCGGCTTGCTGAAGGGTAAAAACGTCGGCAAAGTGGTGATCGGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATc < 1:780700/100‑1 (MQ=255) tttATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATc > 2:4121807/1‑100 (MQ=255) tATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCa > 1:3069607/1‑100 (MQ=255) aTCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAg < 2:4230464/100‑1 (MQ=255) aTCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAg < 1:3448441/100‑1 (MQ=255) aTCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAg < 1:2297857/100‑1 (MQ=255) cGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGc < 2:3054317/100‑1 (MQ=255) ggCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCa < 2:343846/100‑1 (MQ=255) ggCCTGCTGAAGGATAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTGAGACGCCATAAAAATCCAGGCa > 1:3084422/1‑100 (MQ=255) gCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGAAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGCTTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCaa > 1:2661729/1‑100 (MQ=255) gctgAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATGAAAGATTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCGAGGCAACAAg > 1:986137/1‑100 (MQ=255) ctgAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGc > 1:1386317/1‑100 (MQ=255) gAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGGGGTGCTCTCCGTGGCGTGTGCTGATTCAAGCTTCAACGGCAGCGTAACCCGCCATAAAAATCCAGCCACAAAGCt > 1:1255623/1‑99 (MQ=255) ggTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGATTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTAttt > 1:919062/1‑100 (MQ=255) gTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTAtttt > 2:166646/1‑100 (MQ=255) tAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTc < 2:4301466/100‑1 (MQ=255) aaaaaCTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCa < 2:1869607/100‑1 (MQ=255) aaaaCTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAg > 2:1564531/1‑100 (MQ=255) aaaCTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGc < 2:1359726/100‑1 (MQ=255) cTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCttt > 2:3717400/1‑100 (MQ=255) cTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCttt < 2:453381/100‑1 (MQ=255) tCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTttaa > 2:3493079/1‑100 (MQ=255) cGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTttaat < 1:3578398/100‑1 (MQ=255) gCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTttaatta < 1:3302635/100‑1 (MQ=255) gCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTAAACGGCGGAGTAAGCCGCCATATAAATGCGGGAGAAAAGGTTATGTTCAgtg > 2:2868363/1‑91 (MQ=255) cAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTttaattaa > 1:2624700/1‑100 (MQ=255) cAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTttaattaa < 2:2773862/100‑1 (MQ=255) cAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTttaatta < 1:3314803/99‑1 (MQ=255) aaaGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTTATTTTCAGCTttaatta < 1:131893/98‑1 (MQ=255) aaGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATtaact > 1:1543022/1‑100 (MQ=255) gtggtgATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATtaactaa > 2:907153/1‑100 (MQ=255) tggtgATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATtaactaac > 2:1735685/1‑100 (MQ=255) ggtgATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATtaactaac < 1:4277862/99‑1 (MQ=255) ggtgATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAAcc > 2:4018473/1‑100 (MQ=255) ggtgATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAAcc > 1:2244977/1‑100 (MQ=255) ggtgATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAAcc < 2:2741763/100‑1 (MQ=255) ggtgATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTAAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAAGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAAcc < 1:360949/100‑1 (MQ=255) gATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAACAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACcaca > 1:3040460/1‑100 (MQ=255) tCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCAcatc > 2:2844664/1‑100 (MQ=255) tCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCAcatc > 2:2117898/1‑100 (MQ=255) ccGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCAcatca < 1:4066828/100‑1 (MQ=255) cgTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTg < 2:1144556/100‑1 (MQ=255) tGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGtt > 2:227013/1‑100 (MQ=255) tGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGtt > 2:3853147/1‑100 (MQ=255) ggCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTc < 1:722606/100‑1 (MQ=255) gCGGGTGATGACTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTct < 2:2715244/100‑1 (MQ=255) gggTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTctgc < 2:1200202/100‑1 (MQ=255) tgatgaTTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAAACAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTctgct < 1:2528554/98‑1 (MQ=255) gatgatTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTgctgct < 1:2795722/100‑1 (MQ=255) atgatTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCta < 2:3323449/100‑1 (MQ=255) tgatTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTAAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTctgctg > 2:895539/1‑96 (MQ=255) gatTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCtaat < 2:3923578/100‑1 (MQ=255) gatTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCtaat < 2:588590/100‑1 (MQ=255) atTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCtaata > 1:1997707/1‑100 (MQ=255) ttAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCtaataa > 2:1124213/1‑100 (MQ=255) tAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAATATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATaac < 1:3728690/100‑1 (MQ=255) tAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCGTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCtaataa > 1:628033/1‑99 (MQ=255) aaGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATaacaa < 2:3347068/100‑1 (MQ=255) gatttttatggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGTTAATaacaac > 2:1957248/10‑100 (MQ=255) gTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAacaaca > 2:827370/1‑100 (MQ=255) gTTTCAACGGCGACGTAAGCCGCCATAAAAATCCAAACAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTGCTGCTGCTAATaacaac < 1:2117891/99‑1 (MQ=255) tttCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAAcaacaa > 2:1984406/1‑100 (MQ=255) ttttatggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACaaa > 1:1596567/7‑100 (MQ=255) tttatggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCCCATCATTGTTCTGCTGCTAATAacaaca > 1:3570387/6‑97 (MQ=255) cAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAgg < 1:1269992/100‑1 (MQ=255) cAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAgg > 1:4348871/1‑100 (MQ=255) tatggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCTGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTTCTGCTAATAACAACAAAgg > 1:1021494/4‑99 (MQ=255) tatggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTCTTTTCCGCCTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAgg > 1:244218/4‑99 (MQ=255) tatggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAgg > 1:2978286/4‑99 (MQ=255) tatggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAgg > 1:1443145/4‑99 (MQ=255) aaCGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGt < 2:3201567/100‑1 (MQ=255) atggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGt > 1:3417070/3‑99 (MQ=255) atggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTg > 1:1786868/3‑100 (MQ=255) aCGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACGAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTg < 1:2779570/100‑1 (MQ=255) ggcggcGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAg < 2:649275/100‑1 (MQ=255) ggcgTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTgg > 2:1542568/1‑100 (MQ=255) gcgTAAGCCGCCATAAACATCCAGGAAAAAAGCTTATATTCAGCTATAATTAACTAACCACAACATTATTCTGCTGCTAATAACAAAAAAGGTGAGTgg > 1:2357421/1‑99 (MQ=255) gcgTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGt > 2:3263712/1‑100 (MQ=255) gcgTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGt > 2:3131393/1‑100 (MQ=255) cgTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGtt < 2:1605964/100‑1 (MQ=255) cgTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGtt > 2:1312864/1‑100 (MQ=255) | ATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTTAT > NC_000913/1519985‑1520181 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |