| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 420,149 | Δ1 bp | 100% | coding (559/1320 nt) | brnQ → | branched‑chain amino acid transport system 2 carrier protein; LIV‑II transport system for Ile, Leu, and Val |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 420,146 | 0 | T | . | 79.4% | 252.1 / 86.0 | 102 | coding (556/1320 nt) | brnQ | branched‑chain amino acid transport system 2 carrier protein; LIV‑II transport system for Ile, Leu, and Val |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (8/12); new base . (42/39); total (51/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.55e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
GCTGAAAATTATCGCGCTGGTCATCCTGTCTGTTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCG > NC_000913/420049‑420242 | cTGAAAATTATCGCGCTGGTCATCCTGTCTGTTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCGtttc < 1:1892690/100‑2 (MQ=255) tGAAAATTATCGCGCTGGTCATCCTGTCTGTTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCGTTTTc < 2:16131/100‑1 (MQ=255) gAAAATTATCGCGCTGGTCATCCTGTCTGTTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCGtttcta > 2:293812/1‑97 (MQ=255) aaaTTATCGCGCTGGTCATCCTGTCTGTTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAAc > 2:2139599/1‑100 (MQ=255) aaaTTATCGCGCTAATCATCCTGTCTGTTGACGCTATTATCTAACTGGCGAGTTCTATTAGCACTGAGACTAAGGATTATCAAAACGCTGCAtttctaa > 1:466284/1‑95 (MQ=255) aaTTATCGCGCTGGTCATCCTGTCTGTTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACg < 2:465688/100‑1 (MQ=255) gcgcTGGTCATCCTGTCTGTTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCg < 1:602861/100‑1 (MQ=255) gcgcTGGTCATCCTGTCTGTTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGt > 2:622109/1‑100 (MQ=255) tGGTCATCCTGTCTGTTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTacc > 1:1565362/1‑98 (MQ=255) ggTCATCCTGTCTGTTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAAc > 2:396479/1‑100 (MQ=255) ggTCATCCTGTCTGTTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACg > 2:864968/1‑100 (MQ=255) ggTCATCCTGTCTGTTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACg < 1:129723/100‑1 (MQ=255) ggTCATCCTGTCTGTTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACg > 1:1320677/1‑100 (MQ=255) ggTCATCCTGTCTGTTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACg > 1:2224817/1‑100 (MQ=255) ggTAATCCTGTCTGTTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGAAAGAAAAAAAAAAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAAc < 1:1250048/99‑1 (MQ=255) tCATCCTGTCTGTTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGc > 2:175227/1‑100 (MQ=255) tCATCCTGTCTGTTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGc > 1:304147/1‑100 (MQ=255) tCATCCTGTCTGTTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGc < 1:724969/100‑1 (MQ=255) naTCCTGTCTGTTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTCACGGCt > 1:2042485/2‑100 (MQ=255) cATCCTGTCTGTTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGc < 1:35051/99‑1 (MQ=255) cATCCTGTCTGTTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCt > 1:914446/1‑100 (MQ=255) cATCCTGTCTGTTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCt > 2:1328823/1‑100 (MQ=255) cATCCTGTCTGTTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCt > 2:1873404/1‑100 (MQ=255) ccTGTCTGTTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTACTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCGGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCtcac > 2:873387/1‑97 (MQ=255) ctgtctgtTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATc < 2:346347/100‑1 (MQ=255) ctgtctgtTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCt < 2:1565371/100‑1 (MQ=255) tgtctgtTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTg < 1:1753972/100‑1 (MQ=255) gtctgtTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTGGCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTg > 1:1811410/1‑99 (MQ=255) gtctgtTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGa > 1:1610870/1‑100 (MQ=255) tctgtTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGAc > 2:1009927/1‑100 (MQ=255) tctgtTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGAc > 2:40717/1‑100 (MQ=255) ctgtTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGAcc < 1:1760659/100‑1 (MQ=255) ctgtTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGAcc < 2:155914/100‑1 (MQ=255) tgtTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCa < 2:1324541/100‑1 (MQ=255) gtTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCa > 2:1556824/1‑100 (MQ=255) gtTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCAt < 1:293809/100‑1 (MQ=255) gCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATgg < 1:18838/100‑1 (MQ=255) gCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATgg < 1:725898/99‑1 (MQ=255) gCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGa > 1:1917845/1‑100 (MQ=255) gCCGCTATTGTCGGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATg < 1:755290/98‑1 (MQ=255) ccGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGAt < 1:40716/100‑1 (MQ=255) ccGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGAt > 1:1848020/1‑100 (MQ=255) tATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGc < 2:2358063/100‑1 (MQ=255) tGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTgg > 1:966353/1‑100 (MQ=255) gTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCGGTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGGTgg > 1:249110/1‑100 (MQ=255) gTCTGGCCGGAGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTggg < 2:1294744/100‑1 (MQ=255) tCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGgc > 1:2240536/1‑100 (MQ=255) caggCCGGCGGGTCCTATCAGCACGGCGACTAAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGgcg > 2:1745120/3‑100 (MQ=255) cTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGgcg < 1:865646/100‑1 (MQ=255) cTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGgcg > 2:406069/1‑100 (MQ=255) gCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCaa > 1:430675/1‑100 (MQ=255) ccGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCaa > 1:2522859/1‑100 (MQ=255) ccGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAAt > 1:971460/1‑100 (MQ=255) ccGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCCGCG‑TTTCTAACGGCTGCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCaa > 1:1778925/1‑99 (MQ=255) cggcggGCTCTATAAGCACGGCGCCTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCGAt > 1:1152158/1‑99 (MQ=255) ggcggGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATgg > 2:1308187/1‑100 (MQ=255) ggcggGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATgg < 2:1895399/100‑1 (MQ=255) ggcggGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATgg < 2:304150/100‑1 (MQ=255) cggGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGgtg < 1:112771/100‑1 (MQ=255) gggTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGgtgt < 2:1930276/100‑1 (MQ=255) gTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGtt < 1:1632050/100‑1 (MQ=255) gTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTCACGGCCATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGttt > 1:1196204/1‑100 (MQ=255) gTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGttt < 1:1448466/100‑1 (MQ=255) tCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTg < 2:1484416/100‑1 (MQ=255) tCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTgg < 2:1067004/100‑1 (MQ=255) cTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTgg < 1:1253324/100‑1 (MQ=255) cTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGt > 2:828540/1‑100 (MQ=255) atcatcACGGCGACTGAGGCGTATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTa > 1:482694/1‑100 (MQ=255) tCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATc > 1:928363/1‑100 (MQ=255) aGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGGGCAATGGTGTTTGGTATCGt < 1:1585588/100‑1 (MQ=255) aGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGt < 1:963212/100‑1 (MQ=255) aCGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATCCGCTGGGCGCAATTGTGTTTGGTCTCGtt > 1:2440892/1‑98 (MQ=255) aCGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTAt > 2:789385/1‑100 (MQ=255) cGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTAtt > 2:1559896/1‑100 (MQ=255) cGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTAtt > 1:765605/1‑100 (MQ=255) cGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTAtt > 1:845257/1‑100 (MQ=255) ggCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTAtt < 2:2013472/100‑1 (MQ=255) ggCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTAttn < 1:1795630/100‑2 (MQ=255) ggCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTg < 2:2573570/100‑1 (MQ=255) ggCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTg < 1:196517/100‑1 (MQ=255) gCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTg < 2:1524480/100‑1 (MQ=255) cGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGtt > 1:1039857/1‑100 (MQ=255) aCTGAGGCTTATCAAAACGCTGCGTTTGCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGtt > 2:429087/1‑99 (MQ=255) aCTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTaa < 2:1467189/100‑1 (MQ=255) aCTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACACTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTaa < 1:1102413/100‑1 (MQ=255) cTGAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAAc < 2:1044712/100‑1 (MQ=255) gAGGCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAAcgc < 2:873980/100‑1 (MQ=255) ggCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACgcgg > 2:1231562/1‑100 (MQ=255) gCTTATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACgcggc > 1:1110320/1‑100 (MQ=255) ttATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTACAGGCTATCTGCACATGGATACGCTGGGCGTAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACgcggcg < 1:1120796/99‑1 (MQ=255) ttATCAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGgcgc < 1:1602222/100‑1 (MQ=255) cAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTtc > 2:2031277/1‑100 (MQ=255) cAAAACGCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTtc > 1:2076867/1‑100 (MQ=255) aaaaCGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTtc < 1:1478235/100‑1 (MQ=255) aCGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGCCGCGttaaca < 2:2210326/100‑5 (MQ=255) gCTGCG‑TTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGTGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTgg < 2:481951/100‑1 (MQ=255) cTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAGTGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTgg > 2:1800882/1‑100 (MQ=255) gCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCg > 2:2371664/1‑100 (MQ=255) gCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCg > 1:2226786/1‑100 (MQ=255) cGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCAGGGATACGTTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGCCGCGttaacaataac < 1:2076570/99‑10 (MQ=255) | GCTGAAAATTATCGCGCTGGTCATCCTGTCTGTTGCCGCTATTGTCTGGCCGGCGGGTTCTATCAGCACGGCGACTGAGGCTTATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCG > NC_000913/420049‑420242 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |