| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,903,571 | A→G | T164A (ACC→GCC) | manY → | mannose‑specific enzyme IIC component of PTS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,903,571 | 0 | A | G | 99.3% | 512.0 / NA | 137 | T164A (ACC→GCC) | manY | mannose‑specific enzyme IIC component of PTS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (61/75); minor base T (1/0); total (62/75) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.53e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
CAACCTGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGA > NC_000913/1903474‑1903667 | cAACCTGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGcc < 2:3106911/100‑1 (MQ=255)cAACCTGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGcc < 1:688370/100‑1 (MQ=255) aCCTGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAg > 1:2884589/1‑100 (MQ=255) ccTGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGc < 1:712749/100‑1 (MQ=255) cTGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCg > 2:2597007/1‑100 (MQ=255) cTGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGGTGCGCGGGCTGTTGGTTCCAGc > 2:2839605/1‑99 (MQ=255) cAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTagatcggaaga > 2:319442/1‑90 (MQ=255) gCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTAc > 2:2249866/1‑100 (MQ=255) gCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTAc < 1:201425/100‑1 (MQ=255) gATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAg < 2:1947565/100‑1 (MQ=255) gATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAg > 2:2924164/1‑100 (MQ=255) ttCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTCTTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAAc < 1:3186683/100‑1 (MQ=255) ttCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAAc < 1:2477219/100‑1 (MQ=255) ttCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAAc < 1:2467804/100‑1 (MQ=255) ccTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACAt < 1:973723/100‑1 (MQ=255) cTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATg > 2:924943/1‑100 (MQ=255) cTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATg > 2:2270418/1‑100 (MQ=255) cTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATg > 1:1813875/1‑100 (MQ=255) ggATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCt > 2:2558600/1‑100 (MQ=255) ggATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCt > 1:17415/1‑100 (MQ=255) gATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTg < 2:2440625/100‑1 (MQ=255) tCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGaa < 1:2627796/100‑1 (MQ=255) tCCACGTTTCTTCTCTGTCCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGaa < 2:2120933/100‑1 (MQ=255) ccACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAAt > 2:417514/1‑100 (MQ=255) ccACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAAt > 1:397336/1‑100 (MQ=255) ccACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGCTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAAt > 2:2170509/1‑100 (MQ=255) cACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATg > 2:2537762/1‑100 (MQ=255) cACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATg > 2:251051/1‑100 (MQ=255) aCGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGc < 2:17415/100‑1 (MQ=255) cGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCg > 2:2071844/1‑100 (MQ=255) gTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGa > 2:1591833/1‑100 (MQ=255) tttCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGAt < 1:3383110/100‑1 (MQ=255) cttctCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTCTTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCGGCGAAGTACCGAACATGCTGAATGCGATTcc > 2:2427961/1‑100 (MQ=255) cttctCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGCATGCGATTc > 2:1492099/1‑99 (MQ=255) ctctGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGa < 1:1480797/100‑1 (MQ=255) ctGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAg < 1:1868441/100‑1 (MQ=255) ctGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAg < 1:1604301/100‑1 (MQ=255) ctGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAg < 1:924944/100‑1 (MQ=255) ttCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAgtgg < 1:1740529/100‑1 (MQ=255) tCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAgtggt > 2:1800726/1‑100 (MQ=255) ccTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAgtggtg < 1:700999/100‑1 (MQ=255) ccTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAgtggtc < 2:1202426/100‑2 (MQ=255) cTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGa > 2:114003/1‑100 (MQ=255) cTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGa < 1:2420444/100‑1 (MQ=255) tGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGAc < 1:2883727/100‑1 (MQ=255) tGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGAc < 2:1812613/100‑1 (MQ=255) gcaagcaaTGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGa > 2:1454190/1‑98 (MQ=255) gcaagcaaTGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGAcc > 1:232748/1‑100 (MQ=255) gcaagcaaTGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGAcc < 2:2884578/100‑1 (MQ=255) caagcaaTGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCa > 2:1850612/1‑100 (MQ=255) agcaaTGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAAt > 1:1218207/1‑100 (MQ=255) caaTGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATgg < 1:286071/100‑1 (MQ=255) caaTGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATgg > 2:29422/1‑100 (MQ=255) caaTGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATg < 2:1218204/99‑1 (MQ=255) aaTGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGt > 1:904073/1‑100 (MQ=255) aTGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTc > 2:1399261/1‑100 (MQ=255) gCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTg < 1:29422/100‑1 (MQ=255) gtgtGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGaa < 1:303111/100‑1 (MQ=255) gtgGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAata < 2:3094531/100‑1 (MQ=255) tgGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAatat > 2:1619513/1‑100 (MQ=255) ggCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATc < 1:1800730/100‑1 (MQ=255) ggCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATc > 2:764820/1‑100 (MQ=255) gCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCg > 1:507508/1‑100 (MQ=255) gCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCg < 2:234425/100‑1 (MQ=255) gCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCg < 2:922277/100‑1 (MQ=255) gCTATCCCGGCCGGCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATc < 1:2839615/99‑1 (MQ=255) cTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGc > 2:3207747/1‑100 (MQ=255) tATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGcc < 1:2547688/100‑1 (MQ=255) ccGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTg > 1:3158329/1‑100 (MQ=255) ccGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTg > 2:1107862/1‑100 (MQ=255) cGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTgg < 1:1591836/100‑1 (MQ=255) cGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTgg > 2:1757933/1‑100 (MQ=255) cGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTgg < 1:1139977/100‑1 (MQ=255) cGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTgg < 2:109835/100‑1 (MQ=255) ggCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGGGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGc > 2:2300313/1‑100 (MQ=255) gTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGa < 1:79927/100‑1 (MQ=255) cATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATc < 2:3158317/100‑1 (MQ=255) aTCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCg < 1:2597015/100‑1 (MQ=255) aTCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCg < 1:3207760/100‑1 (MQ=255) gTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGCACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCgtgg > 2:2984901/1‑100 (MQ=255) tGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCgtggtg < 1:114002/100‑1 (MQ=255) gcgcTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGCCTGCGATTCCGGAAGTGGTGACAAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGtggtgg < 1:774209/100‑1 (MQ=255) gcgcTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGtggtgg < 2:228500/100‑1 (MQ=255) gcgcTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGtggtgg < 1:299589/100‑1 (MQ=255) cgcTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTggtggt < 1:1789555/100‑1 (MQ=255) ctgtctgtTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGtggttg < 1:2170514/100‑1 (MQ=255) ctgtctgtTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGtggttg < 1:527912/100‑1 (MQ=255) tgtctgtTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGtggttgg < 2:772424/100‑1 (MQ=255) gtctgtTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGtggttggt < 1:2270424/100‑1 (MQ=255) gtctgtTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGtggttggt < 1:451465/100‑1 (MQ=255) gtctgtTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGtggttggt > 2:2618952/1‑100 (MQ=255) tctgtTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTggttggtt < 2:507507/100‑1 (MQ=255) ctgtTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTa > 2:2258267/1‑100 (MQ=255) ctgtTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTa < 1:2537770/100‑1 (MQ=255) ctgtTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCCTGGTGGTTGGTTa > 2:1940411/1‑100 (MQ=255) ctgtTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACACGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTa > 2:73710/1‑100 (MQ=255) gtTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGtggtggagatcggaa > 1:1970205/1‑91 (MQ=255) gtTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATg > 2:1764986/1‑100 (MQ=255) gtTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATg < 1:2598656/100‑1 (MQ=255) ggTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGa > 2:3320589/1‑100 (MQ=255) | CAACCTGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGA > NC_000913/1903474‑1903667 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |