Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,754,784:1 | (A)8→9 | 100% | intergenic (‑20/‑112) | ratA ← / → smpB | toxic UPF0083 family protein inhibitor of 70S ribosome formation/tmRNA‑binding trans‑translation protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,754,776 | 1 | . | A | 56.3% | 171.1 / 145.0 | 87 | intergenic (‑12/‑120) | ratA/smpB | toxic UPF0083 family protein inhibitor of 70S ribosome formation/tmRNA‑binding trans‑translation protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (16/22); new base A (23/26); total (39/48) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.71e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTCAGA > NC_000913/2754679‑2754873 | tGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑aa > 2:1129898/1‑100 (MQ=255) tGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑aa > 2:757568/1‑100 (MQ=255) ccGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑aaaaaa > 2:1243277/1‑100 (MQ=255) ccGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑aaaaaa > 1:153148/1‑100 (MQ=255) cgcgCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑aaaaaaa < 1:1093025/100‑1 (MQ=255) cgcTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTACTCACAGGCAAAACTATTACCTTCAACAAAAATTCATCAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑a < 1:1619017/92‑1 (MQ=255) gcTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑aaaaaaaaac < 2:2542803/100‑3 (MQ=255) cTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑aaaaaaaaacg < 2:1934406/100‑4 (MQ=255) tGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑aaaaaaaaacgc < 2:932584/100‑5 (MQ=255) tAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAACATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTa > 2:1385870/1‑100 (MQ=255) gggTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATc > 1:820844/1‑100 (MQ=255) gggTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATc > 2:1158376/1‑100 (MQ=255) gggTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATc > 2:1278886/1‑100 (MQ=255) ggTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATcc > 1:111120/1‑100 (MQ=255) ggTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATcc > 1:935860/1‑100 (MQ=255) gTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATccc < 2:1233572/100‑1 (MQ=255) ccAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGgc > 2:1649846/1‑100 (MQ=255) gTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCGATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACAATATCCCGgcgc > 1:1166338/1‑99 (MQ=255) tGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTgg < 2:2210769/100‑1 (MQ=255) gCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTgg > 2:2188865/1‑100 (MQ=255) cGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTgg > 2:1389814/1‑99 (MQ=255) ggTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGt > 2:304288/1‑100 (MQ=255) ggTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGt < 1:1045757/100‑1 (MQ=255) ggTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTa < 1:485136/100‑1 (MQ=255) gTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTaa > 1:2474596/1‑100 (MQ=255) tCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTaa < 1:206241/100‑1 (MQ=255) ccGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAAc < 2:1269344/100‑1 (MQ=255) ccGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACa > 1:1343881/1‑100 (MQ=255) ccGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACa < 2:1681911/100‑1 (MQ=255) ggCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATc > 2:2206639/1‑100 (MQ=255) gCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCAACAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATAAAAAAA‑A‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCg < 1:1289777/100‑1 (MQ=255) tAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCgg > 2:474054/1‑100 (MQ=255) atgtaaGGCTTAACCATTTCCATCAAGAAAAATCTAACAAGTACTTTCGTTTATAAAAAAA‑AAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGt < 1:2453154/95‑1 (MQ=255) aTCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACAt > 1:1404890/1‑95 (MQ=255) tCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGtt < 1:1974184/100‑1 (MQ=255) tGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCTACAAATGATGTCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCAt < 1:1816185/100‑1 (MQ=255) tGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCa > 2:1131317/1‑100 (MQ=255) tGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCa < 2:128156/100‑1 (MQ=255) tGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCggg > 2:2075067/1‑95 (MQ=255) tGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCAt > 2:2105469/1‑100 (MQ=255) ggCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGc > 1:873893/1‑100 (MQ=255) ggCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCt < 2:28989/100‑1 (MQ=255) cATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTTATGCt > 1:718642/1‑99 (MQ=255) cATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTaa < 2:153149/100‑1 (MQ=255) cATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTaa < 2:673254/100‑1 (MQ=255) aTAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAg < 2:1539343/100‑1 (MQ=255) aTAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAg < 2:1583786/100‑1 (MQ=255) tAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAg < 2:1008319/100‑1 (MQ=255) tAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAg > 2:1622940/1‑99 (MQ=255) tAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGa < 1:1919981/100‑1 (MQ=255) tAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCCGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAg > 2:810843/1‑99 (MQ=255) tAACAATTCCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAg < 1:2226392/100‑1 (MQ=255) aCAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGAt > 2:1275516/1‑100 (MQ=255) aCAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGAt > 1:1789685/1‑100 (MQ=255) cATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTg > 1:739573/1‑100 (MQ=255) cATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTg > 2:2513458/1‑100 (MQ=255) ataaacaaAAATACAACAAGTAATATCATTTATGCAAAAGAA‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTg < 1:2241634/97‑1 (MQ=255) tCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGt < 2:1184686/100‑1 (MQ=255) caacaaAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTcc > 2:1282588/1‑100 (MQ=255) aacaaAAATCCAACAAGTAATACCATTAATCCTGCTG‑A‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTcc < 1:1729599/99‑1 (MQ=255) aacaaAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTcc < 2:151051/100‑1 (MQ=255) acaaAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTcccc > 2:133514/1‑100 (MQ=255) caaAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGTTAGAGCCTTGt > 2:1727263/1‑96 (MQ=255) caaAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTccccc > 1:2470186/1‑100 (MQ=255) aaaaaTCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGTGCCTTGTCCCCCg < 1:1602294/100‑1 (MQ=255) aaaaTCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCg < 2:1292325/100‑1 (MQ=255) aaaTCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTCTCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCg < 2:2331719/99‑1 (MQ=255) aaaTCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGc < 2:1521992/100‑1 (MQ=255) aaaTCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCa < 1:1501099/100‑1 (MQ=255) gtCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAgg > 1:2014863/2‑100 (MQ=255) aTCCAACAAATAAAATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAg < 1:565718/100‑1 (MQ=255) ccAACAAATAATTCCATTTACCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAg < 2:397755/98‑1 (MQ=255) caacaaATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGc > 1:2077575/1‑95 (MQ=255) caacaaATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAGGa > 1:1167695/1‑99 (MQ=255) caacaaATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAGGAtt < 2:550538/100‑1 (MQ=255) caacaaATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAGGAtt < 1:54440/100‑1 (MQ=255) acaaATAATATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAGGATTg < 1:695918/100‑1 (MQ=255) aataatATCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAGGATTGata < 2:693746/100‑1 (MQ=255) aataatATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAGGATTGatat > 2:1878979/1‑100 (MQ=255) atatCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAGGATTGATATgggg < 2:1316938/100‑1 (MQ=255) tatCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAGGATTGATATgggg < 1:84693/100‑1 (MQ=255) tatCATTTATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAGGATTGATATgggg > 1:1927946/1‑100 (MQ=255) atCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGgtg < 1:443392/100‑1 (MQ=255) tCAATTATCCGGCAG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGgt < 1:2117392/99‑1 (MQ=255) cATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGtt > 2:1692659/1‑100 (MQ=255) tATCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTc < 2:131467/100‑1 (MQ=255) aTCCTGCTG‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCg < 2:1519500/100‑1 (MQ=255) aTCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGa < 2:7350/100‑1 (MQ=255) tCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGAt < 1:1824645/100‑1 (MQ=255) ctgctg‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGAt < 1:802003/99‑1 (MQ=255) tgctg‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACCTCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGAttt > 1:1381963/1‑100 (MQ=255) tgctg‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGAttt < 1:1385862/100‑1 (MQ=255) tgctg‑TAAAAAAAAACGCTAACCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGAtt < 1:1025231/99‑1 (MQ=255) gctg‑TAAAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTc < 2:69812/100‑1 (MQ=255) tg‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTTGGTAACATCGTGTTCATTCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTCAGa < 1:2045710/100‑1 (MQ=255) tg‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTCAGa > 2:322911/1‑100 (MQ=255) | TGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATTTCCATCAACAAAAATCCAACAAATAATATCATTTATCCTGCTG‑T‑AAAAAAAACGCTATCCCGGCGCTGGGTAACATCGGGTTCATGCTAAGATAGAGCCTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTCAGA > NC_000913/2754679‑2754873 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |