| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1840374 = | 65 (0.710) | 12 (0.140) | 8/166 | NT | 16.7% | coding (908/1308 nt) | ynjE | molybdopterin synthase sulfurtransferase |
| ? | NC_000913 | 1840391 = | 59 (0.690) | coding (925/1308 nt) | ynjE | molybdopterin synthase sulfurtransferase | |||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GTGAAAGCGGAACCGGATTTCGGCGTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCTATATTAAACCAAAAGGTGAAATAGCCGGCGCACGTTGGGGAC > NC_000913/1840292‑1840490 | gTGAAAGCGGAACCGGATTTCGGCGTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCAt < 2:1103482/100‑1 (MQ=255)gTGAAAGCGGAACCGGATTTCGGCGTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCAt > 2:1248857/1‑100 (MQ=255) tatttcaccttttggtttaatatagctgtaaccgctggtcgtaccgataaattctggccacgaacgaatgctcaccagcgaTGCATCGCCAGGATGCATc > 2:13602‑M1/82‑100 (MQ=255) gAAAGCGGAACCGGATTTCGGCGTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCg > 1:1891247/1‑100 (MQ=255) tttcaccttttggtttaatatagctgtaaccgctggtcgtaccgataaattctggccacgaacgaatgctcaccagcgaTGCATCGCCAGGATGCATCGc > 2:251327‑M1/80‑100 (MQ=255) tttcaccttttggtttaatatagctgtaaccgctggtcgtaccgataaattctggccacgaacgaatgctcaccagcgaTGCATCGCCAGGATGCATCGc > 2:2559162‑M1/80‑100 (MQ=255) aaaGCGGAACCGGATTTCGGCGTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGc < 2:1177921/100‑1 (MQ=255) aaaGCGGAACCGGATTTCGGCGTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGc < 1:725506/100‑1 (MQ=255) aaaGCGGAACCGGATTTCGGCGTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGc > 1:23939/1‑100 (MQ=255) ttcaccttttggtttaatatagctgtaaccgctggtcgtaccgataaattctggccacgaacgaatgctcgccagcgaTGCATCGCCAGGATGCATCGCt > 2:366911‑M1/79‑100 (MQ=255) ttcaccttttggtttaatatagctgtaaccgctggtcgtaccgataaattctggccacgaacgaatgctcaccagcgaTGCATCGCCAGGATGCATCGCt > 2:2058785‑M1/79‑100 (MQ=255) ttcaccttttggtttaatatagctgtaaccgctggtcgtaccgataaattctggccacgaacgaatgctcaccagcgaTGCATCGCCAGGATGCATCGCt > 2:1145130‑M1/79‑100 (MQ=255) tcaccttttggtttaatatagctgtaaccgctggtcgtaccgataaattctggccacgaacgaatgctcaccagcgatgcatcgccaggatgcaTCGCTg < 1:437787‑M2/6‑1 (MQ=255) gCGGAACCGGATTTCGGCGTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTgg > 2:331276/1‑100 (MQ=255) caccttttggtttaatatagctgtaaccgctggtcgtaccgataaattctggccacgaacgaatgctcaccagcgaTGCATCGCCAGGATGCATCGCTgg > 2:612032‑M1/77‑100 (MQ=255) ggAACCGGATTTCGGCGTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTg < 2:2048159/100‑1 (MQ=255) ggAACCGGATTTCGGCGTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTg < 1:339894/100‑1 (MQ=255) ccttttggtttaatatagctgtaaccgctggtcgtaccgataaattctggccacgaacgaatgctcaccagcgaTGTATCGCCAGGATGCATCGCTGGTg > 1:398625‑M1/75‑100 (MQ=255) ccttgtgggttaatatagctgtaaccgctggtcgtaccgataaattctggccacgaacgaatgctcaccagcgaTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTg > 1:766973‑M1/75‑100 (MQ=255) ttttggtttaatatagctgtaaccgctggtcgtaccgataaattctggccacgaacgaatgctcaccagcgatgcatcgccaggatgcaTCGCTGGTGAg < 1:1520955‑M2/11‑1 (MQ=255) aaCCGGATTTCGGCGTTAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAg < 1:499191/100‑1 (MQ=255) tttggtttaatatagctgtaaccgctggtcgtaccgataaattctggccacgaacgaacgctcaccagcgatgcatcgccaggatgcaTCGCTGGTGAGc < 1:1231455‑M2/12‑1 (MQ=255) cGGATTTCGGCGTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCAt > 2:594287/1‑100 (MQ=255) cGGATTTCGGCGTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCATGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCa < 1:1339801/99‑1 (MQ=255) tCGGCGTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCAttcgttc > 2:257653/1‑100 (MQ=255) cGGCGTGAAGATCCCGGCACAACAGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCAttcgttcg > 1:98938/1‑100 (MQ=255) ggCGTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATtcgttcgt > 2:1637225/1‑100 (MQ=255) gCGTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTg < 1:801533/100‑1 (MQ=255) cGTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTgg > 1:1683514/1‑100 (MQ=255) cGTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTgg < 2:301031/100‑1 (MQ=255) tGAAGATCCCGGCACAACCGGAGTGGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGcc < 1:2462008/100‑1 (MQ=255) gAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCa > 1:1265816/1‑100 (MQ=255) aGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGa < 2:874638/100‑1 (MQ=255) tCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAAtt > 2:413588/1‑100 (MQ=255) cccGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGTAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAAttt > 2:428874/1‑100 (MQ=255) ccGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTa > 1:439335/1‑100 (MQ=255) ggCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATc < 1:413586/100‑1 (MQ=255) ggCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATc < 1:857090/100‑1 (MQ=255) ggCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATc < 1:2332765/100‑1 (MQ=255) gCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCg > 2:1927964/1‑100 (MQ=255) gCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCg > 2:1927934/1‑100 (MQ=255) cacaACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCgg < 2:2075019/100‑1 (MQ=255) cacaACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCgg < 2:183573/100‑1 (MQ=255) caACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTa < 2:1716397/100‑1 (MQ=255) caACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTa < 2:251241/100‑1 (MQ=255) caACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTa > 1:827969/1‑100 (MQ=255) aCCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACg > 1:734429/1‑100 (MQ=255) aCCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACg > 2:618619/1‑100 (MQ=255) gCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGAcc < 1:1049525/100‑1 (MQ=255) gCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGAcc > 2:870138/1‑100 (MQ=255) gATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGt < 1:1284182/100‑1 (MQ=255) aTGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGtt < 2:301235/100‑1 (MQ=255) gCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTAc < 2:179167/100‑1 (MQ=255) cTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACa < 2:1927511/100‑1 (MQ=255) tCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAg > 2:2098363/1‑100 (MQ=255) cGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGc < 1:1691621/100‑1 (MQ=255) cGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGc < 2:532056/100‑1 (MQ=255) atatGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCta > 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atgcaTCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCTATATTAAACCAAAAGGTGAAATAGCCGGCGCACGtt < 2:123578‑M2/94‑1 (MQ=255) tgcaTCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCTATATTAAACCAAAAGGTGAAATAGCCGGCGCACGTTgg > 2:1718907‑M2/5‑100 (MQ=255) caTCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTCCGACCAGCGGTTACAGCTATATTAAACCACAAGGTGAAATAGCCGGCGAACGtt > 1:2421833‑M2/3‑96 (MQ=255) caTCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCTATATTAAACCAAAAGGTGAAATAGCCGGCGCACGTTgggg < 2:429356‑M2/98‑1 (MQ=255) caTCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCTATATTAAACCAAAAGGTGAAATAGCCGGCGCACGTTgggg > 2:1893441‑M2/3‑100 (MQ=255) tCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCTATATTAAACCAAAAGGTGAAATAGCCGGCGCACGTTGGGGac < 2:703510/100‑1 (MQ=255) | GTGAAAGCGGAACCGGATTTCGGCGTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCATCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCTATATTAAACCAAAAGGTGAAATAGCCGGCGCACGTTGGGGAC > NC_000913/1840292‑1840490 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |