| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,346,794 | A→G | 69.5% | intergenic (‑52/‑2) | gmr ← / → ymiB | cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase; csgD regulator; modulator of RNase II stability/uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,346,794 | 0 | A | G | 69.5% | 130.4 / 69.9 | 98 | intergenic (‑52/‑2) | gmr/ymiB | cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase; csgD regulator; modulator of RNase II stability/uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (20/10); new base G (35/33); total (55/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.90e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 | |||||||||||
TCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGA > NC_000913/1346698‑1346889 | tCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCAt > 1:613367/1‑100 (MQ=255)tCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCAt > 1:610049/1‑100 (MQ=255)tCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCAt > 1:2048107/1‑100 (MQ=255) cGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGa > 1:426106/1‑100 (MQ=255) cGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTACCTAACGGTTTTCATGATGCATATCATCAGGTTAACAGCGGAGTCAGCGGTTAAATAAAAAGAACAGCATGa > 1:767652/1‑100 (MQ=255) cGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACGCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGa < 2:68461/100‑1 (MQ=255) gagaAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGAc < 1:2043600/100‑1 (MQ=255) gagaAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGAc < 2:1504497/100‑1 (MQ=255) agaAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGCTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACt > 1:306498/1‑100 (MQ=255) aaaGTTGTATAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGACTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTa < 1:1647998/100‑1 (MQ=255) aaaGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTa < 2:2022591/100‑1 (MQ=255) aaGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTAc > 1:225959/1‑100 (MQ=255) aGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACa < 1:1336577/100‑1 (MQ=255) aGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACa < 1:1446587/100‑1 (MQ=255) aGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTGTCATGATGCATATCATCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACa < 1:2374616/100‑1 (MQ=255) gTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACAt > 2:2072120/1‑100 (MQ=255) gTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACAt < 1:200389/100‑1 (MQ=255) gTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACAt > 1:776145/1‑100 (MQ=255) aCAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAAt > 1:391050/1‑100 (MQ=255) aCAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAAt < 2:426108/100‑1 (MQ=255) aCAACGCTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAACGGAACAGCATGACTTACATGaa > 1:208805/1‑98 (MQ=255) cAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAAt > 1:2268568/1‑99 (MQ=255) cAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATACATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAAtt > 1:163535/1‑100 (MQ=255) aCGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTaa > 2:1969670/1‑100 (MQ=255) gTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAAcg > 2:15274/1‑100 (MQ=255) ttGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAAcgg > 2:458089/1‑100 (MQ=255) tgtgGTCTCCCTAACGATTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCAGTTAAATAAGAGGAACAGCATGACTTACATGAAAt < 1:2582162/93‑1 (MQ=255) tgtgGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAAcggc < 2:1976596/100‑1 (MQ=255) gtgGACTCCCTCACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTAAGTGAACTTACcggc > 1:486450/1‑99 (MQ=255) gtgGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAAcggcg < 2:1875468/100‑1 (MQ=255) tgGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAAcggcgg < 2:1761925/100‑1 (MQ=255) tagACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAAcggcgg > 2:1753992/3‑100 (MQ=255) cTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTaa > 2:971281/1‑100 (MQ=255) tCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTaaa > 2:436336/1‑100 (MQ=255) cccTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAAc > 2:158701/1‑100 (MQ=255) cccTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAAc > 1:2466975/1‑100 (MQ=255) cccTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAAc > 2:1997694/1‑100 (MQ=255) ccTAACGGTTTTCATGATGCCTATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACg > 2:2439015/1‑100 (MQ=255) cTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGc > 1:1366090/1‑100 (MQ=255) cTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGc > 1:44065/1‑100 (MQ=255) tttCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGtttt > 1:2523600/1‑100 (MQ=255) tCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGtttttt > 2:1406209/1‑100 (MQ=255) tCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACGTGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGtttttt > 2:324350/1‑100 (MQ=255) cATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGttttttt < 2:2349077/100‑1 (MQ=255) cATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCAGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGttttttt < 1:2370338/100‑1 (MQ=255) atgatgCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGtttttttt < 2:1850046/100‑1 (MQ=255) tgatgCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTta < 1:1010935/100‑1 (MQ=255) tgatgCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTta < 2:865083/100‑1 (MQ=255) tgatgCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTta > 1:2234175/1‑100 (MQ=255) taatgCATATCCTCCGGTTAACAGCGTAGTCCGAGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGAGGCTAAACGCATTGTTTTTTTta < 1:1242708/98‑1 (MQ=255) gatgCATGGTCTCCGGTTAAAAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATAACTTACATGTAATTAACGGAGACTAAACGCATTGTTTTTTTta < 1:1703866/99‑1 (MQ=255) gatgCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTtat < 1:967457/100‑1 (MQ=255) atgCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTtat > 1:1766072/1‑99 (MQ=255) tgCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTtatat > 2:802736/1‑100 (MQ=255) tatCCTCCGGTTAACAGTGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATAtattt > 1:1007175/1‑100 (MQ=255) tatCCTCAGGTAAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTACCGGAGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATAtattt > 1:1362609/1‑100 (MQ=255) tccttttatttAACCGCGGACTCCGCTGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTACACGCATTGTTTTTTTTATCtattt > 1:1111918/10‑99 (MQ=25) atCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATAtattta < 2:758783/100‑1 (MQ=255) tcctccGGTTAACAGCGGAGGCCGCGGTTAAATAAAAGGACCAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTTATtattta > 1:1226703/1‑99 (MQ=255) ctccGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATatttattt > 2:1381145/1‑100 (MQ=255) tccGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTg < 2:859338/100‑1 (MQ=255) tccGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTg < 2:486107/100‑1 (MQ=255) tccGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTg < 2:412227/100‑1 (MQ=255) tccGGTTAACAGCGGAGTCCGCAGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTg < 1:209808/100‑1 (MQ=255) ccGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGt > 2:741103/1‑100 (MQ=255) caggTTAACAGCGGAGTCCGCGTTTAAATAAAAGGAACAGCATGTCTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTg < 1:2252127/97‑1 (MQ=255) cGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTa > 1:1342455/1‑100 (MQ=255) ggTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTaa > 1:831143/1‑100 (MQ=255) ttAATAGCGGAGTCTGAGGTTAAATAAAAGGAATAGCATGATTTATATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGt < 1:113232/96‑1 (MQ=255) aaCAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATc > 1:1183012/1‑98 (MQ=255) aCAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAg < 2:2247843/100‑1 (MQ=255) aCAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAACCGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAg > 2:2467732/1‑100 (MQ=255) cAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGt > 1:1975892/1‑100 (MQ=255) cAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGt > 2:1759369/1‑100 (MQ=255) aaGCGGAGACGGCGGATAAGTAAAAGGAACAACATGGCTTGCATGAAATTAACGGCGGCCAAACGCACTGTTTATTTATTATAATTTTTAGTAATc > 1:2488583/2‑96 (MQ=255) gCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGttt > 1:753770/1‑100 (MQ=255) gCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGttt < 2:893039/100‑1 (MQ=255) cGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGtttt < 2:613370/100‑1 (MQ=255) cGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGtttt < 2:610052/100‑1 (MQ=255) aGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAATGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTg < 1:1451773/98‑1 (MQ=255) ccGCGGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGaaaa < 2:683921/100‑1 (MQ=255) cgcgGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGaaaaa > 2:760505/1‑100 (MQ=255) cgGTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACg < 1:2072106/100‑1 (MQ=255) gTTAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGcc < 2:2122190/100‑1 (MQ=255) ttAAATAAAAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCa < 2:1161523/100‑1 (MQ=255) taaataaaAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAg < 2:1586547/100‑1 (MQ=255) aataaaAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTTTTTTTTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAATAACGCCAGtt > 1:1478002/1‑100 (MQ=255) aataaaAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGtt > 1:1184706/1‑100 (MQ=255) aataaaAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGtt > 1:1189818/1‑100 (MQ=255) ataaaAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGttt > 1:2308922/1‑100 (MQ=255) ataaaAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGttt > 2:2204576/1‑100 (MQ=255) taaaAGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGtttt < 2:2048119/100‑1 (MQ=255) aaaaGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTc < 1:1969659/100‑1 (MQ=255) aaaaGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTc > 1:2317905/1‑100 (MQ=255) aaaGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGGATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGTAAAATCGCCAGTTTTc > 1:763219/1‑99 (MQ=255) aaaGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCa > 2:1160382/1‑100 (MQ=255) aGGAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCaaa < 2:1086304/100‑1 (MQ=255) ggAACAGCATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAAc < 2:1043834/100‑1 (MQ=255) aacagcATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGGCAGTTTTTAATCGa > 1:1761163/1‑100 (MQ=255) | TCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACAACATGACTTACATGAAATTAACGGCGGCTAAACGCATTGTTTTTTTTATATATTTATTTGTAATCCAGTTTTGGAAAAACGCCAGTTTTCAAACGA > NC_000913/1346698‑1346889 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |