| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,784,169 | G→A | 21.7% | G380D (GGT→GAT) | fadK → | short chain acyl‑CoA synthetase, anaerobic |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,784,169 | 0 | G | A | 21.7% | 167.4 / 38.5 | 87 | G380D (GGT→GAT) | fadK | short chain acyl‑CoA synthetase, anaerobic |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/33); new base A (9/10); total (44/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.00e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.13e-01 | |||||||||||
TCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTA > NC_000913/1784070‑1784268 | tcGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAgg < 1:1976790/100‑1 (MQ=255) tgatCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGc > 2:1671005/1‑100 (MQ=255) tgatCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGATTGc < 2:2494173/100‑1 (MQ=255) tgatCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGATTGc < 1:1716061/100‑1 (MQ=255) ccTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAg < 2:1872205/100‑1 (MQ=255) cTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAgg < 1:74732/100‑1 (MQ=255) tgtGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGt < 1:1574407/98‑1 (MQ=255) ttGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACTCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTg < 1:577678/100‑1 (MQ=255) ttGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTg < 1:8795/100‑1 (MQ=255) ttGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTg > 1:167057/1‑100 (MQ=255) cgcgCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGCTTAAAGTGGTCGATGACGCACGCACGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTgaa > 1:1956909/1‑98 (MQ=255) gcTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGc > 1:545422/1‑100 (MQ=255) cTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGATTGCGAAGGTGAAGAAGcc < 2:1096257/100‑1 (MQ=255) ttATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTc > 1:1577806/1‑100 (MQ=255) tGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTcgcg > 1:2277713/1‑100 (MQ=255) cacaCCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTg > 2:2402171/1‑100 (MQ=255) acacCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGACGAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGATTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTg < 2:1173557/99‑1 (MQ=255) acCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGcc < 2:1430208/100‑1 (MQ=255) ccGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGccc < 2:2413265/100‑1 (MQ=255) cGATGGTTCCGCTGCCGCAGGTGTAGGGATTTAAGTGGTCGATGACGCACGTAAGAGCTTGCCGCCAGGTTGCGGAGGTGATGAAGCCTCGCGGGGcc < 1:70134/98‑1 (MQ=255) gATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTTGTCGATGATGTACGCAAGAGCTTACCGCCAGGGTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGcct < 1:1326113/98‑2 (MQ=255) tGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAAt > 1:567273/1‑100 (MQ=255) tGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAAt < 1:557015/100‑1 (MQ=255) tGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAAt > 2:569134/1‑100 (MQ=255) gggtACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGATTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAAtg < 1:252237/97‑1 (MQ=255) gTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGCTTAAAGTGGGCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAACATCAAGTGGCCCCAAtgt > 1:1722180/1‑100 (MQ=255) ttACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAAtgtg < 1:2046290/100‑1 (MQ=255) ttACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAAtgtg > 2:209773/1‑100 (MQ=255) cGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGATTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGttt > 1:1979392/1‑100 (MQ=255) cGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGATTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGttt > 2:1480748/1‑100 (MQ=255) gCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTa < 1:1366714/100‑1 (MQ=255) gCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCATGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATgg < 2:1900582/100‑1 (MQ=255) gCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATgg < 2:2093288/100‑1 (MQ=255) gCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATgg > 1:398478/1‑100 (MQ=255) gCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATg < 2:2404167/99‑1 (MQ=255) ccGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATggg < 2:413415/100‑1 (MQ=255) ccGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCGCGCGTGGCCCCAATGTGTATATggg > 1:1948170/1‑100 (MQ=255) ctttccagtAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATgggg < 1:1140473/93‑1 (MQ=255) cGCAGGTGTAGAAAACAGAGCTGTCCATATCACACGCAAAACACTACCGCCAGGTTGCGAAGGTCAAAAAACCACGCGTGGCCCCAACGTGTATATgtg > 1:1057493/1‑97 (MQ=255) gCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATgggg < 1:66160/99‑1 (MQ=255) gCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGAGTTTATgggg > 1:289510/1‑99 (MQ=255) ggTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTAtt > 1:1893885/1‑100 (MQ=255) gtgtAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTAttt < 2:2223291/100‑1 (MQ=255) tgtAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTAtttt < 1:1174467/100‑1 (MQ=255) tgtAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTAtttt > 1:835742/1‑100 (MQ=255) tAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTtga > 2:2344746/1‑100 (MQ=255) tAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTtga < 2:786667/100‑1 (MQ=255) agagATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTtgat > 2:1695245/1‑100 (MQ=255) agagATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTtgat < 2:1689262/100‑1 (MQ=255) agagATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTtgat > 2:1371909/1‑100 (MQ=255) agagATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGATTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTtgat > 2:1606420/1‑100 (MQ=255) gagaTTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGATTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTtgatg < 2:1069917/100‑1 (MQ=255) gaTTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGATTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGaa > 2:2186632/1‑100 (MQ=255) ttAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAAcc > 2:2397127/1‑100 (MQ=255) aaaGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGGGGTTATGGGGTATTTTGATGAACCTg > 2:647838/1‑100 (MQ=255) aaGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTATATGGGGTATTTTGATGAAACTGa > 1:2096230/1‑100 (MQ=255) aGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGATTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGaa < 1:1518742/100‑1 (MQ=255) gTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAAt < 1:1352886/100‑1 (MQ=255) gTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGATTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAAt > 2:1960201/1‑100 (MQ=255) ggTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTa < 2:1174908/100‑1 (MQ=255) ggTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTa < 2:127483/100‑1 (MQ=255) ggTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGATTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTa < 1:379619/100‑1 (MQ=255) gTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGATTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTaa > 2:373562/1‑100 (MQ=255) tCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAAc > 2:1380015/1‑100 (MQ=255) tCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAAc < 1:1538042/100‑1 (MQ=255) cGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAAcc > 2:2230717/1‑100 (MQ=255) gATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCg > 1:1762584/1‑100 (MQ=255) gATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCg > 1:399186/1‑100 (MQ=255) aTGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCTTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAAGTaa > 1:551907/1‑96 (MQ=255) acgcacgcAAGACCTTACCGCCAGATTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCg > 1:535401/1‑100 (MQ=255) cgcacgcaAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGt < 1:555993/100‑1 (MQ=255) gcacgcaAGACCTTACCGCCAGGTTGCGTAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGt < 1:542983/99‑1 (MQ=255) cgcaAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGccc > 2:28416/1‑100 (MQ=255) caAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTg < 2:1622433/100‑1 (MQ=255) caAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTg > 2:158363/1‑100 (MQ=255) aaGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTgg < 2:1762593/100‑1 (MQ=255) gACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGAt < 1:2402156/100‑1 (MQ=255) aCCTTACCGCCAGATTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATg < 1:1865832/100‑1 (MQ=255) cTTACCGCCAGATTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATgaa < 1:1878939/100‑1 (MQ=255) ttACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATgaag < 2:1930674/100‑1 (MQ=255) cccccAGATTGCGAAGGTGAAGATGCCGCGCGTGGCCCCCATGCGTATATGGGGTCTTTTGATGAACCGGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATgaaaacg > 1:808660/4‑96 (MQ=255) ccGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGaagaag > 2:1075044/1‑100 (MQ=255) ccGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCATGGATGaagaag > 1:2266023/1‑100 (MQ=255) ccGCCAGATTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGaagaag > 1:2209197/1‑100 (MQ=255) gCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGc > 1:923727/1‑100 (MQ=255) gCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGc > 1:1077362/1‑100 (MQ=255) cAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTg > 2:2265472/1‑100 (MQ=255) aGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTgg < 2:2531753/100‑1 (MQ=255) gTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTa < 1:1380007/100‑1 (MQ=255) gTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTa < 1:1348673/100‑1 (MQ=255) gTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTa < 2:632137/100‑1 (MQ=255) | TCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTA > NC_000913/1784070‑1784268 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |