| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3620350 | NA (NA) | 13 (0.150) | 8/166 | NT | 100% | coding (1159/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 3620425 | 0 (0.000) | coding (1234/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
CCGCATCACCATCACCGACAGCCTGGACCGCCGTGAAGTGCTGCACACGCAGGGCGAAGCCGGGCTGAAGCGGGTGGTGAAAAAGGAACACGCGGACGGCAGCGTCACGCAGAGTCAGTTTGACGCCGTGGGCAGGCTCAGGGCACAGACGGATGCCGCAGGCAGGACAACAGAGTACA > NC_000913/3620346‑3620524 | ncgCATCACCATCACCGACAGCCTGGACCGCCGTGAAGTGCTGCACACGCAGGGCGAAGCCGGGCTGAAGCGGGTGGTGAtgcggtctttctcatactga < 1:1897001‑M2/99‑21 (MQ=255)ccGCATCACCATCACCGACAGCCTGGACCGCCGTGAAGTGCTGCACACGCAGTGCGAAGCCGGGCTGAAGCGGGTGGTGAggcggtctttctcatagtga < 1:2015752‑M2/100‑21 (MQ=255)ccGCATCACCATCACCGACAGCCTGGACCGCCGTGAAGTGCTGCACACGCAGGGCGAAGCCGGGCTGAAGCGGGTGGTGAtgcggtctttctcatactga < 1:638705‑M2/100‑21 (MQ=255) gCATCACCATCACCGACAGCCTGGACCGCCGTGAAGTGCTGCACACGCAGGGCGAAGCCGGGCTGAAGCGGGTGGTGAtgcggtctttctcatactgata < 2:342580‑M2/100‑23 (MQ=255) catcaccatcacCGACAGCCTGGACCGCCGTGAAGTGCTGCACACGCAGGGCGAAGCCGGGCTGAAGCGGGTGGTGAtgcggtctttctcatactgatac < 2:2091674‑M2/100‑24 (MQ=255) tcaccatcaccGACAGCCTGGACCGCCGTGAAGTGCTGCACACGCAGGGCGAAGCCGGGCTGAAGCGGGTGGTGAtgcggtctttctcatactgatacgt < 1:24395‑M2/100‑26 (MQ=255) ccGACAGCCTGGACCGCCGTGAAGTGCTGCACACGCAGGGCGAAGCCGGGCTGTCGGTGATGGTGAtgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaa < 2:1929576‑M2/100‑35 (MQ=255) ccGACAGCCTGGACCGCCGTGAAGTGCTGCACACGCAGGGCGAAGCCGGGCTGTCGGTGATGGTGAtgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaa < 2:1565871‑M2/100‑35 (MQ=255) gACAGCCTGGACCGCCGTGAAGTGCTGCACACGCAGGGCGAAGCCGGGCTGTCGGTGCTGGTGAtgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagc < 1:1541422‑M2/100‑37 (MQ=255) gACAGCCTGGACCGCCGTGAAGTGCTGCACACGCAGGGCGAAGCCGGGCTGTCGGTGATGGTGAtgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagc < 2:1564409‑M2/100‑37 (MQ=255) gACAGCCTGGACCGCCGTGAAGTGCTGCACACGCAGGGCGAAGCCGGGCTGTCGGTGATGGTGAtgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagc < 1:131268‑M2/100‑37 (MQ=255) gCCTGGACCGCCGTGAAGTGCTGCACACGCAGGGCGAAGCCGGGCTGAAGCGGGTGGTGAtgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgc < 2:2467825‑M2/100‑41 (MQ=255) cgTGAAGTGCTGCACACGCAGGGCGAAGCCGGGCTGTCGGTGATGGTGAtgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggttta > 1:1324256‑M2/1‑49 (MQ=255) tggtgAtgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttc < 2:1977186‑M2/100‑95 (MQ=255) tggtgAtgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttc < 1:660183‑M2/100‑95 (MQ=255) tggtgAtgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttc < 1:759161‑M2/100‑95 (MQ=255) tggtgAtgcggtctttctcatactgatacgtctagcttaatcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggctttc < 1:660090‑M2/100‑95 (MQ=255) ggtgAtgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttcc < 2:1419307‑M2/100‑96 (MQ=255) gtgAtgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccg > 1:342832‑M2/1‑4 (MQ=255) gtgAtgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccg < 1:1366472‑M2/100‑97 (MQ=255) gtgAtgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccg > 1:1641099‑M2/1‑4 (MQ=255) gtgAtgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccg > 1:1961239‑M2/1‑4 (MQ=255) gtgAtgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccg > 1:97486‑M2/1‑4 (MQ=255) gtgAtgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccg < 1:2038381‑M2/100‑97 (MQ=255) gtgAtgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccg > 1:2058427‑M2/1‑4 (MQ=255) gtgAtgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttcc < 1:2199253‑M2/99‑96 (MQ=255) gtgAtgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttcc > 1:2442648‑M2/1‑4 (MQ=255) tgAtgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccgg < 1:963008‑M2/100‑98 (MQ=255) tgAtgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccgg < 1:38043‑M2/100‑98 (MQ=255) tgAtgcggtctctctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccg > 1:594910‑M2/1‑3 (MQ=255) gAtgcgggctttctcatgctgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttgggtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggc > 1:27927‑M2/1‑2 (MQ=255) atgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggcc > 1:669380‑M2/1‑1 (MQ=255) atgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggcc > 2:641900‑M2/1‑1 (MQ=255) | CCGCATCACCATCACCGACAGCCTGGACCGCCGTGAAGTGCTGCACACGCAGGGCGAAGCCGGGCTGAAGCGGGTGGTGAAAAAGGAACACGCGGACGGCAGCGTCACGCAGAGTCAGTTTGACGCCGTGGGCAGGCTCAGGGCACAGACGGATGCCGCAGGCAGGACAACAGAGTACA > NC_000913/3620346‑3620524 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |