| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,579,563 | G→T | 17.2% | intergenic (‑221/+70) | yddA ← / ← ydeM | putative multidrug ABC transporter permease/ATPase/putative YdeN‑specific sulfatase‑maturating enzyme |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,579,563 | 0 | G | T | 17.2% | 412.2 / 72.3 | 163 | intergenic (‑221/+70) | yddA/ydeM | putative multidrug ABC transporter permease/ATPase/putative YdeN‑specific sulfatase‑maturating enzyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (63/72); new base T (13/15); total (76/87) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.36e-01 | |||||||||||
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
TTATGCTATTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATC > NC_000913/1579464‑1579662 | ttatgCTATTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAg < 2:2953843/100‑1 (MQ=255) tatgCTATTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAgg < 1:3715620/100‑1 (MQ=255) tatgCTATTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAgg < 2:2368511/100‑1 (MQ=255) tatgCTATTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAgg < 1:164031/100‑1 (MQ=255) tgCTTTTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGaa < 1:414122/100‑1 (MQ=255) tgCTATTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGaa > 2:2753480/1‑100 (MQ=255) gCTATTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAAt > 2:2569605/1‑100 (MQ=255) cTATTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAAtt > 1:127387/1‑100 (MQ=255) ttGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTAt < 1:1687280/100‑1 (MQ=255) gATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGt > 2:1789357/1‑100 (MQ=255) gATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGt > 2:776861/1‑100 (MQ=255) aTCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACATAAATTCGTGTCggg < 2:2307758/100‑1 (MQ=255) aTCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCggg < 1:385539/100‑1 (MQ=255) aTCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCgg > 1:3798320/1‑99 (MQ=255) tcgaGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGACGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGt > 1:3681208/4‑100 (MQ=255) tCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACATAAATTCCTGTCGGGt < 2:1376089/100‑1 (MQ=255) tCAAGGATATTGCGAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGAGTTTGGTATGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGt > 1:3681142/1‑100 (MQ=255) cAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACATAAATTCCTGTCGGGTg < 2:661691/100‑1 (MQ=38) cAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACATAAATTCCTGTCGGGTg < 2:2150737/100‑1 (MQ=39) cAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACATAAATTCCTGTCGGGTg < 1:2282100/100‑1 (MQ=38) cAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCggg > 1:2756659/1‑98 (MQ=255) cAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTg < 1:3974866/100‑1 (MQ=255) cAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTg < 1:2053851/100‑1 (MQ=255) aaGGATATTTCTAATGCCGTGGTGCATACCACGTAAGCCAGGATTTGCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACATAAATTCCTGTCGGGTg < 1:1125375/99‑1 (MQ=37) aaGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGTTTTTCGCAAGGGAAGATGCTGCTGGCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGc < 1:3262206/100‑1 (MQ=255) aaGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACATAAATTCCTGTCGGGTg < 2:2730188/99‑1 (MQ=38) aGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACATAAATTCCTGTCGGGTgtt < 1:77545/100‑3 (MQ=38) ggATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACATAAATTCCTGTCGGGTgttt < 2:1450716/100‑4 (MQ=38) ggATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACATAAATTCCTGTCGGGTgttt < 1:547243/100‑4 (MQ=38) atatTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACATAAATTCCTGTCGGGTgtttcg < 1:3134287/100‑6 (MQ=37) atatTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACATAAATTCCTGTCGGGTgtttcg < 2:4225345/100‑6 (MQ=37) atatTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTg < 1:3634592/100‑1 (MQ=255) tatTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTga > 1:3998383/1‑99 (MQ=255) tatTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGt < 1:1652658/100‑1 (MQ=255) ttGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTa < 1:962576/100‑1 (MQ=255) gCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAg < 2:2834837/100‑1 (MQ=255) cTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAgg < 2:4038217/100‑1 (MQ=255) tAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGt > 2:3379637/1‑100 (MQ=255) aaTGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTc > 2:4102686/1‑100 (MQ=255) aTGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCa < 1:196061/100‑1 (MQ=255) gCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATa > 2:2227940/1‑100 (MQ=255) cccTTATACATACCACGTAAGCCAGGATTTTCCCAAGGGAAGACGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATa < 1:3889535/99‑1 (MQ=255) cccTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATaa < 2:85822/100‑1 (MQ=255) cccTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATaa > 1:691808/1‑100 (MQ=255) tGATGCATACCTCGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGCATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATaagaa > 1:2318914/1‑100 (MQ=255) tGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAagga > 2:407834/1‑100 (MQ=255) tGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAagga < 2:1642371/100‑1 (MQ=255) gCATACGACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACAAGCGACAGGAATGGATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAagga < 1:3798712/99‑1 (MQ=255) cATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAaggagg < 2:2461519/100‑1 (MQ=255) cATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAaggagg < 2:464254/100‑1 (MQ=255) cATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAaggagg > 2:3455386/1‑100 (MQ=255) cATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAaggagg > 1:2410825/1‑100 (MQ=255) aTACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGc > 2:196860/1‑100 (MQ=255) aTACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGc > 2:3054431/1‑100 (MQ=255) tACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCt > 2:2529227/1‑100 (MQ=255) aCCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGATGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTa > 1:1278117/1‑100 (MQ=255) aCCACGTAAGCCAGGAGTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGCAACACCCGACAGGAAGTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTa < 1:882798/100‑1 (MQ=255) ccACGTAAGCCAGGATATTCGCAGGGTGAGATGATGATGACGACACACCCGACAGGAAATTATGTCGGATGCCTTATTAAGGTCATAAGAAGGTGGCTa > 1:150408/1‑99 (MQ=255) cACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAg < 2:691809/100‑1 (MQ=255) cACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAg < 1:3684189/100‑1 (MQ=255) cGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGTCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGaa > 2:3491501/1‑100 (MQ=255) cGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGaa > 2:2887654/1‑100 (MQ=255) tAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATg < 2:837420/100‑1 (MQ=255) aGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTACGAATGGa < 2:2318924/100‑1 (MQ=255) ccAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGt > 1:1627243/1‑100 (MQ=255) aGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTa < 1:2529214/100‑1 (MQ=255) ggATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTaa > 2:2803945/1‑100 (MQ=255) gATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTaaa < 1:474308/100‑1 (MQ=255) aTTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTAAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTaaaa < 2:3113079/100‑1 (MQ=255) ttttCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAag > 2:4054816/1‑100 (MQ=255) cGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAagagag > 1:701264/1‑100 (MQ=255) gCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGc < 2:1434344/100‑1 (MQ=255) gCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGc < 2:639868/100‑1 (MQ=255) gCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGc > 1:1752299/1‑100 (MQ=255) cAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCg > 2:531022/1‑100 (MQ=255) gggAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTGTGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGtta > 1:2356284/1‑100 (MQ=255) gggAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGtta < 2:3624862/100‑1 (MQ=255) aGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTattaa > 2:2408043/1‑100 (MQ=255) tgatgatgaCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGTAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTattaatta > 2:1186679/1‑100 (MQ=255) tgatgatgaCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTattaatt > 1:1818551/1‑99 (MQ=255) gatgatgaCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAattat < 1:1189222/100‑1 (MQ=255) cttaacaaggcacCCGACATAAATTCCTGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATtct > 2:4007132/11‑100 (MQ=25) cttaacaaggcacCCGACATAAATTCCTGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATtct > 2:3421365/11‑100 (MQ=25) tgaCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTcc > 2:3218916/1‑100 (MQ=255) tgaCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTcc > 1:3034876/1‑100 (MQ=255) aCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCAt < 2:719540/100‑1 (MQ=255) aggcacCCGACATAAATTCCTGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTg > 1:972731/4‑100 (MQ=38) ggcacCCGACATAAATTCCTGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGt > 2:1789875/3‑100 (MQ=38) cacCCGACATAAATTCCTGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGttt > 2:3738161/1‑100 (MQ=38) cacCCGACATAAATTCCTGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGttt > 1:4282195/1‑100 (MQ=38) cacCCGACATAAATTCCTGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGttt > 1:337706/1‑100 (MQ=38) acCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAGGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGttt < 1:3396891/99‑1 (MQ=255) acCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGtttt > 1:1203660/1‑100 (MQ=255) acCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGtt < 1:2951510/98‑1 (MQ=255) ccGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGc > 2:949836/1‑100 (MQ=255) ccGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGc < 2:2066676/100‑1 (MQ=255) cGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCa > 1:3384795/1‑100 (MQ=255) cGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCa < 2:2281580/100‑1 (MQ=255) ggAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGATTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATc > 2:516111/1‑100 (MQ=255) ggAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATc > 2:425553/1‑100 (MQ=255) | TTATGCTATTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATC > NC_000913/1579464‑1579662 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |