| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,594,256 | (C)8→7 | pseudogene (3732/3861 nt) | yneO ← | pseudogene, AidA homolog |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,594,249 | 0 | C | . | 96.1% | 577.9 / 14.4 | 129 | pseudogene (3739/3861 nt) | yneO | pseudogene, AidA homolog |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/4); new base . (70/54); total (71/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.73e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
CACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTCCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGC > NC_000913/1594150‑1594344 | aCCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTcc > 2:2885114/1‑100 (MQ=255) aCCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTcc < 2:2611207/100‑1 (MQ=255) tGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTccccc < 2:3334902/100‑1 (MQ=255) gCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTcccccc > 2:2901501/1‑100 (MQ=255) cAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTccccccc > 1:95856/1‑100 (MQ=255) gtggtgACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTcccccccac < 1:3032969/100‑3 (MQ=255) gtggtgACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTcccccccac < 2:1322812/100‑3 (MQ=255) tggtgACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTcccccccacg > 2:2726549/1‑97 (MQ=255) gtgACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGat < 1:977137/100‑1 (MQ=255) aCATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATc > 1:816338/1‑100 (MQ=255) cATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATcc > 2:2709839/1‑100 (MQ=255) cATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATcc > 2:1639056/1‑100 (MQ=255) aTTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCcg > 2:2514654/1‑100 (MQ=255) aTTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCcg < 1:3103237/100‑1 (MQ=255) aTTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCcg < 1:2761678/100‑1 (MQ=255) aTTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCcg < 1:2056800/100‑1 (MQ=255) tCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCcgtcg < 2:170003/100‑1 (MQ=255) tCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCcgtcg < 1:10036/100‑1 (MQ=255) tCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCcgtcg > 1:1955889/1‑100 (MQ=255) cccGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCcgtcgt > 2:866202/1‑100 (MQ=255) cccGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCcgtcgt > 1:680717/1‑100 (MQ=255) cccGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCcgtcgt < 1:3291426/100‑1 (MQ=255) ccGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTCCCCCCCCACGATATCcgtcgt > 2:798114/1‑100 (MQ=255) cGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTAc > 1:979591/1‑100 (MQ=255) cGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTAc < 1:1034315/100‑1 (MQ=255) gACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTAcc < 2:95273/100‑1 (MQ=255) aCATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTAcc < 2:1286782/99‑1 (MQ=255) aTCACACCGCTGTTATGGCTATTAATGTGTTGAATTCCCATATTAATCGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATAT‑CCCCCCCACGATATCCCTCGTACCCTg < 2:1143583/100‑1 (MQ=255) aTCACACCGCTGTTATGGATGTTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTg < 2:1745712/100‑1 (MQ=255) aTCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTATCCTg > 2:491239/1‑100 (MQ=255) cacaCCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGAt > 2:2939565/1‑100 (MQ=255) cacaCCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGAt < 1:3159836/100‑1 (MQ=255) cacaCCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGAt > 2:882129/1‑100 (MQ=255) cacaCCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGAt > 2:614960/1‑100 (MQ=255) acacCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTCCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGAt < 1:798114/100‑1 (MQ=255) cacCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATAc > 1:1589005/1‑100 (MQ=255) acCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTCCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATAc < 1:29549/100‑1 (MQ=255) acCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATAcg < 2:816338/100‑1 (MQ=255) ccGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATAcgc > 1:2156285/1‑100 (MQ=255) cGCTGTTATGGATATTGGTGTGTTGACGTGCCTTATTTATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCTATTT‑CCCCCCCTCGATATCCGTCGTACCCt < 2:144963/92‑1 (MQ=255) cTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGTCCCGAAAGCAATTTCCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATAcgccg < 2:1349126/100‑1 (MQ=255) cTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATAcgccgc < 1:241544/100‑1 (MQ=255) tGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCcgcg < 1:2509366/100‑1 (MQ=255) tGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCcgcg < 1:2885125/100‑1 (MQ=255) tATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGaa > 2:353741/1‑100 (MQ=255) tATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGaa > 2:2219509/1‑100 (MQ=255) tGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATc > 1:3150586/1‑100 (MQ=255) ggATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCg > 1:3292529/1‑100 (MQ=255) gATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCgt > 1:1921257/1‑100 (MQ=255) tatTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCgttg > 2:1592990/1‑100 (MQ=255) tatTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCgttg > 1:3096660/1‑100 (MQ=255) tatTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCgttg < 1:614961/100‑1 (MQ=255) gatctaTGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCgttg < 1:2561748/95‑1 (MQ=255) ttAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCgttgtt < 1:1639058/100‑1 (MQ=255) ttAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCgttgtt > 1:350109/1‑100 (MQ=255) tAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTa > 1:2477370/1‑100 (MQ=255) tgtgTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAaga > 2:2019483/1‑100 (MQ=255) gtgtTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAagag < 2:2669165/100‑1 (MQ=255) tgtTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGt > 1:412070/1‑100 (MQ=255) gtTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTc > 1:3403241/1‑100 (MQ=255) tGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAg < 2:2571393/100‑1 (MQ=255) gACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAgg > 2:1946866/1‑100 (MQ=255) ttGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAgg > 2:478037/1‑97 (MQ=255) ttGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATc > 1:1361928/1‑100 (MQ=255) tGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATcc > 2:1419215/1‑100 (MQ=255) gCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATccc < 2:95857/100‑1 (MQ=255) gCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATACGTCGTACTCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATcc > 2:1617255/1‑99 (MQ=255) cATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCgg < 1:620111/100‑1 (MQ=255) cATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCgg > 2:3252206/1‑100 (MQ=255) cATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCgg > 2:1555968/1‑100 (MQ=255) atatTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGt > 2:3044243/1‑100 (MQ=255) atTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTAc < 2:67132/100‑1 (MQ=255) tAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTAccc < 2:1497959/100‑1 (MQ=255) aaTGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTAccc > 2:482898/1‑99 (MQ=255) aaTGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCa > 1:1864776/1‑100 (MQ=255) ggCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGtt > 2:312751/1‑100 (MQ=255) ggCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGtt < 2:2477362/100‑1 (MQ=255) ggCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGtt > 2:769134/1‑100 (MQ=255) gCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGttt < 2:1589002/100‑1 (MQ=255) cAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGtttt > 1:257555/1‑100 (MQ=255) cAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGtttt < 1:2939576/100‑1 (MQ=255) agagTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTg < 2:372103/100‑1 (MQ=255) agTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTc < 1:2549626/100‑1 (MQ=255) agTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTc < 1:1946870/100‑1 (MQ=255) gTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTca < 2:2590337/100‑1 (MQ=255) tCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTcac < 1:3048551/100‑1 (MQ=255) tCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTcac < 1:3048542/100‑1 (MQ=255) tCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCCTACCCTGATACGCCGCGGATTCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTcac < 2:1864772/100‑1 (MQ=255) ggAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACAt > 2:678140/1‑100 (MQ=255) aaCCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCa > 2:2736261/1‑100 (MQ=255) aCCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCac > 1:3010193/1‑100 (MQ=255) ccGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCacc < 2:350108/100‑1 (MQ=255) gAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgc > 1:2676462/1‑100 (MQ=255) gAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgc > 1:1915355/1‑100 (MQ=255) aGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgctac > 2:483130/1‑100 (MQ=255) aGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgctac < 1:838549/100‑1 (MQ=255) aGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgctac < 1:3252219/100‑1 (MQ=255) gCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgctacc < 1:483131/100‑1 (MQ=255) gCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgctacc < 1:482948/100‑1 (MQ=255) cAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgctaccg > 1:3094675/1‑100 (MQ=255) | CACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTCCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGC > NC_000913/1594150‑1594344 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |