| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1908216 = | 77 (0.840) | 12 (0.150) | 7/156 | NT | 15.3% | intergenic (‑625/+45) | yobF/yebO | DUF2527 family heat‑induced protein/putative inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | 1908248 = | 66 (0.820) | intergenic (‑657/+13) | yobF/yebO | DUF2527 family heat‑induced protein/putative inner membrane protein | |||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
TTTGAAGTCAGACCAGAGTTTTAATTTGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCGATTTTTGACTCTCAACGGTCTTTTTATCTGCTTTCTCTGGTT > NC_000913/1908149‑1908346 | agtcaaaaatcggttgaagacgaagatattattcgtctggtcgccgaacgataatccttcctcaatcTTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAg > 2:71657‑M1/68‑100 (MQ=255)agtcaaaaatcggttgaagacgaagatattattcgtctggtcgccgaacgataatccttcctcaatcTTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAg > 2:1126352‑M1/68‑100 (MQ=255) ttGAAGTCAGACCAGAGTTTTAATTTGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGa > 1:2039349/1‑100 (MQ=255) tcaaaaatcggttgaagacgaagatattattcgtctggtcgccgaacgataatccttcctcaatcTTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGAt > 2:1600839‑M1/66‑100 (MQ=255) tcaaaaatcggttgaagacgaagatattattcgtctggtcgccgaacgataatccttcctcaatcTTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGAt > 1:203216‑M1/66‑100 (MQ=255) tGAAGTCAGACCAGAGTTTTAATTTGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAatat < 2:620242/100‑1 (MQ=255) tGAAGTCAGACCAGAGTTTTAATTTGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGAt < 2:1030917/100‑1 (MQ=255) aGTCAGACCAGAGTTTTAATTTGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGa < 2:1012603/100‑1 (MQ=255) aGACCAGAGTTTTAATTTGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGaggaa > 2:977603/1‑100 (MQ=255) gACCAGAGTTTTAATTTGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGaggaag < 2:1520743/100‑1 (MQ=255) gACCAGAGTTTTAATTTGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGaggaag > 1:2298178/1‑100 (MQ=255) gACCAGAGTTTTAATTTGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGaggaag > 2:22606/1‑100 (MQ=255) ccAGAGTTTTAATTTGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGaggaagga > 1:1194181/1‑100 (MQ=255) cAGAGTTTTAATTTGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGAt > 2:1438644/1‑100 (MQ=255) gagTTTTAATTTGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTa < 2:248155/100‑1 (MQ=255) gagTTCTAATTTGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTa < 2:138645/100‑1 (MQ=255) ttttATTTTGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCg < 2:2102106/100‑1 (MQ=255) tttAATTTGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGt > 2:1473205/1‑100 (MQ=255) ttAATTTGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGtt > 2:1079169/1‑100 (MQ=255) aaTTTGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCg > 1:617211/1‑100 (MQ=255) aTTTGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCgg < 1:1684118/100‑1 (MQ=255) aTTTGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCgg > 2:1162264/1‑100 (MQ=255) ttGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCg < 2:249057/100‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATTATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGa < 1:1561955/100‑1 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGa > 2:2095157/1‑100 (MQ=255) gAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGAc < 1:2411746/100‑1 (MQ=255) gAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTAATCAAGATTGAGGAAGGAGTATCGTTCGGCg > 1:1767695/1‑98 (MQ=255) aGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCa > 1:911138/1‑100 (MQ=255) aGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCaccg < 2:911141/100‑4 (MQ=255) aGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGa < 1:2132944/99‑1 (MQ=255) gTTGCACCATGCCAGTGCGTATAATCAGGAAGAATCGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATGGAGGAATGAATATCGTTGGGCGACCAGa > 1:1472903/1‑98 (MQ=255) cgtccggtcaccgcacgataatgcttcctcaagcTTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAg > 1:2135181‑M1/35‑97 (MQ=255) tGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGaa > 1:2172407/1‑100 (MQ=255) tGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGaa < 2:1540504/100‑1 (MQ=255) gCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGaat > 1:838352/1‑100 (MQ=255) ctggtcgccgaacgataatccttcctcaatcttgagtaaccccgtcgttgaagggttactcaaGCTTGAGGAAGCATTATCGTGCGGTGACCGGACg > 1:2135181‑M2/64‑97 (MQ=255) cATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAataata < 2:168540/100‑1 (MQ=255) tGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATc > 2:1486524/1‑100 (MQ=255) tGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATc > 2:1336490/1‑100 (MQ=255) gACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCt > 2:1987081/1‑100 (MQ=255) aCAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCtt > 2:666025/1‑100 (MQ=255) aCAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCtt < 1:595586/100‑1 (MQ=255) cAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTc > 2:390809/1‑100 (MQ=255) aGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCg > 2:1156619/1‑100 (MQ=255) tGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTc < 1:390807/100‑1 (MQ=255) gTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTc < 1:1669285/100‑1 (MQ=255) taATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAAc > 2:130971/1‑100 (MQ=255) taATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAAc < 1:2420737/100‑1 (MQ=255) aaTCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAAcc > 2:800279/1‑100 (MQ=255) aTCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCg < 2:2078121/100‑1 (MQ=255) ggATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCGAttt > 2:1377916/1‑100 (MQ=255) gATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCGAtttt > 2:790986/1‑100 (MQ=255) aTGAATTGAGTAACCCTTCAACGCCGGGGTTACTCAAGATTGAGGATGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCGAtttt < 1:1012005/99‑1 (MQ=255) tGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGTAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCGATTTTTg < 1:2156578/100‑1 (MQ=255) tGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGTTTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCGATTTTTg < 2:866520/100‑1 (MQ=255) tGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCGATTTTTg < 2:1382630/100‑1 (MQ=255) gAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCGATTTTTGa > 2:693616/1‑100 (MQ=255) atcttgagtaaccccgtcgttgaagggttactcaaGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCGATTTTTGa > 2:1600839‑M2/36‑100 (MQ=255) atcttgagtaaccccgtcgttgaagggttactcaaGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCGATTTTTGa > 1:203216‑M2/36‑100 (MQ=255) aaTTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCGATTTTTGAc < 2:386093/100‑1 (MQ=255) aaTTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCGATTTTTGAc < 2:1211957/100‑1 (MQ=255) aaTTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGAAGAATAATATCTTCGACTTCAACCGATTTTTGa > 2:1687282/1‑99 (MQ=255) cttgagtaaccccgtcgttgaagggttactcaaGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCGATTTTTGAct > 2:1126352‑M2/34‑100 (MQ=255) cttgagtaaccccgtcgttgaagggttactcaaGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCGATTTTTGAct > 2:71657‑M2/34‑100 (MQ=255) aTTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCGATTTTTGAct > 2:1288013/1‑100 (MQ=255) ttgagtaaccccgtcgttgaagggttactcaaGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCGATTTTTGTct > 1:1859356‑M2/33‑99 (MQ=255) ttgagtaaccccgtcgttgaagggttactcaaGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCGATTTTTGActc > 1:1578907‑M2/33‑100 (MQ=255) ttGATTAACACTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGTAAGGAATATCGTTCGCCGACCAGACTAATAATATCTTATTCTTCAACCGATTTTTGAc < 1:721544/98‑1 (MQ=255) TTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCGATTTTTGActc > 1:277386‑M1/1‑100 (MQ=255) tgagtaaccccgtcgttgaagggttactcaaGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCGATTTTTGActct > 2:684155‑M2/32‑100 (MQ=255) tgagtaaccccgtcgatgaagggttactcaaGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATAACTTCGTCTTCAACCGATTTTTGAcact > 1:1404229‑M2/32‑100 (MQ=255) TGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCGATTTTTGActct < 2:50150‑M1/100‑1 (MQ=255) 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2:81855/100‑1 (MQ=255) aaCGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCGATTTTTGACTCTCAACGGTCtttta > 1:568448/1‑99 (MQ=255) acgacgGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCGATTTTTGACTCTCAACGGTCTTTTTa < 1:2594140/100‑1 (MQ=255) cgacgGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCGATTTTTGACTCTCAACGGTCTTTTTAt < 2:1852275/100‑1 (MQ=255) cgacgGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCGATTTTTGACTCTCAACGGTCTTTTTAt > 1:1164683/1‑100 (MQ=255) gacgGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCGATTTTTGACTCTCAACGGTCTTTTTATc > 2:1525361/1‑100 (MQ=255) ggggTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCGATTTTTGACTCTCAACGGTCTTTTTATCTGc < 2:877452/100‑1 (MQ=255) ttactcaaGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCTTCAACCGATTTTTGACTCTCAACGGTCTTTTTATCTGCTTtc < 1:169813‑M2/92‑1 (MQ=255) 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NC_000913/1908149‑1908346 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |