| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 228022 | NA (NA) | 20 (0.240) | 11/164 | NT | NA | noncoding (2264/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon |
| ? | NC_000913 | = 228033 | NA (NA) | noncoding (2275/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon | |||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/227917‑228022‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctcctccGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGG < NC_000913/228033‑227935 GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑C > 2:855557/1‑100GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑C < 1:267898/100‑1GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑C < 2:1925828/100‑1GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑C < 2:782748/100‑1GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑C < 1:514511/100‑1GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑C > 2:604669/1‑100 CCGACCTTGAAATACCACCCTTTGATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑C < 1:1425900/99‑1 CCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CT > 2:2495663/1‑100 CGACCTTGACATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTC > 1:2246974/1‑100 CGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGTCTGGGGCGGT‑‑‑CTC > 2:1856788/1‑100 CGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTC > 2:158015/1‑100 CGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTC > 1:2590667/1‑100 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTACTCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTC > 1:465170/1‑99 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCC < 2:723173/100‑1 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCC < 2:2254405/100‑1 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCC > 2:1943452/1‑100 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCC < 2:2540119/100‑1 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCC < 1:1202258/100‑1 ACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCT < 1:1285461/100‑1 ACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCT > 2:231426/1‑100 ACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCT < 2:1351612/100‑1 ACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGCGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCT < 1:1707682/100‑1 CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCGGGGTTGCGGACAGTGTCTGGAGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTC > 2:501976/1‑100 CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTC > 2:1290528/1‑100 CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTC > 2:1882578/1‑100 CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTC > 1:266943/1‑100 CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTC > 1:1055158/1‑100 CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTC < 2:1720670/100‑1 CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTC > 2:1758016/1‑100 CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTC > 2:1612762/1‑100 CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTC > 1:1161620/1‑100 CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTC < 1:231424/100‑1 CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTC > 2:745155/1‑100 CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTC > 2:437075/1‑100 tccgatcTACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCC < 1:1832714/93‑1 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCC < 2:1641988/100‑1 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCC < 2:1515758/100‑1 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCC < 2:1227111/100‑1 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCC > 1:821875/1‑100 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCC > 1:2318639/1‑100 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCC > 1:727906/1‑100 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCC < 1:2062869/100‑1 TGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTagat > 2:1576403/1‑96 tcttccgatcTGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGG‑‑‑CTCCTCCGTTACTCTTT < 2:831507/90‑1 ACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCCGTTACTCTTTA < 2:2388325/100‑1 CCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCCGTTACTCTTTAGG < 2:1196329/100‑1 TTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGG < 2:1678561/100‑1 AATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAG < 1:2321433/100‑1 AATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAG < 1:2182405/100‑1 ATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCCGGTTGCAGAGAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGA < 1:1816442/100‑1 tgaTTGATTTTCTAACGTTGACCCGTAAGCCGGGCTGCGTACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGAC < 1:67232/97‑1 TGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGAC < 2:2538992/100‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |