| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,991,798 | Δ1 bp | 15.5% | intergenic (+39/‑296) | ygeG → / → ygeH | SycD‑like chaperone family TPR‑repeat‑containing protein/putative transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,991,798 | 0 | C | . | 15.5% | 316.9 / 56.8 | 110 | intergenic (+39/‑296) | ygeG/ygeH | SycD‑like chaperone family TPR‑repeat‑containing protein/putative transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (52/40); new base . (7/10); total (59/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.94e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.32e-01 | |||||||||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
TAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAG > NC_000913/2991699‑2991897 | tAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGc > 1:808820/1‑100 (MQ=255)tAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGc < 1:1832407/100‑1 (MQ=255)tAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTCAAATCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGc < 1:1274579/100‑1 (MQ=255) gagTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGt < 2:570056/100‑1 (MQ=255) gagTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGt > 2:2552786/1‑100 (MQ=255) agTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGtt > 1:1299006/1‑100 (MQ=255) gTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCAATTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGt > 1:2030077/1‑98 (MQ=255) aaGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAc‑‑c < 1:2202766/100‑1 (MQ=255) gtgcAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CAc < 1:1145178/98‑1 (MQ=255) gcgcAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CAc > 2:2500478/1‑100 (MQ=255) cATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAAcc > 1:1469528/1‑100 (MQ=255) cATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAAcc < 2:1146746/100‑1 (MQ=255) cATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAAcc > 2:286446/1‑100 (MQ=255) cATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAAcc < 1:2519484/100‑1 (MQ=37) cATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAAcc < 2:52021/100‑1 (MQ=37) cATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAAcc < 2:404285/100‑1 (MQ=37) atatatTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAAcc < 1:1647387/99‑1 (MQ=255) atatatTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAACCa < 2:741877/100‑1 (MQ=37) tatatTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAACCAg < 1:726195/100‑1 (MQ=37) tatatTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAACCAg < 1:1824424/100‑1 (MQ=37) tatatTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTG‑‑GTTAACCGCACTATAAccgg < 2:1745646/100‑3 (MQ=37) atatTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGc < 1:1462957/100‑1 (MQ=255) atatTGAACTCTTAAAAGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGc < 1:219533/100‑1 (MQ=255) tatTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAACCAGCa < 2:1126489/100‑1 (MQ=37) atctaCTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCAcc < 1:2526954/96‑1 (MQ=255) gAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACctc > 2:2490952/1‑100 (MQ=255) ctctTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACGATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTa > 2:1801470/1‑100 (MQ=255) ctctTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTa > 2:123705/1‑100 (MQ=255) ctTAAACGATAATTCAGAAGATAATTGCTAATCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATg < 1:457991/100‑1 (MQ=255) ctTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATg > 2:2478672/1‑100 (MQ=255) ctTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATg > 2:2029617/1‑100 (MQ=255) aaaCGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGttt > 2:2183587/1‑100 (MQ=255) ttccgatctagaagaTAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCt < 1:923358/91‑1 (MQ=255) cGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCt > 2:598883/1‑100 (MQ=255) cGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCt < 2:2520941/100‑1 (MQ=255) cGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCt > 1:841655/1‑100 (MQ=255) gATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCtt < 2:2290684/100‑1 (MQ=255) aTAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTa > 2:657738/1‑100 (MQ=255) aTAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTa > 2:1960043/1‑100 (MQ=255) tAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTaa < 1:2188105/100‑1 (MQ=255) aTTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAAt > 1:38781/1‑100 (MQ=255) ttCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAAtt < 2:2581312/100‑2 (MQ=255) tCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCa > 2:2194304/1‑100 (MQ=255) cAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAg > 2:1532278/1‑100 (MQ=255) agaagaTAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCtagatcggaa > 2:923361/1‑91 (MQ=255) agaagaTAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCa < 1:1295200/98‑1 (MQ=255) gaagaTAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCa < 2:1657611/100‑1 (MQ=255) aagaTAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCa < 1:446175/99‑1 (MQ=255) agaTAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATc > 2:1441795/1‑100 (MQ=255) tAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTa > 1:617380/1‑100 (MQ=255) aTGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTaaa > 2:1096055/1‑100 (MQ=255) aTGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTaaa < 2:830235/100‑1 (MQ=255) tGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTaaaa > 1:2426404/1‑100 (MQ=255) ggCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAAc < 2:2535587/100‑1 (MQ=255) gCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACa > 1:1008799/1‑100 (MQ=255) cTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAg < 2:136655/100‑1 (MQ=255) tAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGt > 2:1015533/1‑100 (MQ=255) tAACCATTACAATCACTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CCCTCTAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGt < 1:1543223/100‑1 (MQ=255) aaGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGtt < 1:1960033/100‑1 (MQ=255) aaGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGtt < 1:657735/100‑1 (MQ=255) aaGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGtt < 1:1961063/100‑1 (MQ=255) ttACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAagag < 2:2057821/100‑1 (MQ=255) ttACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAagag > 2:864867/1‑100 (MQ=255) ttACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAagag < 1:2415426/100‑1 (MQ=255) tACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGc < 2:1282235/100‑1 (MQ=255) aCAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCa > 1:1579343/1‑100 (MQ=255) cAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCAt < 1:184607/100‑1 (MQ=255) aTCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATAc > 1:1094352/1‑100 (MQ=255) aTCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATAc < 2:2416558/100‑1 (MQ=255) tttGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACtata < 2:914923/100‑1 (MQ=255) gTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATc > 2:1321484/1‑100 (MQ=255) gTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATc > 2:489698/1‑100 (MQ=255) aTTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCattat < 1:966340/100‑1 (MQ=255) aTTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCattat < 1:761466/100‑1 (MQ=255) tttGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCattatt < 2:941151/100‑1 (MQ=255) gtGCTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTAttt > 1:1605623/2‑100 (MQ=25) gCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATACCCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGAATACTATAAATAATTAttttt > 2:201848/1‑100 (MQ=255) gCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTAttttt < 1:2561503/100‑1 (MQ=255) gCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTAttttt < 1:968888/100‑1 (MQ=255) gCTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTAttttt > 2:2079632/1‑100 (MQ=37) cTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTc < 1:598880/100‑1 (MQ=255) cTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTc < 1:764520/100‑1 (MQ=255) cTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTAttttt > 1:111488/1‑99 (MQ=37) cTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTc > 1:810244/1‑100 (MQ=37) cTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTc > 2:261913/1‑100 (MQ=37) tGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCa > 2:2330881/1‑100 (MQ=37) gTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAAt > 2:1280476/1‑100 (MQ=255) ttATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTACAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATg > 1:510740/1‑100 (MQ=255) ttATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAAt > 2:812744/1‑99 (MQ=255) ttATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATg > 2:607613/1‑100 (MQ=255) ataGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCTATGc > 1:928547/1‑99 (MQ=255) taGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGt > 2:1663417/1‑100 (MQ=255) aGTGTAGTTAAC‑‑CACTATAACCACCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGtt < 1:2372521/100‑1 (MQ=255) aGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATATTATAAATCATTATTTTTAAATGCGtt > 1:139367/1‑100 (MQ=255) aGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGtt < 1:2282726/100‑1 (MQ=255) gTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTa > 1:298828/1‑100 (MQ=255) gTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTa > 1:2570943/1‑100 (MQ=255) tGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTag > 1:50242/1‑100 (MQ=255) cAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTagag > 2:546601/1‑100 (MQ=255) cAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTagag < 1:364352/100‑1 (MQ=255) | TAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAG > NC_000913/2991699‑2991897 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |