Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,533,408 | (A)6→5 | 100% | intergenic (+28/‑356) | cysK → / → ptsH | cysteine synthase A, O‑acetylserine sulfhydrolase A subunit/phosphohistidinoprotein‑hexose phosphotransferase component of PTS system (Hpr) |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,533,403 | 0 | A | . | 83.3% | 220.3 / 49.1 | 78 | intergenic (+23/‑361) | cysK/ptsH | cysteine synthase A, O‑acetylserine sulfhydrolase A subunit/phosphohistidinoprotein‑hexose phosphotransferase component of PTS system (Hpr) |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (5/7); new base . (36/29); total (41/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.31e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.77e-01 |
ACCATCATCGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGTAAAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTA > NC_000913/2533305‑2533501 | aCCATCATCGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGTaa > 2:1146615/1‑100 (MQ=255) catcGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGTaaaaagc < 1:504746/100‑3 (MQ=255) atcGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGTaaaaagca > 2:1499249/1‑97 (MQ=255) atcGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGTAAAAAAGc > 1:2498912/1‑100 (MQ=255) cGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGTAAAAAAGCAc < 2:2437241/100‑1 (MQ=255) gTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCttt > 2:2551951/1‑100 (MQ=255) gAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTCATACCCGCTTGTTAAAAATGAGT‑AAAAACCACCttttt > 1:2194886/1‑100 (MQ=255) aGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTa > 2:1735149/1‑100 (MQ=255) gCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAg > 2:2274763/1‑100 (MQ=255) gCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATACGT‑AAAAAGCACCTTTTTAg < 1:618589/100‑1 (MQ=255) cGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCGCCTTTTTAgg < 1:2122694/100‑1 (MQ=255) cGTGATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTCCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAgg < 1:994628/100‑1 (MQ=255) gTTATTTAAGCACCGCATGGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAgg < 1:2450754/99‑1 (MQ=255) tttAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCtt < 1:2421975/100‑1 (MQ=255) tAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCtttt > 1:1783783/1‑100 (MQ=255) tAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCttt > 1:1786438/1‑99 (MQ=255) tAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTATTAGGTGCtttt > 1:867541/1‑100 (MQ=255) aaGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCttttt < 1:2374713/100‑1 (MQ=255) gCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTtg > 1:1896779/1‑100 (MQ=255) cACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGTAAAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTtg < 1:2046714/100‑1 (MQ=255) cACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTAAAAAGGTGCtttttacg < 1:2098815/100‑4 (MQ=38) aCCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTtgtg > 1:1275561/1‑100 (MQ=255) aCCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTAAAAAGGTGCtttttacgc < 2:1189459/100‑5 (MQ=37) ccGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGTAAAAAA‑CACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTgg > 1:1043205/1‑100 (MQ=255) cGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGc < 2:2438027/100‑1 (MQ=255) cGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTAAAAAGGTGCtttttacgcat < 2:1104465/100‑7 (MQ=37) cGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAAGTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGTAAAAAAGCACCTAAAAAGGTGCttttttacg < 2:79581/99‑4 (MQ=37) ttagttGCCTAGCTCTACACTTAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTAAAAAGGTGCtttttac < 1:2386383/88‑3 (MQ=19) tttGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTc > 2:85441/1‑100 (MQ=255) ttGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCGAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTGAAGGTTCGTTTTTGTTGCCGGCTTCa > 1:2585381/1‑100 (MQ=255) gCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCaaa < 1:1923495/100‑1 (MQ=255) gCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCaaa > 2:816885/1‑100 (MQ=255) ccGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAAc > 2:1722559/1‑100 (MQ=255) ccGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAAc < 2:1034813/100‑1 (MQ=255) cGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACt < 2:1932498/100‑1 (MQ=255) gATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGTAAAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACt < 2:998425/100‑1 (MQ=255) tctcTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTc < 2:1208512/100‑1 (MQ=255) ctctTCACTGAGAAAGAATTTCAACAGTAATGCTAGCTAGTTTAAATTGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCg < 1:481647/100‑1 (MQ=255) ctctTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCg < 1:726469/100‑1 (MQ=255) tctTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCg > 2:563779/1‑99 (MQ=255) tctTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGc > 1:395941/1‑100 (MQ=255) tctTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGc > 2:1251834/1‑100 (MQ=255) ctTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGcc > 2:691053/1‑100 (MQ=255) ctTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGcc < 1:1257103/100‑1 (MQ=255) cACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGTAAAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGcccc > 2:2109369/1‑100 (MQ=255) cACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCcct > 2:1248179/1‑100 (MQ=255) cACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCcct > 1:1856727/1‑100 (MQ=255) cTGTGAAAGAATTGCAACAGTAATCCCAGCTTATTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTCTTAGGTGCTTGTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCcctc > 1:16197/1‑99 (MQ=255) cTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCcctcc > 2:13369/1‑100 (MQ=255) cTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCcctcc > 2:1524168/1‑100 (MQ=255) gagaAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTg > 2:14728/1‑100 (MQ=255) gagaAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTg < 1:1825564/100‑1 (MQ=255) aagaaTTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑ACAAAGCACCTTATTAGGTGCTCTTGTGTGGCCTGCTTCGAACTTTCGCCCCTCCTTGCAt > 1:1941354/1‑100 (MQ=255) aagaaTTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAACGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCAt > 1:801338/1‑100 (MQ=255) aagaaTTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCAt > 1:915708/1‑100 (MQ=255) tgaaaCAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTGTTGTGGTCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTc < 1:237805/97‑1 (MQ=255) gCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCAttactgtt > 2:137429/1‑94 (MQ=255) cAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCCCCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAg < 2:2321883/100‑1 (MQ=255) cAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGTTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAg > 1:1789374/1‑100 (MQ=255) aCAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGcc < 2:264870/100‑1 (MQ=255) cAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCt > 2:1350241/1‑100 (MQ=255) gTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGTAAAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTg < 1:131533/100‑1 (MQ=255) gTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGt > 2:2121847/1‑100 (MQ=255) tAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTc < 2:1837047/100‑1 (MQ=255) aaTGCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCg > 2:563228/1‑100 (MQ=255) aaTGCCAGCTTGTTAAAAATGCG‑GAAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGcc < 1:2057248/95‑1 (MQ=255) aTGCCAGCTTGTTAAAAATGCGTAAAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTACTGGCATTGATTCAGCCTGTCg > 2:2356214/1‑100 (MQ=255) gCCAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGaa > 2:699582/1‑100 (MQ=255) cAGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAACGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACt < 2:2383557/100‑1 (MQ=255) atcTTGTTAAAAATGCGTAAAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACt < 2:1554303/98‑1 (MQ=255) aGCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTg > 2:690668/1‑100 (MQ=255) gCTTGTTAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACt > 1:2412917/1‑98 (MQ=255) tGTTAAAAATGCGTAAAAAAGCACCTTTTTAGGAGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCAGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACtagat > 1:1554294/1‑96 (MQ=255) ttAAAAATGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTAttt < 2:348944/100‑1 (MQ=255) aaaaTGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCTTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTCTTTAAc > 1:2201034/1‑100 (MQ=255) aaaaTGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAAc < 2:306703/100‑1 (MQ=255) aaaTGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAAcc < 1:2551932/100‑1 (MQ=255) aaTGCGTAAAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAAcc < 1:1116975/100‑1 (MQ=255) aaTGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCa < 1:1532181/100‑1 (MQ=255) tGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGa > 2:1968972/1‑100 (MQ=255) tGCGT‑AAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGa < 2:521093/100‑1 (MQ=255) gccacaaaaaaGCACCTAAAAAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGGCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAg > 2:251413/6‑100 (MQ=37) acaaaaaaGCACCTAAAAAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACt > 1:762320/3‑100 (MQ=38) caaaaaaGCACCTAAAAAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTa > 1:225797/2‑100 (MQ=38) | ACCATCATCGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGTAAAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTA > NC_000913/2533305‑2533501 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |