| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,469,733 | (T)8→7 | 100% | coding (603/1332 nt) | gtrS → | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,469,726 | 0 | T | . | 92.5% | 300.2 / 18.4 | 80 | coding (596/1332 nt) | gtrS | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (6/0); new base . (34/40); total (40/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.55e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.10e-01 | |||||||||||
AATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTG > NC_000913/2469633‑2469821 | aaTCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTTCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAttttttt < 1:2240873/100‑1 (MQ=255)aaTCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAttttttt > 1:806074/1‑100 (MQ=255)aaTCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAttttttt < 1:780883/100‑1 (MQ=255)aaTCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAttttttt < 1:339950/100‑1 (MQ=255) aTCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAttttttt < 1:634603/99‑1 (MQ=255) tCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAtttttttga < 2:2432416/100‑3 (MQ=255) cTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAtttttttgat > 2:2519546/1‑97 (MQ=255) cTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAtttttttgat > 2:1420300/1‑97 (MQ=255) cTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAtttttttgat < 1:1913700/100‑4 (MQ=255) tATGCTTTTGCTATTTTTTTTGTTGCTAATAATATCTACTGCTTAAAATCAATTTATATTAACTCCACTAATAGTGTATTCATATTATAtttttttgata > 1:1305879/1‑96 (MQ=255) tATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAtttttttgata < 1:638852/100‑5 (MQ=255) tATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAtttttttgata < 1:254615/100‑5 (MQ=255) tGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGa < 2:968635/100‑1 (MQ=255) gCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAttttttttata > 1:2038358/1‑94 (MQ=255) cTTTTGCTACTTTTTTCTTTTCTAATAACTGCTATTGCTAAAAATCAATTTATTTTATTCCCACTAATGTTGTATTTATATTATAtttttttt < 1:1631536/93‑1 (MQ=255) gCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAAc < 1:613921/100‑1 (MQ=255) gCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAAc < 2:1326427/100‑1 (MQ=255) gCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAAc < 2:525352/100‑1 (MQ=255) cTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACt < 1:2185053/100‑1 (MQ=255) tATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTa < 2:119002/100‑1 (MQ=255) aTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTaa > 1:188980/1‑100 (MQ=255) aTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTaa > 1:1921596/1‑100 (MQ=255) ttttttCGTTGCTAATAATATCTATTGGTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTATATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAatt < 1:2234913/100‑1 (MQ=255) tttttCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAatta < 2:2108456/100‑1 (MQ=255) ttttCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTT‑ATAGACACAAACTAattat > 1:980918/1‑100 (MQ=255) ttttCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATCTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAattat < 1:1746893/100‑1 (MQ=255) ttttgTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAattatt < 2:914462/96‑1 (MQ=255) tttCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAattatt < 1:499844/100‑1 (MQ=255) cGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTaaa < 2:1304517/100‑1 (MQ=255) agTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGGGTAGTCATATTATA‑TGATTTTGATAGACACAAATTAatgatt > 1:213693/2‑97 (MQ=255) gCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAGCCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCt > 1:1389125/1‑99 (MQ=255) taataaTATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTTTTA‑AAACTAACTAATTATTAAATCTGt > 1:819404/1‑99 (MQ=255) aataatATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTaa > 1:1214878/1‑100 (MQ=255) aataatATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTaa > 2:1521236/1‑100 (MQ=255) aataatATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACGAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTaa < 1:2314776/100‑1 (MQ=255) ataataTCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACATAAACTAATTATTAAATCTGTaa < 1:1500671/99‑1 (MQ=255) taataTCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAata < 2:450055/100‑1 (MQ=255) cTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCgtg < 2:1583667/100‑1 (MQ=255) tACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCgtg > 1:258823/1‑100 (MQ=255) tACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTT‑ATATATACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCgtg > 1:1892257/1‑99 (MQ=255) tACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCgtgg < 2:2015273/100‑1 (MQ=255) cTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCgtggtg < 1:1088714/100‑1 (MQ=255) tGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGgtgt > 2:2219125/1‑100 (MQ=255) tGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGgtgt < 1:2219110/100‑1 (MQ=255) gCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGtgtg > 1:373346/1‑100 (MQ=255) gCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGtgtg > 2:827842/1‑100 (MQ=255) cTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGtgc < 2:694104/100‑1 (MQ=255) tAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGtgct > 2:2493837/1‑100 (MQ=255) aaaaaTCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGtgctt < 1:2542554/100‑1 (MQ=255) aaTCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGtgcttgct < 2:1521422/100‑1 (MQ=255) tCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGcttgcttg < 1:2364225/100‑1 (MQ=255) aaTTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTT‑TTTTTTTCAAACTAATTATTAAATTTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCg > 1:633712/1‑100 (MQ=255) aaTTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATATACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTgcttgctt > 1:1316279/1‑97 (MQ=255) aaTTTATATTAACCCCACTAATAGAGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATATACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGtactttct > 1:2312138/1‑96 (MQ=255) aTTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGt < 1:975423/100‑1 (MQ=255) tttATATTAACTCTACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTAGTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTc < 1:643568/100‑1 (MQ=255) tttATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGTTTGCGTc > 2:1549731/1‑100 (MQ=255) tttATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTc < 2:272889/100‑1 (MQ=255) tttATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTc < 2:1208421/100‑1 (MQ=255) ttATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTc < 1:602219/99‑1 (MQ=255) tataTTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCaa > 2:2212498/1‑100 (MQ=255) atatTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAat > 2:1395098/1‑100 (MQ=255) tatTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAACCTAATTCTTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAtta > 2:40563/1‑100 (MQ=255) tatTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTGTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAata > 2:1822405/1‑100 (MQ=255) atTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTT‑TTTTTTTTAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTAAatat > 1:2074518/1‑100 (MQ=255) atTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAatat > 2:381792/1‑100 (MQ=255) atTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAatat > 1:909680/1‑100 (MQ=255) ttAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATAtt > 1:1046105/1‑100 (MQ=255) tAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTTCTTGCGTCAATAttt > 1:1667346/1‑100 (MQ=255) aaCCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTg < 2:2413012/100‑1 (MQ=255) aaCCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTg > 2:1088196/1‑100 (MQ=255) aCCCCACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGc > 1:984790/1‑100 (MQ=255) ccccACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGc < 1:110046/99‑1 (MQ=255) ccccACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCa > 2:682246/1‑100 (MQ=255) cccACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCaa > 2:1715094/1‑100 (MQ=255) ccACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGATGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAat > 1:649930/1‑100 (MQ=255) ccACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTCGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTg > 1:2331301/1‑96 (MQ=255) cACTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAata > 2:1635652/1‑100 (MQ=255) cTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATc > 1:1535185/1‑100 (MQ=255) cTAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATc < 1:20768/100‑1 (MQ=255) tAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCt < 2:622894/100‑1 (MQ=255) tAATAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCt < 1:1519559/100‑1 (MQ=255) aaTAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTg < 1:2050717/91‑1 (MQ=255) aTAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTa > 2:1469690/1‑100 (MQ=255) aTAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTa < 1:1040983/100‑1 (MQ=255) aTAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTa > 1:1323442/1‑100 (MQ=255) tAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTAt < 2:188981/100‑1 (MQ=255) tAGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTAt < 2:2438807/100‑1 (MQ=255) aGTGTATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTAtt > 2:1556644/1‑100 (MQ=255) tgtATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCa < 2:633715/100‑1 (MQ=255) tgtATTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCa < 2:1892267/100‑1 (MQ=255) aTTCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTGTTAAATTTGTAATATTCGTGGTGTGCTTGCTTGAGACAATATTTGCAATATTTTTTTaaaa > 1:1770162/1‑99 (MQ=255) tCATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAgg < 2:2141707/100‑1 (MQ=255) cATATTATA‑TTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGgt > 1:908516/1‑100 (MQ=255) ttata‑ttTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGtgttg > 1:1015228/1‑100 (MQ=255) | AATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTG > NC_000913/2469633‑2469821 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |