| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,579,569 | T→C | 16.3% | intergenic (‑227/+64) | yddA ← / ← ydeM | putative multidrug ABC transporter permease/ATPase/putative YdeN‑specific sulfatase‑maturating enzyme |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,579,569 | 0 | T | C | 16.3% | 389.3 / 67.5 | 172 | intergenic (‑227/+64) | yddA/ydeM | putative multidrug ABC transporter permease/ATPase/putative YdeN‑specific sulfatase‑maturating enzyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (70/73); new base C (13/15); total (83/89) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.39e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.33e-02 | |||||||||||
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
ATTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCATAATG > NC_000913/1579471‑1579669 | aTTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTa < 1:532673/100‑1 (MQ=255) ttGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTAt < 2:578259/100‑1 (MQ=255) tGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATg < 1:751804/100‑1 (MQ=255) gATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGt > 2:1789357/1‑100 (MQ=255) aTCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACATAAATTCGTGTCggg < 2:2307758/100‑1 (MQ=255) aTCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCggg < 1:384714/100‑1 (MQ=255) aTCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCgg > 1:3798320/1‑99 (MQ=255) tcgaGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGACGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGt > 1:3681208/4‑100 (MQ=255) tCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACATAAATTCCTGTCGGGt < 1:3220606/100‑1 (MQ=255) tCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACATAAATTCCTGTCGGGt < 2:1376089/100‑1 (MQ=255) tCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGt > 2:1652665/1‑100 (MQ=255) tCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGt < 2:4391788/100‑1 (MQ=255) cAAGGATATTGCTAATGCCCTGCTGCATACCCCGTAATCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACATAAATTCCTGTCGGGTg < 1:2970419/100‑1 (MQ=37) cAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACATAAATTCCTGTCGGGTg < 2:2150737/100‑1 (MQ=39) cAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACATAAATTCCTGTCGGGTg < 2:661691/100‑1 (MQ=38) cAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCggg > 1:2756659/1‑98 (MQ=255) cAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTg < 1:2053851/100‑1 (MQ=255) cAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTg < 1:3974866/100‑1 (MQ=255) cAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATAACACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGt < 1:4046534/99‑1 (MQ=255) aaGGATATTTCTAATGCCGTGGTGCATACCACGTAAGCCAGGATTTGCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACATAAATTCCTGTCGGGTg < 1:1125375/99‑1 (MQ=37) aaGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGTTTTTCGCAAGGGAAGATGCTGCTGGCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGc < 1:3262206/100‑1 (MQ=255) atatTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACATAAATTCCTGTCGGGTgtttcg < 1:3134287/100‑6 (MQ=37) atatTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTg < 1:3634592/100‑1 (MQ=255) tatTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGt < 1:1652658/100‑1 (MQ=255) ttGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTa < 1:962576/100‑1 (MQ=255) ttGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTa > 2:2548146/1‑100 (MQ=255) gCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACCCCCGACAGGAATTTATGTCGGGTACCTTGTTCAg > 2:1465794/1‑100 (MQ=255) gCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAg < 2:2834837/100‑1 (MQ=255) cTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAgg < 2:4038217/100‑1 (MQ=255) cTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAgg < 1:776860/100‑1 (MQ=255) cTAATGCCATGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAgg < 1:1230412/100‑1 (MQ=255) aaTGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTc > 2:4102686/1‑100 (MQ=255) aTGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCa < 1:196061/100‑1 (MQ=255) cccTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATaa < 2:85822/100‑1 (MQ=255) cccTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATaa > 1:691808/1‑100 (MQ=255) cTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGGTGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATaaga > 1:2370703/1‑100 (MQ=255) tGATGCATACCTCGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGCATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATaagaa > 1:2318914/1‑100 (MQ=255) gATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATaagaag < 1:3977834/100‑1 (MQ=255) aTACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGc > 2:3054431/1‑100 (MQ=255) tACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCt > 2:2529227/1‑100 (MQ=255) aCCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTa > 2:3379926/1‑100 (MQ=255) aCCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTa < 1:666028/100‑1 (MQ=255) ccACGTAAGCCAGGATATTCGCAGGGTGAGATGATGATGACGACACACCCGACAGGAAATTATGTCGGATGCCTTATTAAGGTCATAAGAAGGTGGCTa > 1:150408/1‑99 (MQ=255) cACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAg < 2:2369655/100‑1 (MQ=255) cACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAg < 1:3684189/100‑1 (MQ=255) cACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAg < 2:691809/100‑1 (MQ=255) cGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGTCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGaa > 2:3491501/1‑100 (MQ=255) cGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGaa > 2:2887654/1‑100 (MQ=255) tAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATg < 2:837420/100‑1 (MQ=255) aGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTACGAATGGa < 2:2318924/100‑1 (MQ=255) gCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAg < 2:281032/100‑1 (MQ=255) gCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAg < 2:2410836/100‑1 (MQ=255) gCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAg > 2:3851948/1‑100 (MQ=255) ccAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGt > 1:1627243/1‑100 (MQ=255) aGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTa < 1:2529214/100‑1 (MQ=255) aTTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTAAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTaaaa < 2:3113079/100‑1 (MQ=255) ttCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAagag < 2:3427146/100‑1 (MQ=255) gCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGc < 2:1434344/100‑1 (MQ=255) gCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGc > 1:1752299/1‑100 (MQ=255) gCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGc > 2:1342366/1‑100 (MQ=255) cAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCg > 2:531022/1‑100 (MQ=255) gAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGttatt < 1:1469408/100‑1 (MQ=255) aGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGttatta < 1:3859912/99‑1 (MQ=255) gatgatgatGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTattaat > 2:3665859/1‑100 (MQ=255) gatgatgatGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTattaat < 1:3665834/100‑1 (MQ=255) tgatgatgaCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGTAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTattaatta > 2:1186679/1‑100 (MQ=255) tgatgatgaCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTattaatta < 2:4063266/100‑1 (MQ=255) tgatgatgaCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTattaatt > 1:1818551/1‑99 (MQ=255) gatgatgaCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAattat < 2:4234679/100‑1 (MQ=255) gatgaCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATtct < 2:269160/100‑1 (MQ=255) gatgaCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATtct > 2:315431/1‑100 (MQ=255) gatgaCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATtct < 1:2803928/100‑1 (MQ=255) atgaCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATtctc > 2:2149378/1‑100 (MQ=255) tgaCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTTGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAAGAGGCTCAGATTGTCCTTAAAAGAGAGCGTTATTAattat > 1:3724439/1‑95 (MQ=255) tgaCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGTGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGCATGGAGTTAAAAGAGCGCGGTATTAATTATGCTcc > 1:1198868/1‑100 (MQ=255) tgaCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTcc > 2:747548/1‑100 (MQ=255) aCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCAt < 2:719540/100‑1 (MQ=255) aaaCACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTg < 2:2060481/100‑1 (MQ=255) ggcacCCGACATAAATTCCTGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGt > 2:1789875/3‑100 (MQ=38) gcacCCGACATAAATTCCTGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGtt > 2:2755134/2‑100 (MQ=38) cacCCGACATAAATTCCTGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGttt > 1:4282195/1‑100 (MQ=38) cacCCGACATAAATTCCTGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGttt > 1:337706/1‑100 (MQ=38) cccGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTg < 1:2329301/100‑1 (MQ=255) ccGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGttttn < 1:891519/99‑2 (MQ=255) ccGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGc > 2:949836/1‑100 (MQ=255) cGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCa < 2:2281580/100‑1 (MQ=255) cGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCa > 1:3384795/1‑100 (MQ=255) gACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAATGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCaa < 2:4054195/100‑1 (MQ=255) cAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACa > 2:359034/1‑100 (MQ=255) ggAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGATTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATc > 2:516111/1‑100 (MQ=255) gAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATcc > 2:2551530/1‑100 (MQ=255) aaTTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGTAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCa < 1:2140636/100‑1 (MQ=255) aaTTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCa > 2:190727/1‑100 (MQ=255) aaTTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCa > 1:992244/1‑100 (MQ=255) aaTTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCa > 1:3570399/1‑100 (MQ=255) aTTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCAt > 2:4217575/1‑100 (MQ=255) aTTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCAt > 2:3360875/1‑100 (MQ=255) tttATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCATa > 2:4209474/1‑100 (MQ=255) tATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTCAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCATAAt > 1:1050294/1‑100 (MQ=255) tATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCATAAt < 2:2257743/100‑1 (MQ=255) | ATTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCATAATG > NC_000913/1579471‑1579669 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |