| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,973,096 | Δ1 bp | 15.3% | coding (575/1068 nt) | rffG → | dTDP‑glucose 4,6‑dehydratase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,973,095 | 0 | G | . | 15.3% | 281.2 / 48.2 | 98 | coding (574/1068 nt) | rffG | dTDP‑glucose 4,6‑dehydratase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (44/39); new base . (9/6); total (53/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.80e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.25e-01 | |||||||||||
CCTTATTCCGCGTCAAAAGCCAGCAGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCGGTATATGGCAACGGGCAGCAAATCCGT > NC_000913/3972996‑3973193 | ccTTATTCCGCGTCAAAAGCCAGCAGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACg > 1:2525072/1‑100 (MQ=255) ttATTCCGCGTCAAAAGCCAGCAGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGc < 2:2106551/100‑1 (MQ=255) aTTCCGCGTCAAAAGCCAGCAGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGccc > 1:1012257/1‑100 (MQ=255) ttCCGCGTCAAAAGCCAGCAGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCt > 2:855230/1‑100 (MQ=255) tCCGCGTCAAAAGCCAGCAGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCtt < 2:1343957/100‑1 (MQ=255) tCCGCGTCAAAAGCCAGCAGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCtt > 1:2257513/1‑100 (MQ=255) tCCGCGTCAAAAGCCAGCAGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTAC‑GCCCTTa > 2:631009/1‑100 (MQ=255) tCCGCGTCAAAAGCCAGCAGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCGATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTAC‑GCCCtt > 1:1863687/1‑99 (MQ=255) ccGCGTCAAAAGCCAGCAGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTa > 2:890662/1‑100 (MQ=255) ccGCGTCAAAAGCCAGCAGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTa > 1:709275/1‑100 (MQ=255) ccGCGTCAAAAGCCAGCAGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTa > 1:1827398/1‑100 (MQ=255) ccGCGTCAAAAGCCAGCAGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTa > 1:1980730/1‑100 (MQ=255) gcgTCAAAAGCCAGCAGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTAcc < 2:1726108/100‑1 (MQ=255) cgTCAAAAGCCAGCAGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTAC‑GCCCTTACCAc < 1:78319/100‑1 (MQ=255) gTCAAAAGCCAGCGGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTAccgc < 2:697975/100‑3 (MQ=255) gTCAAAAGCCAGCAGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCAc < 2:957288/100‑1 (MQ=255) tCAAAAGCCAGCAGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCGTACCAc > 1:1860549/1‑99 (MQ=255) aaaaGCCAGCAGCGACCATCTGGTGAGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTAC‑GCCCTTACCACTTTc > 1:2178739/1‑100 (MQ=255) aaaGCCAGCAGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTTCTCTAATAACTACGGCCCGTACCACGTTc > 1:859062/1‑100 (MQ=255) naGCCAGCAGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACCTTcc > 1:100/2‑100 (MQ=255) aaGCCAGCAGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTcc < 2:2257528/100‑1 (MQ=255) aaGCCAGCAGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTcc > 2:1636408/1‑100 (MQ=255) aGCCAGCAGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCg < 1:1659865/100‑1 (MQ=255) gCCAGCAGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGTTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTAC‑GCCCTTACCACTTTCCGGa > 1:2320856/1‑100 (MQ=255) gCCAGCAGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCgg > 2:2534181/1‑100 (MQ=255) ccAGCAGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGa > 2:810293/1‑100 (MQ=255) ccAGCAGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGa > 2:1692764/1‑100 (MQ=255) cagcagCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGaa > 1:603035/1‑100 (MQ=255) cagcagCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCAGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTAC‑GCTCTTACCACTTTCCGGaaa > 2:2457251/1‑100 (MQ=255) agcagcGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGaaa > 1:489028/1‑100 (MQ=255) agcagcGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGaaa < 1:224566/100‑1 (MQ=255) gcagcGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGaaaa > 2:1405877/1‑100 (MQ=255) gcagcGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGaaaa > 1:606284/1‑100 (MQ=255) gcGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACt > 2:1606714/1‑100 (MQ=255) cGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTg < 2:510720/100‑1 (MQ=255) gACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCATACCACTTTCCGGAAAAACt > 1:1991834/1‑98 (MQ=255) aCCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGan < 2:1243156/100‑2 (MQ=255) aTCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATccc < 2:2475972/100‑1 (MQ=255) ncTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCg > 1:2184254/2‑100 (MQ=255) tGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACTAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCt < 1:2453365/100‑1 (MQ=255) tGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCt > 2:414392/1‑100 (MQ=255) gTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCtga < 2:2031389/100‑1 (MQ=255) gcgcccCTGGCTGCGGACATATGGTCTGCAGACGCTTACCACCAACTGATCGCATGACTACGGACCTTAACCCTTTCCGGAAAAACTGCTCCAGCtgct < 2:764913/99‑3 (MQ=255) gcCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATcc < 2:1012260/100‑1 (MQ=255) gcCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTAC‑GCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCt < 2:2108483/100‑1 (MQ=255) ccTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCCCATTCCGGGAAAACTGATCCCGCTGATGATc > 1:1006208/1‑98 (MQ=255) ggCTGCGGACCTATAGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCaa < 1:1719918/100‑1 (MQ=255) gCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTAC‑GCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAAcg > 1:268132/1‑100 (MQ=255) cTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAAcg < 1:1830024/100‑1 (MQ=255) cTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAAcg < 1:855227/100‑1 (MQ=255) cTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAAcg < 2:1192409/100‑1 (MQ=255) tGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCTAATAACTAC‑GCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAAcgcg < 1:1738573/100‑1 (MQ=255) tGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAAcgc < 1:716733/100‑1 (MQ=255) gCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGCTGATCCTCAAcgcg > 1:2539046/1‑100 (MQ=255) gACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTAC‑GCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTgg > 2:873754/1‑100 (MQ=255) aCCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTgg < 1:226378/100‑1 (MQ=255) aCCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTAC‑GCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGc < 2:1365830/100‑1 (MQ=255) ccTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGc > 2:647592/1‑100 (MQ=255) tATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCCCAACGCGCTg > 1:1723675/1‑96 (MQ=255) tATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCCCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCTGAAAAACTGATCCCGCTGCTGATCCTCAACGCGCTGGCgg > 1:45525/1‑100 (MQ=255) aTGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCggg < 2:574166/100‑1 (MQ=255) tGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGt < 2:2525091/100‑1 (MQ=255) tctCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTa < 2:1149944/98‑1 (MQ=255) gtttggcGATGCTTATCAAAAAGTGCTGGAATAATTAC‑GCCCTTACAACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGTTGATGATCCTCAACGCGCTTGCGGGTaaa > 1:2424588/7‑100 (MQ=255) gTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTaa > 1:2225968/1‑100 (MQ=255) gTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTAC‑GCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTaaa > 2:317326/1‑100 (MQ=255) cTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTaaga > 1:1149940/1‑98 (MQ=255) gCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCg < 2:1264248/100‑1 (MQ=255) gCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCg < 2:140858/100‑1 (MQ=255) cGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCt > 1:1836953/1‑100 (MQ=255) cTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCgg > 2:2160915/1‑100 (MQ=255) cTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCgg < 2:1419478/100‑1 (MQ=255) ttATCACCAACTGCTCGAATAACTAC‑GCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCGGta < 2:2521521/100‑1 (MQ=255) tATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCTCTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCCCAACGCGCTGGCGGGTCAATCGCTccc > 1:48826/1‑96 (MQ=255) tATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCGGta > 1:449504/1‑100 (MQ=255) tATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCGGta < 1:1174122/100‑1 (MQ=255) aCCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCGGTATATg > 2:2185176/1‑100 (MQ=255) aCCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCGGTATATg < 2:652710/100‑1 (MQ=255) aCCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACGTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCGGTATATg < 1:2271088/100‑1 (MQ=255) ccAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCGGTATATgg > 2:757726/1‑100 (MQ=255) cAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCGGTATATGGc > 1:1732405/1‑100 (MQ=255) tGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCGGTATATGGCAACg > 2:312788/1‑100 (MQ=255) tGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCGGTATATGGCAACg < 2:412462/100‑1 (MQ=255) gCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCTCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCGGTATATGGCAACg < 1:1105632/99‑1 (MQ=255) gCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCGGTATATGGCAACgg < 1:2538322/100‑1 (MQ=255) cGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCGGTATATGGCAACGGgca < 2:589137/100‑1 (MQ=255) cGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCGGTATATGGCAACGGgca > 2:897124/1‑100 (MQ=255) cGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCGGTATATGGCAACGGgc > 1:1888492/1‑99 (MQ=255) cGAATAACTAC‑GCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCGGTATATGGCAACGGgcag < 2:2245354/100‑1 (MQ=255) aaTAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAGCTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCGGTATATGGCAACGGgcagc < 1:371926/100‑1 (MQ=255) aaTAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCGGTATATGGCAACGGgcag > 1:406866/1‑99 (MQ=255) aaTAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCGGTATATGGCAACGGgcag > 1:407816/1‑99 (MQ=255) aTAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCGGTATATGGCAACGGgcagca < 2:1343771/100‑1 (MQ=255) tAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTTGCGGGGAAATGGCTGCCGGTAAATGGCAACgg > 1:1407692/1‑93 (MQ=255) aaCTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCGGTATATGGCAACGGGCAGCaaa > 2:2243588/1‑100 (MQ=255) aaCTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCGGTATATGGCAACGGGCAGCaaa < 1:375226/100‑1 (MQ=255) aCTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCGGTATATGGCAACGGGCAGCAAAt > 1:1780920/1‑100 (MQ=255) tACGGCCCTTACCACAAACAGAAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCGGTATATGGCAACGGGCAGCAAATcc < 1:1756196/100‑1 (MQ=255) cGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCTGGTAAATCGCTGCCGGTATATGGCAACGCGCAGCAAATccat < 2:1752769/100‑3 (MQ=255) | CCTTATTCCGCGTCAAAAGCCAGCAGCGACCATCTGGTGCGCGCCTGGCTGCGGACCTATGGTCTGCCGACGCTTATCACCAACTGCTCGAATAACTACGGCCCTTACCACTTTCCGGAAAAACTGATCCCGCTGATGATCCTCAACGCGCTGGCGGGTAAATCGCTGCCGGTATATGGCAACGGGCAGCAAATCCGT > NC_000913/3972996‑3973193 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |