| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,148,639 | A→G | 59.1% | Y340C (TAC→TGC) | plsX → | putative phosphate acyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,148,639 | 0 | A | G | 59.1% | 52.7 / 103.1 | 93 | Y340C (TAC→TGC) | plsX | putative phosphate acyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (21/17); new base G (36/19); total (57/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.88e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.90e-01 | |||||||||||
GCCAATCAGCGAGCTTTTGCGGTCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGAACTCGCAGTTTGCAAGTGACGGTATATAA > NC_000913/1148542‑1148737 | gCCAATCAGCGAGCTTTTGCGGTCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATAcc < 2:708262/100‑1 (MQ=255)gCCAATCAGCGAGCTTTTGCGGTCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATAcc > 1:2037133/1‑100 (MQ=255) cAATCAGCGAGCTTTTGCGGTCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCa > 1:389169/1‑100 (MQ=255) cAATCAGCGAGCTTTTGCGGTCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCa > 2:616422/1‑100 (MQ=255) cAATCAGCGAGCTTTTGCGGTCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCa > 2:2259808/1‑100 (MQ=255) tCAGCGAGCTTTTGCGGTCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCCGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGc < 1:1289319/99‑1 (MQ=255) gatctaGCTTTTGCGGTCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTg < 1:1056969/95‑1 (MQ=255) cAGCGAGCTTTTGCGGTCGCGATTGAACGGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCGCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAAGCTGTATGCCCAGCt < 1:520415/99‑1 (MQ=255) cAGCGAGCTTTTGCGGTCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTg > 2:1909467/1‑100 (MQ=255) gCGAGCTTTTGCGGTCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGt > 1:1829271/1‑100 (MQ=255) gCGAGCTTTTGCGGTCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGt > 2:1361874/1‑100 (MQ=255) cGAGCTTTTGCGGTCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGt > 1:1011059/1‑99 (MQ=255) cGAGCTTTTGCGGACGAGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGTGTCTGTATACCCAGCTGttt > 1:2425683/1‑100 (MQ=255) aGCTTTTGCGGTCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGtttt < 2:389171/100‑1 (MQ=255) aGCTTTTGCGGTCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGtttt < 2:425052/100‑1 (MQ=255) aGCTTTTGCGGTCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTgagatc > 2:1056973/1‑95 (MQ=255) gCTTTTGCGGTCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTg < 1:1138815/100‑1 (MQ=255) gCTTTTGCGGTCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTg < 1:1840199/100‑1 (MQ=255) cTTTTGCGGTCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGcgtttcgtc > 1:2572440/1‑91 (MQ=255) tttGCGGTCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAgc > 2:2497557/1‑100 (MQ=255) tttGCGGTCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAgc < 2:1391421/100‑1 (MQ=255) ttGCGGTCGCGATTGAACAGGCCGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAgct > 1:1503710/1‑100 (MQ=255) gCGGTCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAgctgc < 2:182566/100‑1 (MQ=255) cGGTCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAgctgct < 2:1012844/100‑1 (MQ=255) ggTCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAgctgct > 1:1129848/1‑99 (MQ=255) ggTCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGctgctg > 2:639200/1‑100 (MQ=255) ggTCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAGctgctg < 2:1227805/100‑1 (MQ=255) gTCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTgg > 1:2215797/1‑100 (MQ=255) tCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGa > 2:802745/1‑100 (MQ=255) tCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGa < 2:856695/100‑1 (MQ=255) gcgATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACg > 1:1881128/1‑100 (MQ=255) gcgATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCGGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACg < 1:1602111/100‑1 (MQ=255) cgATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTGAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACgg > 1:1410071/1‑100 (MQ=255) cgATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACgg < 1:2401753/100‑1 (MQ=255) ttGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTgg < 2:1694283/100‑1 (MQ=255) ttGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTgg < 1:1514720/100‑1 (MQ=255) tGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGc > 1:1213240/1‑100 (MQ=255) tGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGc < 1:855767/100‑1 (MQ=255) gAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCa > 2:2508231/1‑100 (MQ=255) gAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCa > 1:1936993/1‑100 (MQ=255) gAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTGCCTCAGCGAATTGCCGCGCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCa > 1:2508051/1‑100 (MQ=255) aaCAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCa < 1:757905/99‑1 (MQ=255) ggCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGc > 2:1000513/1‑100 (MQ=255) ggCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGc > 1:2006353/1‑100 (MQ=255) ctaGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCg < 1:1329228/98‑1 (MQ=255) cAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCgg > 1:882962/1‑100 (MQ=255) aGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCgag > 2:1329235/1‑98 (MQ=255) tGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAAc < 2:630481/100‑1 (MQ=255) ggCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTg > 2:2222164/1‑100 (MQ=255) gCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGc < 1:807603/100‑1 (MQ=255) tccgatctgACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCgg < 2:1376265/92‑1 (MQ=255) ggTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCgg < 1:745528/100‑1 (MQ=255) ggTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCgg < 2:2378521/100‑1 (MQ=255) gTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCgg < 2:1410079/99‑1 (MQ=255) tGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGt > 1:1954909/1‑99 (MQ=255) tGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTa > 1:2412872/1‑100 (MQ=255) aGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCa < 1:1685190/100‑1 (MQ=255) gCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAg < 1:1259635/100‑1 (MQ=255) cGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAgg > 2:2179190/1‑100 (MQ=255) gACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGa > 2:2071740/1‑100 (MQ=255) gACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCGGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCggagatcgga > 1:1376257/1‑92 (MQ=255) cAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACg > 2:164202/1‑100 (MQ=255) gTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGACCCGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTg > 1:1602824/1‑100 (MQ=255) tCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGcc > 2:1044143/1‑100 (MQ=255) cTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAg > 1:1844856/1‑100 (MQ=255) cTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAg > 2:2360976/1‑100 (MQ=255) tCAGCGAATTGCCGCTCGGCTGGAATCTGGATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACACTGcc < 1:329713/97‑1 (MQ=255) tCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAAATCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGc > 1:2442533/1‑100 (MQ=255) aGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGa > 2:1402023/1‑100 (MQ=255) aGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGa > 2:129203/1‑100 (MQ=255) aGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGa > 2:964014/1‑100 (MQ=255) gCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGaa > 1:2395655/1‑100 (MQ=255) gCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTACCAGCGaa > 1:2367388/1‑100 (MQ=255) gAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGAACt < 2:213757/100‑1 (MQ=255) gAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGAACt > 2:2532171/1‑100 (MQ=255) aTTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGAACTCg < 2:2215812/100‑1 (MQ=255) ttGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGAACTCGc < 2:1552954/100‑1 (MQ=255) ttGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGAACTCGc < 1:724854/100‑1 (MQ=255) gCCGCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGAACTCGCAg > 1:992208/1‑100 (MQ=255) gCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGAACTCGCAg > 1:440662/1‑100 (MQ=255) cGCTCGCCTTGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGAACTCGCAGtt < 2:2584070/100‑1 (MQ=255) cGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGAACTCGCAGtt > 2:1691818/1‑100 (MQ=255) gCTCGCCTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGAACTCGCAGttt > 1:2230886/1‑100 (MQ=255) gCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGAACTCGCAGttt > 2:455395/1‑100 (MQ=255) cTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGAACTCGCAGTTTg < 2:497783/100‑1 (MQ=255) cGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGAACTCGCAGTTTGc < 2:577788/99‑1 (MQ=255) cGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGAACTCGCAGTTTGCa > 2:1734354/1‑100 (MQ=255) ccTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGAACTCGCAGTTTGCAAg > 1:2474739/1‑100 (MQ=255) cTGGAATCTGTATGCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGAACTCGCAGTTTGCAAGt > 2:2005251/1‑100 (MQ=255) ggAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGAACTCGCAGTTTGCAAGTGa > 2:1465095/1‑100 (MQ=255) ggAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGAACTCGCAGTTTGCAAGTGa > 2:637369/1‑100 (MQ=255) aTCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGAACTCGCAGTTTGCAAGTGACgg > 2:8221/1‑100 (MQ=255) cTGTATACCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGAACTCGCAGTTTGCAAGTGACGGta > 1:569123/1‑100 (MQ=255) ataCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGAACTCGCAGTTTGCAAGTGACGGtatata < 2:225294/100‑1 (MQ=255) taCCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGAACTCGCAGTTTGCAAGTGACGGTATATaa > 2:611421/1‑100 (MQ=255) | GCCAATCAGCGAGCTTTTGCGGTCGCGATTGAACAGGCAGTGCAGGCGGTGCAGCGACAAGTTCCTCAGCGAATTGCCGCTCGCCTGGAATCTGTATACCCAGCTGGTTTTGAGCTGCTGGACGGTGGCAAAAGCGGAACTCTGCGGTAGCAGGACGCTGCCAGCGAACTCGCAGTTTGCAAGTGACGGTATATAA > NC_000913/1148542‑1148737 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |