| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1843724 = | NA (NA) | 13 (0.150) | 6/164 | NT | NA | noncoding (1/93 nt) | REP131 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP131 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences |
| ? | NC_000913 | 1843750 = | NA (NA) | noncoding (27/93 nt) | REP131 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP131 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | |||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
GGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCGTTTATGAGTATTTAACGGAT > NC_000913/1843651‑1843849 | gggCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGcc < 1:79565/100‑1 (MQ=255)aattttgccgggggcgctgcgcttgcccggcctacattagagcgtaactgcaatgaattgtgcccatttgtagGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGcc > 2:2282703‑M1/74‑100 (MQ=255)aattttgccgggggcgctgcgcttgcccggcctacattagagcgtaactgcaatgaattgtgcccatttgtagGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGcc > 2:290569‑M1/74‑100 (MQ=255)aattttgccgggggcgctgcgcttgcccggcctacattagagcgtaactgcaatgaattgtgcccatttgtagGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGcc > 2:155807‑M1/74‑100 (MQ=255)aattttgccgggggcgctgcgcttgcccggcctacattagagcgtaactgcaatgaattgtgcccatttgtagGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGcc > 1:797859‑M1/74‑100 (MQ=255) ggCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCt < 2:762866/100‑1 (MQ=255) attttgccgggggcgctgcgcttgcccggcctacattagagcgtaactgcaatgaattgtgcccatttgtagGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCt > 2:2220‑M1/73‑100 (MQ=255) attttgccgggggcgctgcgcttgcccggcctacattagagcgtaactgcaatgaattgtgcccatttgtagGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCt > 2:1095121‑M1/73‑100 (MQ=255) ttttgccggggtcgctgcccttgcccggcctacattagagcgcaactgcaatgaattgtgcccatttgtagGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCt > 1:216709‑M1/72‑99 (MQ=255) ttttgccgggggcgctgcgcttgcccggcctacattagagcgtaactgcaatgaattgtgcccatttgtatGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTa > 2:1032056‑M1/72‑100 (MQ=255) ttttgccgggggcgctgcgcttgcccggcctacattagagcgtaactgcaatgaattgtgcccatttgtagGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTa > 2:444710‑M1/72‑100 (MQ=255) gcgcTAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGAAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGcc < 1:156698/98‑1 (MQ=255) cgcgAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTAc < 1:2446973/100‑1 (MQ=255) gcgAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACa > 1:154799/1‑100 (MQ=255) tgccgggggcgctgcgcttgcccggcctacattagagcgtaactgcaatgaattgtgcccatttgtagGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACaa > 2:2588070‑M1/69‑100 (MQ=255) cgAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACaa > 1:703402/1‑100 (MQ=255) gccgggggcgctgcgcttgcccggcctacatgagagcgtaactgcaatgaattgtgcccatttgtagGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACaaa > 1:1186996‑M1/68‑100 (MQ=255) gAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCGTACaaa > 1:1129663/1‑100 (MQ=255) aTTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATggg < 2:1858627/100‑1 (MQ=255) aTTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATggg < 2:1544188/100‑1 (MQ=255) aTTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATggc < 1:574265/100‑2 (MQ=255) tGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGca > 2:2000395/1‑100 (MQ=255) gCCGGTTTTGTGAATGTTCCCGCTGCGATGCCGGCGCAGGGTGTGATTTAGGTTGTAAATGCCTGATGTCGCTACGCTTATCAGACCTACAAATGGGcat > 1:78248/1‑99 (MQ=37) gCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGcac > 2:1814156/1‑100 (MQ=255) gCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAAAGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTAACAATGGGc > 1:2345675/1‑98 (MQ=255) ccGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGcaca < 1:2051403/100‑1 (MQ=255) ggTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAAt > 1:1570594/1‑100 (MQ=255) ggTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAAt > 1:1056609/1‑100 (MQ=255) ttttGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTc < 1:771805/100‑1 (MQ=255) ttttGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTc < 2:1612006/100‑1 (MQ=255) tgtgAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCAtt > 1:1483896/1‑100 (MQ=255) gtgAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTg < 2:2345689/100‑1 (MQ=255) tgAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGCCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGc < 1:1414331/100‑1 (MQ=255) gAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCa > 1:772322/1‑100 (MQ=255) gAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCa > 1:2035190/1‑100 (MQ=255) tGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACg > 1:1687432/1‑100 (MQ=255) gCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGc < 2:772325/100‑1 (MQ=255) ccGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGct > 2:407930/1‑100 (MQ=255) cgatgcgatgCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGctc > 2:1019299/1‑100 (MQ=255) gcgatgcTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAAt < 2:1272031/100‑1 (MQ=255) gcgatgaTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAAt < 2:2329066/100‑1 (MQ=255) cgatgcTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCATGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATg > 1:1383964/1‑100 (MQ=255) cTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGc > 2:2293470/1‑100 (MQ=255) ggCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGcc > 1:768984/1‑99 (MQ=255) ggCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCg > 2:1246827/1‑100 (MQ=255) cgcAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCggg > 1:1828685/1‑100 (MQ=255) gcAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGc < 1:1167858/100‑1 (MQ=255) gggTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAag < 2:1384649/100‑1 (MQ=255) gggTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAag > 1:837772/1‑100 (MQ=255) ggTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAagc < 2:1147347/100‑1 (MQ=255) tgtgATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAagcgc < 1:2114030/100‑1 (MQ=255) tgATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAagcgcag < 1:2180157/100‑1 (MQ=255) gATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAagcgcagc > 2:2263236/1‑100 (MQ=255) gATGTAAGTTGTAAATGCCTGATGTCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAagcgcagc > 1:2063792/1‑100 (MQ=255) tttAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAagcgcagcgc > 2:236416/1‑100 (MQ=255) tttAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAagcgcagcgc < 1:1525642/100‑1 (MQ=255) tctaagaggTAAATGCCTGATGGCGCTCTGCTTCTGAGGACTACAAATGGGCGAAATTCTTGGCAGTTACTCTATTATGTAGGCCGGACAagcgcagcgc > 1:566721/9‑100 (MQ=255) aaGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGcccc < 1:313598/100‑1 (MQ=255) tttgtaggcctgataagcgtagcgccatcaggcCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTCATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGc > 1:1186996‑M2/34‑100 (MQ=255) ttgtaggcctgataagcgtagcgccatcaggcCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCa > 2:2588070‑M2/33‑100 (MQ=255) tAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCaa > 2:2141442/1‑100 (MQ=255) taggcctgataagcgtagcgccatcaggcCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCaaaa > 2:444710‑M2/30‑100 (MQ=255) taggcctgataagcgtagcgccatcaggcATACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCaaaa > 2:1032056‑M2/30‑100 (MQ=255) aggcctgataagcgtagcgccatcaggcCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTGCGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGGGCAGCGACCCCGGCaaaa > 1:216709‑M2/29‑99 (MQ=255) aggcctgataagcgtagcgccatcaggcCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAAt > 2:1095121‑M2/29‑100 (MQ=255) aggcctgataagcgtagcgccatcaggcCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAAt > 2:2220‑M2/29‑100 (MQ=255) tGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAAtt > 2:760877/1‑100 (MQ=255) ggcctgataagcgtagcgccatcaggcCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAAtt > 2:290569‑M2/28‑100 (MQ=255) ggcctgataagcgtagcgccatcaggcCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAAtt > 2:155807‑M2/28‑100 (MQ=255) ggcctgataagcgtagcgccatcaggcCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAAtt > 1:797859‑M2/28‑100 (MQ=255) ggcctgataagcgtagcgccatcaggcCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAAtt > 2:2282703‑M2/28‑100 (MQ=255) gcctgataagcgtagcgccatcaggaCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGATCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAAttt > 1:211435‑M2/27‑100 (MQ=255) nCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATCCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTc < 1:1266523‑M1/99‑1 (MQ=255) CCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTc < 1:946931‑M1/100‑1 (MQ=255) CCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTc < 2:2224124‑M1/100‑1 (MQ=255) CCTGATGGCGCTACGCCTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTc > 1:1514034‑M1/1‑100 (MQ=255) CTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCa > 2:863249‑M1/1‑100 (MQ=255) TGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAg > 1:1368850‑M1/1‑100 (MQ=255) TGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAg > 2:2445884‑M1/1‑100 (MQ=255) GATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAgg > 2:2233138‑M1/1‑100 (MQ=255) GATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGAACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGGGCCCCCGGCAAAATTTCAgg < 1:2276932‑M1/100‑1 (MQ=255) TGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCACGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCg < 1:1625636‑M1/100‑1 (MQ=255) TGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCg < 1:757130‑M1/100‑1 (MQ=255) gcTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCGTTTa < 2:1188785/100‑1 (MQ=255) gcTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAAGTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCGttt < 1:2149360/99‑1 (MQ=255) aCGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCGTTTATGa > 2:88785/1‑100 (MQ=255) aCGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCGTTTATGa > 2:366857/1‑100 (MQ=255) cGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCGTTTATGAg < 1:2007922/100‑1 (MQ=255) cGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCGTTTATGAg > 2:19558/1‑100 (MQ=255) cTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCGTTTATGAGTa < 1:1919803/100‑1 (MQ=255) cTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCGTTTATGAGTa < 2:2191115/100‑1 (MQ=255) tATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCGTTTATGAGTAtt < 1:1822593/100‑1 (MQ=255) atcaggcCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCGTTTATGAGTAttt < 2:768657‑M2/93‑1 (MQ=255) aggcCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCGTTTATGAGTATTTAAc > 1:1460446‑M2/5‑100 (MQ=255) ggcCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCGTTTATGAGTATTTAACg < 1:2293456‑M2/97‑1 (MQ=255) ggcCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCGTTTATGAGTATTTAACg < 1:988092‑M2/97‑1 (MQ=255) gcCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCGTTTATGAGTATTTAACgg < 2:644768‑M2/98‑1 (MQ=255) gCCTACAAATGCGCACAATTCATTGCAGTTGCGGGCTAATGTAGGCCGGGCCAGCGCAGCACCCCCGGCAAAAGCTCAGGCGTTTATGAATTTTTAACgg > 1:1701461/1‑100 (MQ=255) cCTACAAATTGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCTCCCGGCAAAATTTCAGGCGTTTATGAGTATTTAACgg < 1:2377021‑M2/98‑1 (MQ=255) cTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGTCAAGCGCAGCGCCCTCCGCAAAATTTCAGGCGTTTATGAGTATTTAACGgat < 2:1129667/100‑1 (MQ=255) | GGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCGTTTATGAGTATTTAACGGAT > NC_000913/1843651‑1843849 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |