| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,904,595 | T→G | 17.1% | I234S (ATT→AGT) | manZ → | mannose‑specific enzyme IID component of PTS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,904,595 | 0 | T | G | 17.1% | 253.7 / 45.0 | 104 | I234S (ATT→AGT) | manZ | mannose‑specific enzyme IID component of PTS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (44/42); new base G (7/11); total (51/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.39e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
GGGCATTGGTTAACAAGTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGATCATCGTTG > NC_000913/1904496‑1904693 | gggCATTGGTTAACAAGTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTAt > 1:843108/1‑100 (MQ=255) ggCATTGGTTAACAAGTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTAtt > 1:2047392/1‑100 (MQ=255) cATTGGTTAACAAGTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCt > 1:579786/1‑100 (MQ=255) ggTTAACAAGTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGAc < 2:860777/100‑1 (MQ=255) ttAACGAGTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGAATAGTCTGGAcag < 1:448882/100‑3 (MQ=255) ttAACAAGTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCa > 2:2196377/1‑100 (MQ=255) ttAACAAGTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGAATAGTCTGGAcag < 2:362724/100‑3 (MQ=255) ttAACAAGTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGAATAGTCTGGAcag < 1:1840384/100‑3 (MQ=255) ttAACAAGTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGAATAGTCTGGAcag < 2:33355/100‑3 (MQ=255) ttAACAAGTGGAAACAGGTCAACATCCCGCTGGTAGTCTCTCGCATTACTGACCAGACCGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGAATAGTCTGGAcag < 1:2284732/100‑3 (MQ=255) tgaaCAAGTGGACACATGTCAACAGCCCGCTAGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAAGACGTTACTACT‑TGCCAGAATAGTCTGGAcag < 1:233356/98‑3 (MQ=255) tAACAAGTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAg < 2:1975267/100‑1 (MQ=255) aCAAGTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGtt < 1:153075/100‑1 (MQ=255) aCAAGTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGtt > 1:735986/1‑100 (MQ=255) aCAAGTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGAATAGTCTGGAcagtag < 2:614586/100‑6 (MQ=255) aCAAGTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGAATAGTCTGGAcagtag < 1:1423377/100‑6 (MQ=255) cAAGTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTa < 1:2333986/100‑1 (MQ=255) cAAGTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTa > 1:1443442/1‑100 (MQ=255) cAAGTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATGCTGGACCAGTTa > 1:381725/1‑100 (MQ=255) aGTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAAt < 2:371353/100‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATg < 2:2385329/100‑1 (MQ=255) gTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATg < 1:731732/100‑1 (MQ=255) atGGACATATGGCAGCATCCCTCTGTTTCTCTCGCGCATTACTGACCATACGGTCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGAATAGTCTGGAcagtagta < 1:2093492/97‑8 (MQ=19) tGGACACCTGTCACCATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCATACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGc < 1:51310/100‑1 (MQ=255) ggACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACTGGTCCAGAATAGTCTGGAcagtagtaacg < 1:2285878/100‑11 (MQ=25) ggACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGcc > 1:444398/1‑100 (MQ=255) ggACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGcc > 2:178347/1‑100 (MQ=255) gACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCa > 1:606477/1‑100 (MQ=255) acacATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAg > 2:1914731/1‑100 (MQ=255) acacATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAg < 1:178346/100‑1 (MQ=255) cAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTa < 2:2002576/100‑1 (MQ=255) cAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTa > 1:2141230/1‑100 (MQ=255) cAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTa > 2:2589931/1‑100 (MQ=255) ccGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCActgc > 2:732505/1‑100 (MQ=255) cGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCActgc < 1:1611199/99‑1 (MQ=255) cTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTGTTCTGGGCCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCActgctgc < 1:1464716/100‑1 (MQ=255) cTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCActgctgc < 1:1777731/100‑1 (MQ=255) tGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCActgctgct > 1:2212839/1‑100 (MQ=255) ggTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCActgctgctg < 2:1443450/100‑1 (MQ=255) gTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGATCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGa < 2:896013/100‑1 (MQ=255) gTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGa > 2:1588320/1‑100 (MQ=255) tGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGAcc < 2:1023423/100‑1 (MQ=255) tGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGAcc < 1:95100/100‑1 (MQ=255) gTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCt < 2:1483373/100‑1 (MQ=255) ctctcGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCttt > 2:2494961/1‑100 (MQ=255) tctcGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTg < 2:681288/100‑1 (MQ=255) ctcGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGc > 2:56444/1‑100 (MQ=255) cacGCATTACTTACCCGACGTGCAAAGAACTCCTTACTACT‑GTCTAGTCAATTCTGGACCAGGTAATGTTAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGc > 1:214927/3‑100 (MQ=255) tcGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACTTTACTACT‑GACCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCt < 2:511912/100‑1 (MQ=255) cGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTTGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCtt < 1:1439263/100‑1 (MQ=255) cGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCtt > 1:1142038/1‑100 (MQ=255) gCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTg > 1:1374872/1‑100 (MQ=255) aTTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTa < 2:595883/100‑1 (MQ=255) tACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTAtg < 1:837474/100‑1 (MQ=255) tACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTAtg > 2:1443985/1‑100 (MQ=255) gatctaCCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTAtg < 1:349716/95‑1 (MQ=255) cTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTAtgtg < 1:209310/100‑1 (MQ=255) gACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGc > 2:45858/1‑100 (MQ=255) aCCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTAtgagatc > 2:349718/1‑95 (MQ=255) aCCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGc < 1:2196248/99‑1 (MQ=255) cAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTAc < 2:766376/100‑1 (MQ=255) gACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTg > 1:1019301/1‑100 (MQ=255) cGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTgcg > 1:1054673/1‑100 (MQ=255) gggCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTgcgc > 2:60937/1‑100 (MQ=255) gCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCaa > 2:1398453/1‑100 (MQ=255) cAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCaaa > 2:142297/1‑100 (MQ=255) cAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCaaa > 1:1193731/1‑100 (MQ=255) cAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCGTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCaa > 2:1288169/1‑99 (MQ=255) aaGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCaaaaa > 2:2023481/1‑100 (MQ=255) gAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAg < 2:1675553/100‑1 (MQ=255) acacGTTACTAGT‑GTCCAGACTATGCTGGACCAGTTAATGCTAGGCCTGGTACCACTGCTGCTTACCTTTTCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAg < 1:1932692/98‑1 (MQ=255) cacGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTa > 2:1340134/1‑100 (MQ=255) ttACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAAccc < 2:1243699/100‑1 (MQ=255) ttACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAAccc > 2:86831/1‑100 (MQ=255) attaactggTCCAGAATAGTCTGGA‑CAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAAccc > 1:243767/9‑99 (MQ=37) actact‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGc < 1:1463520/100‑1 (MQ=255) ctact‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCt > 1:2188539/1‑100 (MQ=255) ctact‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCt > 1:899629/1‑100 (MQ=255) aactggTCCAGAATAGTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCt > 1:2102369/6‑100 (MQ=255) actggTCCAGAATAGTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCtg > 2:2204356/5‑100 (MQ=255) act‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCtgt < 1:56443/100‑1 (MQ=255) ctggTCCAGAATAGTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCtgt > 2:2003800/4‑100 (MQ=255) ct‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCtgtg > 2:236552/1‑100 (MQ=255) ct‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCtgtg > 2:2193857/1‑100 (MQ=255) ct‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCGTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCtgtg < 1:529875/100‑1 (MQ=255) tggTCCAGAATAGTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCtgtg > 2:225892/3‑100 (MQ=255) tggTCCAGAATAGTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCtgtg > 1:2231371/3‑100 (MQ=255) ggTCCAGAATAGTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTgg > 2:1166866/2‑100 (MQ=255) gTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGa > 1:648357/1‑100 (MQ=255) gTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGa > 2:1061911/1‑100 (MQ=255) gTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGCCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGa < 2:1740599/100‑1 (MQ=255) cAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGatca < 2:1461568/100‑1 (MQ=255) aGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGatcat < 1:1525384/100‑1 (MQ=255) aGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGatcat > 2:1310949/1‑100 (MQ=255) aGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGatcat < 2:1067295/100‑1 (MQ=255) aGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGatcat > 2:2242776/1‑100 (MQ=255) cTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGATCATCGt < 2:2400654/100‑1 (MQ=255) aTTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGATCATCGTTg < 1:1251782/100‑1 (MQ=255) aTTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGATCATCGTTg < 1:2483155/100‑1 (MQ=255) aTTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATCTGGCTGCTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGatcatctt > 1:719151/1‑96 (MQ=255) | GGGCATTGGTTAACAAGTGGACACATGTCAACATCCCGCTGGTTGTCTCTCGCATTACTGACCAGACGGGCAAAGAACACGTTACTACT‑GTCCAGACTATTCTGGACCAGTTAATGCCAGGCCTGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGATCATCGTTG > NC_000913/1904496‑1904693 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |